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《阅读障碍的大学生研究经验及在线数据库》

  • 来源专题：图书情报
  • 编译者： lixiaoyan
  • 发布时间：2018-12-09

  • 本文调查了阅读障碍的大学生搜索体验以及他们使用屏幕阅读软件浏览的在线数据库。参与者使用他们的屏幕阅读软件在三个不同的在线数据库中完成了一系列任务。屏幕录制软件提供了该过程的视频和音频文档。在研究前和研究后以及每次数据库搜索会话之后收集调查数据。本文提供了有关阅读障碍学生的信息搜寻行为见解，以及使用屏幕阅读软件浏览在线数据库时遇到的障碍。

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  • 《《全民阅读“十三五”时期发展规划》》
    • 来源专题：图书情报
    • 编译者：程冰
    • 发布时间：2017-01-22
    • 新华网北京12月27日电（记者 王志艳）十八届五中全会把“倡导全民阅读”、“推动国民素质和社会文明程度显著提高”列为“十三五”时期的重要工作。记者从国家新闻出版广电总局获悉，《全民阅读“十三五”时期发展规划》（以下简称《规划》）已于日前印发。这是我国制定的首个国家级“全民阅读”规划。 　　据悉，《规划》编制历时三年多时间，结合国家“十三五”规划纲要等要求，明确了全民阅读工作的指导思想、基本原则和主要目标，明确“十三五”时期的重点任务及时间表、路线图等，以进一步推动全民阅读工作常态化、规范化，共同建设书香社会。 　　以下为《规划》全文： 全民阅读“十三五”时期发展规划 　　为深入贯彻落实党中央、国务院关于开展全民阅读的重要部署，提升国民素质和社会文明程度，共同建设书香社会，根据《中共中央关于制定国民经济和社会发展第十三个五年规划的建议》《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》和《国家“十三五”时期文化改革发展规划纲要》，编制本规划。 　　序 言 　　阅读是人类获取知识、增长智慧的重要方式，是一个国家、一个民族精神发育、文明传承的重要途径。中华民族有着优良的读书传统，崇尚读书、诗书继世之风绵延数千年。 　　党的十八大以来，以习近平同志为核心的党中央高度重视全民阅读。2012年11月，党的十八大报告提出“开展全民阅读活动”。2014年以来，“倡导全民阅读”连续3年写入国务院政府工作报告。《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》要求“推动全民阅读”，并将全民阅读工程列为“十三五”时期文化重大工程之一，将全民阅读提升到国家战略高度。 　　“十三五”时期，是全面建成小康社会的决胜阶段，是实现“两个一百年”宏伟目标、实现中华民族伟大复兴中国梦的关键时期。在新的历史条件下，深入开展全民阅读对于提高公民的思想道德素质和科学文化素质，培育和践行社会主义核心价值观，传承中华优秀传统文化，满足人民群众日益增长的精神文化需求，都具有重大而深远的意义。 　 