E2包膜糖蛋白是针对丙型肝炎病毒（HCV）的人中和抗体反应的主要靶标，因此是疫苗和免疫治疗努力的主要焦点。有新兴的证据表明E2是一个高度复杂、动态蛋白质，蛋白质上的残基能够调节抗体识别、局部和全局E2稳定性和病毒逃逸。为了全面地映射这些决定簇，我们用一组16个人单克隆抗体（hmAbs）进行全面的E2丙氨酸扫描，产生了在E2蛋白（355个位置）上个别丙氨酸取代对抗体识别的影响的前所未有的数据集。跨抗体板的共享能量效应的分析确定了涉及抗体识别、局部和整体E2稳定性的E2残基的网络，以及整个E2蛋白的残基之间的预测接触。抗体结合热点残基的进一步分析确定了对于所有14种构象依赖性E2抗体及其子集的E2构象和识别所必需的残基组，以及当突变为丙氨酸时增强抗体识别的残基，提供了工程化E2疫苗免疫原的潜在途径。通过结合E2序列变异性，我们发现了许多E2多态性位点，其负责中和抗体结合的丧失。这些数据和分析提供了对E2的抗体识别的基本见解，突出了这种病毒包膜糖蛋白的动态和复杂性质，并且可以作为E2靶向疫苗和免疫治疗剂的开发和合理设计的参考。
