• 快讯 克里克全球流感中心发布的2020-2021年流感季节的第三次报告

    来源专题:动植物疫病
    编译者:刘小燕
    发布时间:2021-03-22
    这是2020-2021年流感季节的第三次报告。截至第53/2020周,仅报告了整个WHO欧洲区域的415次流感检测: 50%的A型病毒,其中A(H3N2)胜过A(H1N1)pdm09,和50%的B型病毒,其中只有4种归因于血统,三种为B / Victoria,一种为B / Yamagata。与2019年同期相比,检测到的数量下降了98%,这可能是由于COVID-19大流行并且采取了应对措施。自2020年11月的特征报告以来,伦敦世卫组织合作中心,弗朗西斯·克里克全球流感中心(WIC)尚未收到来自欧盟/欧洲经济区(EU / EEA)国家的流感阳性标本。因此,本报告侧重于流感病毒的遗传特征。 12月在GISAID中存储的所有39个A(H1N1)pdm09 HA序列均来自2020年4月之前检测到的病毒,并属于6B.1A5A组。 6B.1A5A病毒继续进化,出现了两个亚组,命名为6B.1A5A + 187V / A,而6B.1A5A + 156K是抗原性不同的组代表。在检测到6B.1A5A + 156K病毒数量增加之后,这两个亚组目前正在以大致相等的比例传播。 最近传播的A(H3N2)病毒继续在进化枝3C.2a和3C.3a中下降,绝大多数进化枝3C.2a病毒属于3C.2a1b组,该病毒分为四个亚组,称为3C.2a1b + T131K -A、3C.2a1b + T131K-B、3C.2a1b + T135K-A和3C.2a1b + T135K-B。 尽管存在一些亚组交叉反应性,但在雪貂中产生的抗血清显示出高水平的进化枝/组特异性。 已建议将代表3C.2a1b + T135K-B亚组的病毒用于2020-2021年北半球和2021年南半球流感季节的流感疫苗。 在B / Victoria谱系的四个抗原性不同的病毒组中,12月份在GISAID中存放的所有序列均来自1A(?3)B亚型病毒,在HA1中具有三个氨基酸缺失。 四种收集日期分别为10月和11月的病毒都在法国发现,它们含有一系列HA1氨基酸取代,很可能会影响病毒的抗原特性。 已建议将代表1A(?3)B的病毒用于2020-2021年北半球和2021年南半球流感季节的流感疫苗。 12月(自11月报告以来)在GISAID中存放和/或释放了6个B / Yamagata谱系病毒的附加序列,但与整个2020年一样,它们的收集日期都在1月至3月之间。 与B / Phuket / 3073/2013样病毒相比,进化枝3具有至少两个HA氨基酸取代(HA1 L172Q和M251V),已推荐将其用于2020-2021年北半球和2021年南半球的四价流感疫苗季节。
  • 快讯 ACE2受体的遗传相似性可能使动物园大猩猩易受SARS-CoV-2侵害

    来源专题:动植物疫病
    编译者:刘小燕
    发布时间:2021-03-21
    1月11日,圣地亚哥动物园宣布其大猩猩部队成员的  SARS-CoV-2呈阳性,这是第一个已知的自然传播给大猿猴的实例。1月6日,两只大猩猩开始咳嗽。通过测试粪便样本证实了病毒的存在。大猩猩医生隶属于加州大学戴维斯分校戴维斯分校的兽医学院,负责监测非洲中部野生山地大猩猩的健康状况。大猩猩易感染其他人类呼吸道疾病,并且可能患有COVID-19。大猩猩当然是我们最亲密的亲戚之一,与人类有着许多遗传相似之处。一种特殊的相似性可能使它们容易感染COVID-19:编码血管紧张素转化酶2或ACE2的基因。ACE2是SARS-CoV-2(引起COVID-19的新型冠状病毒)的主要受体位点。在遍布鼻子,嘴巴和肺等部位的上皮细胞中发现了它。该病毒通过其表面的“尖峰蛋白”与ACE2结合,使其附着并进入细胞。人ACE2蛋白中25个氨基酸的序列对于这种结合的发生至关重要。 去年,由UC Davis博士后研究员Joana Damas和UC Davis杰出的进化与生态学教授Harris Lewin领导的国际研究团队发表了对410种动物,包括鸟类、鱼类、两栖动物和爬行动物。他们发现许多动物,包括大猩猩,在其ACE2受体上都与人类拥有相同的氨基酸,这很可能是它们容易受到SARS-CoV-2病毒的攻击的原因。在他们于2020年8月发表在《美国国家科学院院刊》上的工作中, 研究人员预测,每种新物种的ACE2氨基酸与人类的氨基酸差异越大,新型冠状病毒的感染风险就会降低。他们指出,尽管如此,该病毒可能利用其他物种的不同受体。 加州大学戴维斯分校兽医学院的Karen C. Drayer野生动物健康中心附属计划Gorilla Doctors称,野生大猩猩容易感染人类呼吸道疾病 。但是,根据大猩猩医生1月12日的博客文章,到目前为止,还没有证据表明野生大猩猩感染了SARS-CoV-2 。该组织将新的冠状病毒添加到了他们对动物健康的常规监测中,主要是通过粪便采样。 但是,感染COVID-19的风险不仅限于灵长类动物。在调查中被标记为高风险的其他一些动物包括海洋哺乳动物,例如灰鲸和宽吻海豚。根据ACE2的结合,发现家畜(如猫、牛和羊)具有中等风险,而狗、马和猪具有较低的风险。
  • 快讯 ECDC对Covid-19大流行作出的应变的策略和绩效分析