一、指导思想、基本原则和主要目标 　　（一）指导思想 　　高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观为指导，全面贯彻党的十八大和十八届三中、四中、五中、六中全会精神，深入贯彻习近平总书记系列重要讲话精神和治国理政新理念新思想新战略，紧紧围绕“五位一体”总体布局和“四个全面”战略布局，牢牢把握“两个巩固”根本任务，按照全面建成小康社会的总体要求，以满足人民群众精神文化需求为出发点和落脚点，完善体制机制，创新方式方法，将丰富阅读活动内容与提升思想文化内涵相结合，将出版精品与推荐精品相结合，将公益活动和市场推广相结合，将传统阅读与数字阅读相结合，将服务与管理相结合，全面提升全民阅读质量和水平，推动国民素质和社会文明程度显著提高，为实现“两个一百年”奋斗目标和中华民族伟大复兴中国梦提供强大的精神动力和文化支撑。 　　（二）基本原则 　　——坚持政府主导，社会参与。全民阅读功在当代、利在千秋。必须强化政府责任，完善机制，健全制度，加强宏观指导和政策推动。开展全民阅读，每个人既是参与者，也是推动者。必须充分调动社会各界的积极性、主动性和创造性，鼓励、动员和引导社会力量共同参与，加强理念创新、制度创新、方式创新，推动全民阅读长期深入开展。 　　——坚持重在内容，提升质量。全民阅读的核心是阅读内容。必须加强优秀作品的创作生产，进一步完善创作出版扶持和激励机制，加强对精品力作的宣传推广，拓宽传播渠道，为全民阅读提供更多优质阅读内容，充分发挥引领示范作用，不断提升全民阅读的质量和水平。加强对数字化阅读的规范和引导，推动传统阅读和数字阅读相融合。 　　——坚持少儿优先，保障重点。少儿阅读是全民阅读的基础。必须将保障和促进少年儿童阅读作为全民阅读工作的重点，从小培育阅读兴趣、阅读习惯、阅读能力。要着力保障农村留守儿童、城市流动儿童和贫困家庭儿童的基本阅读需求。要着力保障残疾人、进城务工人员等困难群体、特殊群体的基本阅读需求。 　　——坚持公益普惠，深入基层。全民阅读具有典型的公益性。必须加快推进全民阅读推广服务体系城乡一体化建设，坚持公益性、基本性、均等性和便利性相统一，面向基层、面向群众，保障全民平等享有基本阅读权益。 　　（三）主要目标 　　本规划期限为2016年到2020年。主要目标是：各类全民阅读活动蓬勃开展，全民阅读氛围更加浓厚，全民阅读理念更加深入人心，优质阅读内容供给能力显著提升，全民阅读基础设施建设更加完善，阅读推广人队伍更加壮大，各类阅读推广机构不断涌现，全民阅读法制化建设取得积极进展，全民阅读工作体制机制更加健全，基本形成与全面建成小康社会发展要求相适应的以人为本、面向基层、惠及群众、兼顾重点的全民阅读推广服务体系，推动国民素质和社会文明程度显著提高。 　 二、重点任务 　　（一）举办重大全民阅读活动 开展全国范围的“书香中国”系列活动，动员各方力量，加强品牌建设，办好各类读书节、读书周、读书月、读书季等全民阅读活动，提升群众参与度、平台辐射面和品牌号召力。 　　在世界读书日、“六一”儿童节及其他重要节庆期间开展内容丰富、形式多样的全民阅读活动，各级领导干部带头参加，引领示范，不断扩大全民阅读的社会影响力。 　　围绕党和国家工作大局和重大节庆活动，组织开展主题演讲、经典诵读、读书征文、知识竞赛等丰富多彩的主题阅读活动，弘扬主旋律、传播正能量。 　　办好全国书博会、书展、书市等各种行业展会，通过论坛讲座、评书荐书、名家签售等人民群众喜闻乐见的形式，将之打造成为连接作者、读者、出版者和书店、媒体的阅读桥梁，充分发挥其推动全民阅读的功能和作用。 　　专栏1 全民阅读品牌活动 　　（一）“书香中国”系列活动 　　打造“书香中国”系列活动品牌，培育和巩固“书香中国·北京阅读季”、“书香江苏”、“书香荆楚·文化湖北”、“书香中国·上海周”、“书香岭南”、“书香湖南”、“书香八闽”、“书香辽宁”、“书香龙江”、“海南书香节”、“书香八桂”、“书香燕赵”、“书香赣鄱”、“三秦书月”、“书香安徽阅读季”、“书香天府”、“书香齐鲁”、“书香陇原”、“书香天津”、“书香天山”、“书香宁夏”、“书香青海”以及“深圳读书月”、“苏州读书节”等全国各地书香活动品牌。