《9月9日_以色列科学家分析SARS-CoV-2的编码能力》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-09-16
  • 9月9日,魏兹曼科学研究所和以色列生物研究所的科研人员在Nature期刊上发表题为“The coding capacity of SARS-CoV-2”的文章。
    文章指出,为了了解SARS-CoV-2的致病性和抗原潜力,并开发治疗工具,必须描绘其蛋白表达的全部组成。SARS-CoV-2编码能力图目前基于计算预测,并依赖于与其他冠状病毒的同源性。由于冠状病毒的蛋白质阵列不同,尤其是辅助蛋白的种类不同,因此以一种无偏见和开放的方式表征SARS-CoV-2蛋白的特定集合至关重要。研究人员使用一套核糖体分析技术,展示了SARS-CoV-2编码区的高分辨率图,准确地量化了规范性病毒开放阅读框(ORF)的表达,并识别了23个未注释的病毒ORFs。这些ORFs包括可能发挥调节作用的上游ORFs(uORFs),存在于现有ORFs内的多个框架内部ORFs以及框架外部ORFs。研究人员表示,病毒mRNA的翻译效率并不比宿主mRNA高,由于病毒转录物水平较高,病毒翻译主导了宿主翻译。
    原文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2739-1

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2739-1
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    • 7月21日,Science期刊上发表题为“Distinct conformational states of SARS-CoV-2 spike protein”的文章。文章指出,控制SARS-CoV-2大流行迫切需要干预策略。三聚体病毒刺突(S)蛋白催化病毒与靶细胞膜之间的融合,以启动感染。文章中,研究人员报告了刺突蛋白的两种低温电磁结构,分别代表其融合前(2.9Å分辨率)和融合后(3.0Å分辨率)构象。融合前三聚体具有三个受体结合域,该结合域被邻近融合肽的片段所夹住。融合后结构被N-连接的聚糖修饰,表明可能对宿主免疫反应和恶劣的外部条件具有保护作用。这些发现提高了人们对SARS-CoV-2侵入机制的理解,并可能指导疫苗和疗法的开发。 原文链接: https://science.sciencemag.org/content/early/2020/07/20/science.abd4251?rss=1
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    • 编译者:zhangmin
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    • 英国埃塞克斯大学的研究人员9月28日在Scientific Reports期刊发表题为“Structural and functional modelling of SARS-CoV-2 entry in animal models”的文章。 文章称, COVID-19已蔓延至100多个国家,截至2020年7月26日,已感染1600万人。尽管迫切需要寻找有效的治疗方法,但由于缺乏合适的动物模型,SARS-CoV-2的研究受到影响。为了促进医学方法和新疗法的发展,研究人员比较了人类和动物模型(豚鼠、狗、猫、大鼠、兔、雪貂、小鼠、仓鼠和猕猴)中SARS-CoV-2 刺突蛋白的ACE2受体、TMPRSS2和弗林蛋白酶的使用情况。研究结果显示ACE2在刺突蛋白相互作用表面具有较高水平的序列变异性,这极大地影响了刺突蛋白的结合模式。使用分子对接模拟,研究人员比较了SARS-CoV和SARS-CoV-2 刺突蛋白与ACE2受体的复合物,发现SARS-CoV-2 刺突蛋白与人类ACE2的结合具有很高的特异性。相比之下,TMPRSS2和弗林蛋白酶在本次研究的宿主中非常相似,不会导致敏感性差异。计算分析表明,猕猴、雪貂和仓鼠是研究SARS-CoV-2 刺突蛋白与ACE2相互作用的抑制抗体和小分子最合适的模型。研究数据表明,TMPRSS2和弗林蛋白酶在物种间是相似的,表达人类ACE2的转基因动物模型,如hACE2转基因小鼠,也可能是研究病毒侵入的有用模型。 来源:https://www.nature.com/articles/s41598-020-72528-z