背景:由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的冠状病毒病2019(COVID-19)已成为对公共健康的全球威胁。为了构建有效的筛查模式,我们全面评估了RT-PCR和胸部CT诊断COVID-19的性能。方法:收集87例确诊的COVID-19病例和481例排除病例的人口统计学,RT-PCR和CT记录。分别评估了咽拭子RT-PCR,CT与第二次咽拭子RT-PCR或CT的诊断准确性。此外,还按时间绘制了所有粪便RT-PCR结果,以探讨粪便RT-PCR的价值。研究结果:RT-PCR与CT联合检测的敏感性(91.9%,79/86)高于RT-PCR单独检测(78.2%,68/87)或CT单独检测(66.7%,54/81)或两种RT-PCR联合检测(86.2%,75/87)。RT-PCR与CT符合良好(kappa值0.430)。在34例结果不一致的COVID-19病例中,有94.1%(n = 32)为轻度感染,其中62.5%(20/32)显示RT-PCR阳性。46.7%(35/75)COVID-19患者在治疗过程中至少有一次大便阳性。2例大便阳性早于咽拭子。重要的是,一名患者连续出现大便阳性但咽拭子阴性。结论:RT-PCR与CT联合检测COVID-19的敏感性最高。RT-PCR诊断轻度感染优于CT。粪便RT-PCR应作为提高发现率和出院率的一项指标。本研究为SARS-CoV-2感染的筛选和监测方案的优化提供了依据。