到2020年，所有省（自治区、直辖市）、计划单列市、地级市都有品牌活动，80%以上的县（区）有品牌活动。 　　（二）举办主题读书活动 　　结合传承和弘扬中华优秀传统文化、加强中国特色社会主义和中国梦宣传教育、弘扬社会主义核心价值观、民族团结进步、迎接党的十九大召开、庆祝建军90周年、纪念改革开放40周年、新中国成立70周年、全面建成小康社会、中国共产党成立100周年等重大主题，广泛开展各类主题读书活动。 　　（三）行业展会服务全民阅读 　　充分发挥全国图书交易博览会、北京国际图书博览会等行业展会推广全民阅读的重要功能，举办“读者大会”等全民阅读活动。 　 （二）加强优质阅读内容供给 　　完善创作出版扶持引导机制，引导广大作者和出版者自觉践行社会主义核心价值观，传承和弘扬中华优秀传统文化。发挥国家出版基金的积极作用，实施重大出版工程等，出版更多在文化传承上有新的突破、学术水平上有新的超越的精品力作。充分发挥“五个一工程”奖、中国出版政府奖、中华优秀出版物奖等奖项的导向作用。 　　进一步完善针对不同读者群体的优秀出版物推荐机制，提升推荐出版物的权威性和影响力。坚持价值导向、专家意见、市场表现、群众口碑、质量标准相统一的原则，向读者推荐更多思想精深、艺术精湛、制作精良的优秀出版物。继续开展面向青少年、老年人、少数民族等不同群体的优秀出版物推荐活动，推动精品出版物宣传推介常态化、制度化。加强和改进书评机制，加强图书评论工作，加强对各类图书排行榜的引导和管理。 　　 专栏2 全民阅读优质内容建设工程 　　（一）重点出版物出版工程 　　“十三五”时期推出重点主题出版物、重大出版工程、文艺原创精品、未成年人出版物、少数民族文字出版物、古籍、辞书、社会科学与人文科学出版物、自然科学与工程技术出版物等3000种左右。 　　（二）优秀出版物推荐工程 　　进一步完善推荐机制，做好“中国好书”、“向全国青少年推荐百种优秀出版物”、“优秀老年人出版物”、“大众喜爱的50种图书”、“优秀民族图书”、“中华优秀传统文化普及图书”、“优秀少儿报刊”、“精品文学期刊”、“优秀网络文学原创作品”等推荐工作。 　　（三）推动全民阅读深入基层、深入群众 　　大力推进全民阅读进农村、进社区、进家庭、进学校、进机关、进企业、进军营，使阅读活动真正深入基层、深入群众。倡导党员干部带头读书，建立和完善党员干部读书学习制度，激发广大党员干部读书学习的热情，带领本单位、本系统、本地区大兴读书之风。倡导在高校大学生和中青年人群中建立读书会，开展读书活动。充分利用农家书屋、社区书屋、职工书屋等各类阅读设施，开展各种形式的基层读书活动。开展书香军营活动，服务强军建设。完善“书香之家”、“书香之乡（镇、街道）”等的推荐机制，发挥典型榜样的引领示范作用，展现基层群众的读书传统和读书风采。 　　强化公益性文化单位在全民阅读工作中的重要作用，文化馆（站）、公共图书馆、科技馆、工人文化宫、青少年宫、妇女儿童活动中心等各级公益性文化单位要常年开展主题读书活动、荐书送书活动、读书交流会等。鼓励政府机关、社会组织和企事业单位开展公益性阅读活动。实施市民阅读发放计划。完善全民阅读示范单位、先进个人和优秀项目推荐机制。 　　 