3月24日，bioRxiv预印本平台在线发表了来自英国布里斯托大学、英国公共卫生部、英国利物浦大学研究团队的题为“Characterisation of the transcriptome and proteome of SARS-CoV-2 using direct RNA sequencing and tandem mass spectrometry reveals evidence for a cell passage induced in-frame deletion in the spike glycoprotein that removes the furin-like cleavage site”的文章。
该文章指出，使用牛津纳米孔MinION进行的直接RNA测序表征了在Vero E6细胞中生长的SARS-CoV-2的转录组，该细胞系被广泛用于繁殖新型冠状病毒。使用ORF-centric pipeline分析病毒转录组。这揭示了病毒转录本（即亚基因组mRNA）的模式，通常适合冠状病毒的预测复制和转录模型。在编码刺突（S）糖蛋白的亚基因组mRNA中检测到24 nt框内缺失。在超过一半的定位转录本中发现了该特征，并预测该特征将从S糖蛋白上去除弗林蛋白酶切割位点。该基序在病毒进入或退出过程中将S糖蛋白的切割导向功能性亚基。S糖蛋白的切割可以成为人畜共患冠状病毒传播的障碍并影响病毒的致病性。与该转录组分析相关联，串联质谱用于鉴定500多种病毒肽和44种磷酸肽，涵盖几乎所有预计由SARS-CoV-2基因组编码的蛋白质，包括S缺失变体所特有的肽糖蛋白。检测S糖蛋白的弗林蛋白酶切割位点中明显的缺失，印证了这一点，即SARS-CoV-2蛋白的某些区域可能容易突变。该研究认为这样的变异可能导致不同程度的毒力、发病率和死亡率，并建议在研究中应仔细监测病毒基因组序列。
*注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
