“长江拥有独特的生态系统，是我国重要的生态宝库。当前和今后相当长一个时期，要把修复长江生态环境摆在压倒性位置，共抓大保护，不搞大开发”......三峡大坝、鄱阳湖、洞庭湖——这是近年长江流域生态环境问题的焦点。争论的两大问题是：三峡大坝对两湖（鄱阳湖和洞庭湖）到底有何生态影响？两湖该不该建闸？
一、气温、降水的长期变化，湖泊的演化
二、江湖水文关系
三、三峡工程对两湖水沙动态及江湖水文关系的影响
四、三峡工程对两湖的生态影响
五、大型通江湖泊中四大家鱼繁殖群体的变化
六、为何长江干流的渔业资源下降了80%？
主要结论
1）产漂流性卵鱼类（如四大家鱼）是长江中下游的优势鱼类，是季风气候下形成的东亚特有类群。雨季在长江中新生的幼鱼需借洪水泛滥进入湖泊肥育，成熟后再回到干流中繁殖，不能进入湖泊索饵的幼鱼很可能会因长江中饵料生物匮乏而死。因此，这些鱼类的生存与繁衍依赖于江湖之间的连通性与交换性。
2）三峡水库运用对洞庭湖荆南三口年径流量的影响有限，长江来水占洞庭湖径流量的比例高达30%。175ｍ试验性蓄水后，鄱阳湖的平均倒灌降至2.14 d，倒灌量仅1.46 X 108 m3，占鄱阳湖年径流量的比例仅0.1%！因此，根据江湖之间相互交换的水量来看，洞庭湖对长江产漂流性卵鱼类资源量的维持可能更为重要。
3）长江干流的渔业捕捞量从1954年的43万t下降到1980s的20万t，最后到2011年的8万t，降幅高达81%。而1950s以来，洞庭湖和鄱阳湖的渔产量并未如此，分别在2-4万t之间徘徊。
4）过去半个多世纪长江渔业资源的衰退主要是由江湖阻隔引起的，而过度捕捞也起到了推波助澜的作用。干流及两湖中的酷渔滥捕加速了产漂流性卵大型鱼类资源量的枯竭，这可能对干流渔业资源的衰竭影响更大。而两湖中渔业资源的稳定甚至上升一是得益于定居型鱼类对空缺生态位的填补，二是富营养化导致浮游生物的增加可能也有一定贡献。
5）20世纪50年代以来，长江渔业资源的大幅衰退不能归因于过度捕捞，因两湖的过度捕捞并未产生同样的后果。因此，即使在干流休渔十年，也未必能使长江的渔业资源大幅回升。
6）现在，两湖的渔业资源量与长江干流几乎持平，对长江干流渔业资源量的维持可能具有重要作用。同时，两湖也是江豚的重要栖息之地，湖泊中可供江豚享用的鱼类比长江中要多得多。如果在两湖建闸，将会切断它们与长江的生态联系，长江渔业资源的衰退将会进一步加剧，江豚可能更快地灭绝，可能还会出现其它物种的链式灭绝。
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