微生物群落在沿海盐沼中营养物质的生物地球化学中起着至关重要的作用，最终控制水质、营养循环和解毒作用。我们确定了来自美国路易斯安那州巴拉塔里亚湾北部的沿海盐沼沉积物中的微生物种群的结构，以深入了解2010年深海地平井井喷事故两年后的Macondo石油对生物地球化学循环的影响。针对特定功能基因的定量PCR显示，受到污染的沼泽地在大量的固氮菌、反硝化菌、硝酸盐还原剂与氨，甲烷菌，硫酸盐还原剂和厌氧芳香族降解剂以及含有升高数量的烷烃降解剂的种群中大大减少。 依诺米那16S rRNA基因测序表明，润滑油大大改变了微生物群落的结构以及降低了显着的多样性。石油驱动的变化也表明在两个功能群体，即反硝化和硫酸盐还原原核生物的结构中，分别使用nirS和dsrB作为生物标志物。总的来说，16S rRNA和功能基因的结果表明，润滑油不仅显着改变了微生物群落结构，而且还显示了参与（或调节）盐沼中许多重要的营养生物地球化学循环的种群的大小和结构。诸如此类的改变与生态服务的潜在恶化有关，并且需要进一步的研究来评估油污盐渍沉积物中微生物介导的生态系统功能在一段时间内的恢复轨迹。