专栏3 全民阅读“七进”工程 　　（一）“书香之家”、“书香之村（社区）”、“书香之乡（镇、街道）”、书香企业、书香机关推荐活动 　　“十三五”期间推荐3000家“书香之家”、500个“书香之村（社区）”、200个“书香之乡（镇、街道）”、1000个“书香企业”、500个“书香机关”，向全社会展现基层群众读书风采，引领阅读风尚。 　　（二）开展“书香中国·全民阅读大讲堂”、“强素质·作表率”读书讲坛 　　邀请文化名家、社会名人深入群众，引导党员干部和群众认真读书学习、开阔文化视野、全面增强素质，有效推动学习型党组织建设、学习型社会建设。 　　（三）“书香军营”系列活动 　　组织一批文化界、艺术界的名家大家深入基层部队，举办“书香军营”讲坛，并广泛开展“主题读书日”、“月读一书”、“名家荐书”、“军营读书节”等活动，营造浓厚的军营阅读氛围。 　　（四）大力促进少年儿童阅读 　　大力倡导家庭阅读、亲子阅读，发挥父母和未成年人监护人言传身教的重要作用，推动全社会共同创造、维护少年儿童良好阅读环境。鼓励幼儿园开展与学龄前儿童的年龄和心理状况相适应的阅读活动，着力培养阅读兴趣、阅读习惯。 　　加强中小学书香校园文化建设，完善中小学图书馆等校园阅读设施，开展多种形式的校园阅读活动。充分利用少年儿童图书馆、农家书屋、职工书屋、社区书屋、基层综合性文化服务中心以及青少年活动中心、少年宫等青少年活动场所，支持和帮助中小学生参加校外阅读活动，开展少儿阅读推广活动。 　　加强对少儿阅读规律的研究和运用，科学研究不同年龄、不同群体、不同性别少年儿童的智力、心理、认知能力和特点，借鉴国外阅读能力测试、分级阅读等科学方法，探索建立中国儿童阶梯阅读体系，加快提高我国少年儿童的整体阅读水平。 　　重点保障农村留守儿童、城市流动儿童、贫困家庭儿童等儿童群体的基本阅读需求。鼓励学校、全民阅读设施管理单位、阅读推广人及阅读推广机构等对其进行定期阅读指导和服务。将本行政区域内的外来务工人员随居子女纳入当地全民阅读服务保障范围。有条件的地方可以积极探索开展农村地区学龄前儿童基础阅读促进工作。 　　专栏4 少年儿童阅读工程 　　（一）家庭阅读·亲子阅读工程 　　开展丰富多彩、喜闻乐见的亲子阅读活动，通过推荐优秀读物、开展阅读指导、开展爱心捐赠、阅读推广展示等，传递家庭教育科学理念，引领亲子阅读风尚，营造书香氛围，培育良好家风，促进儿童健康成长。 　　（二）少儿阶梯阅读推广 　　建立符合中国儿童特点的阶梯阅读体系，开展我国少儿阶梯阅读工程的研发及推广应用工作。开展我国少儿阅读能力测试项目的研发工作，建设少儿阅读能力监测体系，科学推动整体提高少儿阅读能力。 　　（三）“书香校园”建设 　　通过创造浓郁的阅读氛围，整合丰富的阅读资源，开展多彩的读书活动，让阅读成为师生最日常的生活方式，进而推动书香校园的形成。 　　（四）“少儿报刊阅读季”活动 　　广泛开展各种内容丰富、形式多样的少儿报刊阅读活动，充分利用“4·23世界读书日”、“六一”国际儿童节等重要时间节点，开展组织捐赠优秀少儿报刊、“好报刊伴我成长”等专题宣传推广活动。 　 （五）保障困难群体、特殊群体的基本阅读需求 　　切实加强针对残障人士、外来务工人员、贫困地区居民等困难群体、特殊群体的阅读服务，保障其基本阅读需求。加快将进城务工人员阅读服务纳入常住地全民阅读服务体系，鼓励以社会文化机构、用工企业等为主体，满足进城务工人员的基本阅读需求，继续扩大“书香中国e阅读”工程的覆盖范围。 　　鼓励全民阅读设施管理单位及阅读推广人等进行定期阅读指导和服务，有针对性地向残疾人提供盲文出版物、有声读物等阅读资源、设施与服务。