欢迎阅读2019年6月14日的研究综述,这是Broad研究所科学家及其合作者最近发表的研究的反复快照。
筛选微生物群落
微生物群落在生物技术,农业和医学中具有潜在的应用,但如果没有准确的方法来预测它们的相互作用和环境响应,那么当前的工程策略是有限的。在PNAS中,由Jared Kehe,Anthony Kulesa和核心研究所成员Paul Blainey领导的团队介绍了kChip,这是一个构建和测试微生物合成群落的平台,每天大约有100,000个社区。作为示范,该团队确定了一组促进模式植物共生体Herbaspirillum frisingense生长的细菌。 kChip平台可以帮助发现微生物聚生体,用于抑制病原体或降解用于生物燃料生产的材料,以及测试生态学的一般理论。
血细胞的诞生
称为红细胞生成的多步骤过程会产生红细胞,对这一过程的深入了解可以帮助我们更好地了解贫血并开发新的疗法。在本周的细胞报告中,Leif Ludwig,Caleb Lareau,医学和群体遗传学项目的成员Vijay Sankaran,核心研究所成员和Klarman Cell Observatory主任Aviv Regev以及同事绘制了阶段特定的转录状态和染色质可及性。人类红细胞生成。他们的分析表明阶段特异性转录因子活动,将疾病和特征的基因变异映射到调节区域,并将TMCC2鉴定为终末红细胞生成中的调节因子。这项工作是进一步照亮红细胞生成中遗传调节因子和相关疾病原因的有用资源。
分心偏转器
为了生存,人类和动物必须从环境中提取相关信号。由麦戈文研究所的Miho Nakajima和斯坦利精神病研究中心的成员Michael Halassa领导的神经元报告发现,大脑的前额皮质(PFC)通过一种新的基底神经节通路调节丘脑的感觉活动,这有助于在视觉之间进行选择。通过抑制分散注意力的方式来实现听觉刺激。新的PFC-GC-thalamus途径增强了感官辨别力,并用于以目标导向的方式抑制背景噪音。
微生物糖是IBD中的苦药
研究人员长期以来将肠道微生物组与炎症性肠病的变化联系起来,但推动这些联系的生物学尚不清楚。本周在PNAS,由马修·亨克,Chelsi Cassilly和哈佛大学高级副会员Jon Clardy领导的团队;和Douglas Kenny,Hera Vlamakis以及核心研究所成员和传染病和微生物组计划联合主任Ramnik Xavier在Broad上透露,其中一种肠道虫Ruminococcus gnavus会产生一种刺激克罗恩病免疫系统的多糖。之前的工作将R. gnavus与克罗恩的突发事件联系起来;这是第一项确定连接背后分子机制的研究。阅读更多新闻报道。
可以告诉人(细胞外)基质是什么
由分泌蛋白组成的细胞外基质(ECM)对于许多类型癌症的存活,生长和迁移至关重要。然而,关于ECM分泌中涉及的生物化学途径知之甚少。由Haoxin Li和核心研究所成员Stuart Schreiber(化学生物学和治疗科学计划)及其同事领导的团队使用计算方法寻找扰动破坏ECM分泌的基因。该小组在细胞化学生物学报告中证实,6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶是一种参与碳水化合物代谢的细胞酶,是ECM分泌所必需的必需成分,从而为特定的代谢途径提供新的见解。
一种新的自闭症模型,由CRISPR提供
自闭症和其他神经发育障碍的小鼠研究已经产生了在临床试验中进行过测试的候选药物;然而,没有一个成功。由斯坦利中心的研究员冯国平领导的美国/中国研究小组利用CRISPR基因组编辑工程设计猕猴,在一个名为SHANK3的基因中表达自闭症相关突变。他们在自然界中写道,工程猕猴表现出与自闭症谱系障碍相似的行为和神经模式。他们说,新模型可以帮助科学家为某些神经发育障碍开发更好的治疗方案。在麻省理工学院的新闻报道和频谱报道中了解更多信息。