人类T淋巴病毒1（HTLV-1）是第一个公认的人类逆转录病毒。感染可导致两种主要症状：成人T细胞淋巴瘤/白血病（ATLL）和HTLV-1相关性脊髓病/热带痉挛性轻瘫（HAM / TSP）。每种表现都具有不同的特征，因为ATLL表现为白血病样疾病，而HAM / TSP表现为中枢神经系统的严重炎症，导致轻瘫。先前的研究已经鉴定出与疾病发展相关的分子，例如，Treg细胞中Foxp3的下调与HAM / TSP风险增加有关。此外，脑脊液中CXCL10，CXCL9和新蝶呤水平升高也增加了患病风险。但是，这些分子仅与特定的患者组或病毒株有关。此外，大多数研究并未共同比较所有临床表现，而可靠的分析则要求同时包括ATLL和HAM / TSP。样品数量少，也难以进行基因表达分析以鉴定特定的分子关系。为了解决这些局限性并增加表现特异性基因关联的功能，使用公开可用的基因表达数据进行了荟萃分析。监督学习技术的应用确定了观察到的两个基因的串联变化作为潜在的生物标记：GBP2与HAM / TSP相关，而CD40LG与ATLL相关。两种分子一起显示出高的样品分类准确性（AUC值分别为0.88和1.0）。接下来，鉴定了与这些基因相关的其他表达基因，我们试图将鉴定出的丰富途径与每种临床表现的特征联系起来。目前的发现有助于围绕病毒进展的知识，并为潜在的与HTLV相关疾病的分子分类提供了强大的新工具。