各类全民阅读设施应加强无障碍设施建设。建立和完善社会各界为特殊群体、困难群体开展志愿者助读、发放购书券、组织出版物捐赠等捐助和服务的渠道。 　　专栏5 重点群体阅读促进工程 　　（一）盲文出版物出版与阅读推广工程 　　加强盲文出版基地建设，实施盲文出版工程，支持有声读物开发，扩大各类盲人读物有效供给，完善盲文出版物、有声出版物邮寄借阅平台，推动各级图书馆开设视障阅览室，面向视力障碍人群，提供阅读服务。 　　（二）“书香中国e阅读”推广工程 　　以政府购买服务的方式，定期向全国进城务工人员、边疆民族地区手机用户推送国家新闻出版广电总局组织推荐的各类优秀图书、报刊等。2016年覆盖人群1000万人，到2020年覆盖5000万人。 　　（六）完善全民阅读基础设施和服务体系 　　统筹规划，合理布局，进一步加大城乡基层全民阅读设施建设力度。制定和完善公共图书馆、基层综合性文化服务中心、农家书屋等公共文化服务设施建设标准和资源配置标准，推进全民阅读公共文化设施建设的规范化、标准化。 　　加快促进城乡基本公共文化服务均等化，实现农村、城市社区公共文化服务资源整合和互联互通，以创新管理机制、提升服务效能为重点，探索长效管理机制。充分发挥各级各类图书馆在阅读推广中的重要作用。加强出版物发行网点建设，特别是农村和社区网点建设，支持实体书店、书报亭、高校书店等各类阅读设施的发展，发挥其促进全民阅读的公益功能。在充分利用现有设施基础上，统筹建设社区阅读中心、数字农家书屋、公共数字阅读终端等设施。 　　 专栏6 全民阅读设施建设重点工程 　　（一）农家书屋提升工程 　　建立健全农家书屋管理员队伍，完善出版物补充机制，加大少年儿童出版物配备比例，推动数字（卫星）农家书屋建设，推动农家书屋和基层图书馆、基层综合性文化服务中心资源整合，培育“我的书屋·我的梦”农村少年儿童阅读活动品牌，更好发挥农家书屋作为农村阅读活动和阅读服务主阵地的作用。 　　（二）支持实体书店发展 　　坚持改革创新，发挥市场作用，加强政府引导，注重统筹协调，推动实体书店与社会经济协调发展，到2020年，基本形成布局合理、功能完善、主业突出、多元经营的实体书店发展格局。 　　（三）城乡阅报栏（屏）建设工程 　　在车站、商场、广场、社区、学校、医院等人流密集地点新增建设一批阅报栏（屏）和全民阅读数字触摸屏，完善数字阅读屏维护更新机制。 　　（七）提高数字化阅读的质量和水平 　　适应数字化新趋势，充分利用数字技术，大力推进数字化阅读发展，建立全民阅读数字资源平台，推进数字化阅读服务。建立内容丰富的数字阅读资源库群，加强公共电子阅览室建设计划和全国文化信息资源共享工程网络建设，加强数字图书馆建设。形成覆盖全国的全民阅读数字服务网络。 　　加快推进传统出版单位数字化转型升级，通过制订配套政策、专项资金资助、推介示范单位等多种方式，推动出版与科技融合发展。实施网络文艺精品创作和传播计划，加强网络文学出版传播的管理和引导，推出更多网络原创精品力作。加强数字出版内容投送平台建设和管理，改善数字出版内容消费服务方式，提升公众数字阅读消费满意度。深入探索读者阅读行为和阅读习惯的数字化转型，提供更便捷、人性化的数字化阅读技术服务，全面推进全民阅读的多媒体、多平台融合。 　　专栏7 数字化阅读建设重点工程 　　（一）全民数字化阅读推广工程 　　组织开展系列专题数字化阅读活动，大力提升全民数字化阅读率；支持建设一批数字化阅读服务平台，助力全民阅读普及，提升数字出版在公共文化服务体系建设中的支撑能力。 　　