bioRxiv预印平台于2月27日发表了韩国化学技术研究院等发表的文章“Spike protein binding prediction with neutralizing antibodies of SARS-CoV-2”。
文章显示，2019年冠状病毒病(COVID-19)是由严重急性呼吸系统综合征2型冠状病毒(SARS-CoV-2，也称2019- ncov)引起的一种新型人类传染病。目前，研究人员正在尽最大努力寻找治疗COVID-19的有效药物。中和抗体，以一种抑制病毒进入细胞和基因组脱壳的方式与病毒衣壳结合，是针对病毒入侵的特异性防御。在研究中，该研究团队通过生物信息学的方法来识别能够与SARS-CoV-2 刺突蛋白结合并干扰病毒刺突蛋白与宿主受体相互作用的中和抗体。对刺突蛋白的序列分析发现，SARS-CoV-2 刺突蛋白的RBD区域与SARS-CoV及与SARS-CoV相关的bat病毒(btSARS-CoV)存在两大差异。插入区域接近与人类ACE2受体相互作用的残基。中和抗体的表位分析显示，SARS-CoV中和抗体使用构象表位,而MERS-CoV中和抗体使用常见的线性表位区域，这有助于在MERS-CoV蛋白质形成β-折叠结构并且在SARS-CoV-2 刺突蛋白上缺失。为了鉴定有效的SARS-CoV-2中和抗体，预测了中和抗体与SARS-CoV-2 刺突蛋白的结合亲和性，并通过抗体-抗原对接模拟进行了比较。结果表明，CR3022中和抗体与SARS-CoV-2 刺突蛋白的结合亲和力高于SARS-CoV刺突蛋白。该团队还发现F26G19和D12小鼠抗体可以高亲和力结合SARS-CoV 刺突蛋白。
*注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