    来源专题:动植物疫病
    编译者:刘小燕
    发布时间:2021-03-21
    自今年年初以来,欧洲疾病预防和控制中心(以下简称ECDC)检测了与COVID-19相关的活动,并为其大多数关注COVID-19的人员创造了重要价值。 同时,ECDC也具有明显的潜力,符合其持续改进,并支持在欧洲可以对危机更有效地作出反应。基于相关人员反馈,ECDC 可以考虑:1.通过在具体情况下更加重视建议以此来调整以满足决策者的需求 ;2.通过提供前瞻性的建议在欧洲危机应对决策中扮演更重要的角色; 3.更系统地支持学习和成员国之间交流经验包括早期阶段的响应。 许多内部组织措施可以帮助实现这些改进。 这包括建立高级战略与委员会对话,牵头职能部门负责制定ECDC的战略议程。 这样的议程可以告知确定活动和传入请求的优先级以及分配人员和资源的标准和流程。 内部生产流程技术输出可以根据请求者的性质和需求进行区分,而专家网络通常可以参与解决共同关心的问题。 为了在响应中发挥更有效的作用,ECDC还需要增强其功能。ECDC在其传染病核心领域的专业知识是被深度认可的。 增强内部建模和预测功能具有明显的潜力。 为了进一步提高其分析和建议的有效性,获得更广泛的功能是有帮助的,包括行为科学、卫生经济学、政治学和与更广泛的公共卫生干预措施的社会背景相关的其他研究领域。
  • 快讯 与新的SARS-CoV-2变体在欧盟/欧洲经济区中传播相关的风险–首次更新

    来源专题:动植物疫病
    编译者:刘小燕
    发布时间:2021-03-21
    在全世界范围内,由于进化和适应过程,病毒通过SARS-CoV-2病毒的突变和变异不断变化。虽然大多数新出现的突变不会对病毒的传播产生重大影响,但某些突变或突变组合可能会为病毒提供选择性优势,例如增加的可传播性或逃避宿主免疫反应的能力。在此更新中,我们报告有关三种病毒变体(VOC 202012 / 01、501Y.V2和变体P.1)传播的新信息。这些变体被认为是令人关注的,因为突变已导致在它们最近被建立的地区增加了传播性并恶化了流行病学状况。 VOC 202012/01最初于2020年12月在英国南部被确认为关注的对象。VOC202012/01的最早识别样品可追溯至2020年9月。从那时起,它成为主要的样品。在英国流通的变体。自2020年12月下半以来,其可传播性显着提高,导致发病率、住院和医疗系统压力增加。英国已实施更严格的非药物干预措施(NPI)以减少传播。初步研究表明,没有证据表明VOC 202012/01与明显不同的感染严重性相关,或者与以前传播的病毒相比,它对某些年龄组的影响更大。然而,由于发病率上升,到2021年1月,英国报告了自大流行开始以来每日最高的COVID-19死亡率。 变体501Y.V2于2020年12月在南非首次发现,现在是最流行的变体。初步结果表明,该变体还可能具有更高的透射率。但是,对于VOC 202012/01,在此阶段尚不确定501Y.V2变体是否引起疾病严重性的变化。截至2021年1月19日,已在10个欧盟/欧洲经济区国家中识别出501Y.V2。目前正在法国研究这种变体的一个簇。除法国外,以色列和英国还报告了与旅行无关的501Y.V2病例或群。欧盟/欧洲经济区确定的其余案件大多与旅行有关,而不仅仅是南非。 迄今为止,仅在巴西发现了P.1变体,日本和韩国报道了来自巴西(主要来自亚马逊州)的旅行者。亚马孙州的首都马瑙斯(Manaus)目前正在经历COVID-19病例激增,给医疗保健系统带来巨大压力。 ECDC估计,由于其可传播性的提高,在EU / EEA中引入关注的变体并在社区中传播的可能性非常高。这种增加的可传播性可能导致感染数量的增加。反过来,这很可能导致所有年龄组的住院率和死亡率更高,尤其是对于那些年龄较大或有合并症的人。因此,需要更严格的NPI来减少传播并缓解医疗保健系统的压力。也因此,关注的变种的引入和社区传播相关的总体风险被评估为高/非常高。 会员国应继续监测当地传播率或感染严重性的变化,以识别和评估变种的传播和影响。为了检测出已知变体的引入以及新变体的出现,需要提高对社区COVID-19病例代表性样本的监测和测序水平。同时由于关注的新变量的可传播性增加,也应为自己的医疗系统做好准备,以进一步扩大需求。
  • 监测快报 动植物疫病简报

    来源专题:动植物疫病
    编译类型:快报,简报类产品
    发布时间:2021-03-23
    报道有关动植物疫情疫病防治方面的信息。