（二）国家全民阅读数字化平台建设 　　建设3至4家国家级公益性数字化阅读推广、优质阅读内容数字化传播、移动阅读数字化传播平台，与各类图书馆、农家书屋等终端联网，向读者提供数字化阅读服务。 　　（三）网络文学精品出版工程 　　用3至5年时间，使创作导向更加健康，创作质量明显提升，推出一批思想精深、艺术精湛、制作精良、深受群众喜爱的原创网络文学精品，在网络内容建设和文艺创新中的作用更加突出。 　　（八）组织引导社会各方力量共同参与 　　鼓励和吸引社会力量建设全民阅读公共设施、提供全民阅读服务。充分发挥热心阅读推广的社会名人、文化名家的阅读引领作用。鼓励和支持公务员、教师、新闻出版工作者、大学生等加入阅读推广人队伍，定期培训，提升阅读推广人队伍的整体素质和服务能力。鼓励和支持文化团体、教育机构和其他社会组织开展阅读推广并提供公益阅读服务。成立各级全民阅读促进协会。鼓励和支持高等院校和科研单位进行阅读研究，鼓励从跨学科的角度研究阅读理论，创新研究方法，加强阅读学学科建设，促进全民阅读工作的开展。 　　专栏8 社会力量参与机制 　　（一）建立阅读推广人队伍 　　制定阅读推广人培养方案及管理办法，建立基层全民阅读工作者队伍培训机制，对全国各级全民阅读工作人员、图书馆馆员、农家书屋管理员、阅读推广人等进行系统培训，提高全民阅读推广能力，支持开展各类基层读书活动。 　　（二）培育阅读推广机构 　　充分发挥各类绘本馆、阅读空间、读书会等的重要作用，提升阅读推广专业性、阅读服务规范性，培育一批在社会上具有广泛影响力的阅读推广机构。 　　（三）成立全民阅读促进协会 　　汇聚相关部门、群团组织、阅读推广机构、出版发行单位、公共图书馆、基层阅读组织、知名作家学者以及其他热心全民阅读推广的社会人士，组建各级全民阅读促进协会，开展全民阅读推广工作。到2020年，全国所有省（自治区、直辖市）都应成立全民阅读促进协会，50%的地级市应成立全民阅读促进协会。 　　（九）加强全民阅读宣传推广 　　重视和发挥中央媒体和地方媒体、传统媒体和新兴媒体、主流媒体和各类媒体的重要作用，形成强大宣传合力，营造全民阅读的良好氛围。进一步做好理念创新、手段创新、载体创新，把创新的重心放在基层一线，从围绕相关节庆、重点事件报道向常态化、持续化发展，从书评、书摘、书讯等传统栏目向典型报道、深度报道、专题报道、系列报道扩展，从报刊读书栏目、广播电视读书节目向公益广告、户外传媒、新媒体等全媒介多元化发展。 　　鼓励和支持各类媒体、组织全民阅读媒体联盟和全民阅读百网联盟成员单位深入街道、社区和乡镇、农村等基层，抓取第一手新闻素材，把鲜活读书故事、先进读书人物传递给广大读者。要充分发挥正面宣传鼓舞人、激励人的作用，多宣传读书陶冶情操、读书改变命运、读书成就人生等感人故事，让全民阅读理念春风化雨，润物无声。 　　专栏9 全民阅读宣传推广 　　（一）全民阅读媒体联盟和全民阅读百网联盟 　　充分发挥各类媒体的特点，适应分众化、差异化传播趋势，实现传统宣传推广形式与新媒体宣传推广形式深度融合，以全民阅读官方网站和全民阅读工作网站为平台和纽带，利用官方微博、微信公众号和新闻客户端“两微一端”，资源共享、信息互通、资讯互联，形成合力，共同向广大读者宣传推广全民阅读。 　　（二）书香中国万里行 　　组织全民阅读媒体联盟、全民阅读百网联盟成员单位深入街道、社区和乡镇、农村等基层，宣传报道全民阅读先进典型和感人事迹，营造开展全民阅读的良好氛围。 　 三、加强组织领导和统筹实施 　　加强全民阅读工作的组织领导和统筹协调，建立相关部门共同参与的协商推进机制，形成合力，共同承担全民阅读工作的职责。加强全民阅读法制建设，制订发布《全民阅读促进条例》，鼓励和推动地方开展全民阅读立法工作。 　　建立书香社会指标体系，定期评估和发布。鼓励将全民阅读指数纳入社会发展指标体系，纳入创建文明城市指标体系，将工作情况纳入目标管理和考核体系。 　　专栏10 全民阅读长效机制建设工程 　　（一）制订《全民阅读促进条例》 　　将全民阅读纳入法制化轨道，规范政府责任，保障公民基本阅读权利，促进全民阅读服务体系建设。推动地方全民阅读立法工作。到2020年，推动全国所有省（自治区、直辖市）出台本地的全民阅读地方性法规、地方政府规章及政策性文件等。 　　（二）建立全民阅读指导委员会 　　建立国家全民阅读指导委员会和地方各级全民阅读指导委员会，形成各部门综合协调机制，共同研究全民阅读工作中的重大问题，制订全民阅读公共服务基本标准，协调全民阅读基础设施建设与资源配置，促进阅读相关机构和组织合作。 　　（三）书香社会指标体系 　　定期开展全国国民阅读调查，建设全民阅读监测体系，监测全民阅读发展水平、阅读服务公众满意度、阅读服务标准实现程度；对全民阅读活动、工程效果进行第三方测评，收集群众反馈意见，对活动进行科学评估。
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  • 《泛基因组数据库：找到油菜的“好基因”》
    • 来源专题：转基因生物新品种培育
    • 编译者：王晶静
    • 发布时间：2020-11-28
    • 油菜是世界第二大油料作物，也是我国最重要的油料作物之一。今年初，华中农业大学一支科研队伍公布了8个甘蓝型油菜的高质量参考基因组。近日，他们在原有研究基础上，通过整合1689份油菜的基因组及重测序数据，构建了首个油菜泛基因组和比较基因组生物信息平台BnPIR。 有了这一平台，研究人员可以更快捷、更方便地检索和使用油菜泛基因组相关资源。为何建设油菜泛基因组平台？这是一个什么样的数据库？油菜相关的多组学数据研究进展情况如何？《中国科学报》对此进行了采访。 “标准地图”有盲区 甘蓝型油菜大约在7500年前由白菜和甘蓝自然杂交形成，是非常“年轻”的多倍体植物。“多倍体物种，尤其是年轻的多倍体植物中，往往存在大量的非同源染色体重组事件，这些重组事件导致甘蓝型油菜内部的遗传变异非常丰富。”华中农业大学生物信息团队副教授杨庆勇说。 而在过去的几十年里，为了提高油菜的产量、品质及适应性等目标性状，国内外油菜遗传育种科学家持续地将白菜、芥菜等种质资源中控制重要性状（如抗性等）的遗传位点，通过杂交或者远缘杂交等手段导入到甘蓝型油菜中，进一步丰富了其物种的遗传多样性。“现有的研究数据表明，甘蓝型油菜基因组中7成以上基因都存在大的遗传变异，也就是通常所说的结构变异。换句话说，对于油菜这样的年轻多倍体物种，单一参考基因组往往无法很好地包含物种内丰富的遗传变异信息。”杨庆勇进一步解释道。 如何系统挖掘和揭示甘蓝型油菜的遗传变异？ 杨庆勇介绍，传统的遗传变异检测手段主要通过基因组重测序，然后将重测序的读段比对到参考基因组，可以称之为“按图索异”。这里的图是指参考基因组（参考基因组作为生命科学研究中的“标准地图”），而我们目前使用的“标准地图”（单一参考基因组）仍然存在大量的“暗区和盲区”。单一参考基因组为重要性状相关遗传位点和基因的挖掘与利用设置了重重障碍。为了克服这些困难，科学家提出了通过整合多个代表性种质资源的基因组信息，构建泛基因组的研究思路和策略。 首个油菜泛基因组 甘蓝型油菜是研究植物多倍化和进化的模式物种。遗憾的是，甘蓝型油菜一直缺乏专门的基因组数据库，研究人员不得不借助芸薹属数据库（BRAD）和其他公共数据库（Genoscope和Ensembl等）来获取甘蓝型油菜的基因组数据。“这些数据库是基于单一品种基因组和注释，并且缺乏多组学数据和群体变异信息。” 华中农业大学生物信息团队教授陈玲玲说。 据介绍，整合多种个体的泛基因组可以更加全面的检测物种内部的遗传变异，获得各个样本的共有和特有的基因集，结合不同样本的表型差异可以为进一步挖掘重要的农艺性状基因提供基础。 2020年1月，华中农业大学油菜团队与生物信息团队合作，在《自然—植物》上发布了8个甘蓝型油菜种质基因组序列，并通过比较基因组分析鉴定了大量SNPs（单碱基多态性）、PAVs（存在/缺失变异）等变异，构建了大小约为1.8Gb泛基因组，包含约15万个基因。通过基于PAVs的全基因组关联分析直接鉴定到了与角果长度、种子重量和开花时间相关的结构变异。研究发现，多个FLC基因上的PAVs与开花时间和生态型分化紧密相关。 华中农业大学油菜团队教授刘克德介绍，该研究为进一步解析甘蓝型油菜的基因组结构和加速遗传改良提供了资源，泛基因组的建立对鉴定与重要农艺性状关联的结构变异有重要意义。为了让油菜遗传育种研究人员能够快捷、方便地检索和使用油菜泛基因组相关资源，研究人员进一步结合1689份油菜的基因组及重测序数据，构建了甘蓝型油菜泛基因组数据库BnPIR。相关论文10月17日在线发表于《植物生物技术杂志》。 泛基因组数据库BnPIR 杨庆勇介绍，BnPIR是基于基因信息模块的综合平台，以泛基因组浏览器和多基因组共线性为核心，包含多组学数据和常见的生物信息学工具。BnPIR包含基因组序列、基因注释、系统发育关系、表达数据、PAVs 信息、基因分类，品种信息和常用多组学工具，并提供快速搜索和可视化的集成。BnPIR为油菜分子生物学和育种提供丰富资源，有助于油菜研究人员在泛基因组背景下搜索和可视化其结果，并为其他物种的泛基因组分析提供有价值的模板和平台。同时，研究人员也指出，“目前我们用于构建泛基因组的代表性油菜品系仅9个，未来将收集、组装和收集更多代表性油菜品系的基因组及其变异信息，整合到BnPIR泛基因组数据库中。”此外，除了主要聚焦在检索变异层面的BnPIR，现在他们还已完成了基于图形结构泛基因组的构建，并应用这个新构建的泛基因组进行全基因组关联分析及进化分析等研究工作。 当前，我国科学家在十字花科作物育种领域发表外文论文总量排名世界第一，并且产生了大量优良的遗传材料，以及基因组、转录组和代谢组等多组学数据。如何实现多组学数据复用和共享，将数据转化成知识、专利、品种及生产力，一直是科研人员思考和努力的方向。“泛基因组数据库仅仅是个开端，目前我们与国内的多个油菜研究团队合作，已经完成了油菜泛转录组数据库的构建，很快就会与大家见面。油菜代谢组数据库相关构建工作也已开展。”华中农业大学油菜团队教授郭亮说。华中农大的研究人员希望，未来通过与国内油菜科学家更加紧密的交流与合作，为油菜遗传育种提供更加系统全面、准确高效和友好的数据库和生物信息平台服务工作。 相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41477-019-0577-7；https://doi.org/10.1111/pbi.13491
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