《重磅!晶体结构如何预测?这篇Nature简单3张图给出答案!》

  • 来源专题:先进材料
  • 编译者: 李丹
  • 发布时间:2023-11-12
  • 来自材料牛

    【导读】

    据统计,有超过200000种晶体结构已知并作为原子位置列表保存在精选数据库中。了解结构可以准确预测稳定性,在许多情况下还可以预测特性。然而,当考虑以前未报告的组合物而不限制采用数据库中包含的结构时,该结构是未知的,必须对其进行预测以允许评估其稳定性和特性。晶体结构预测(CSP)的核心特征是,它从没有关于晶胞中原子位置的信息开始,旨在找到它们的确切排列。为了预测热力学稳定的化合物,询问给定组合物是否存在晶体结构,其能量低于给定阈值。多年来,CSP方法已经付出了巨大的努力,旨在快速识别低能耗结构。然而,一种形式化的算法,正如丘奇-图灵论文所假设的那样,不仅应该能够识别这样的结构,而且如果无法达到目标能量,也应该提供不存在的证据。找到解决方案和证明其最优性之间的区别在数学中很明显,在数学中,猜想的确认可能需要几十年甚至几个世纪,关于最密集的球体填料及其在高维中的推广直到最近才建立,捕捉这种区别的正式陈述可能是计算机科学中最重要的开放问题。到目前为止,还没有用于扩展无机固体CSP的方法可以在未知原子位置的连续空间中提供能量最优性保证。因此,尚未提出此问题的正式算法。研究人员已经开发出有效的启发式方法来识别势能表面的结构最小值,虽然这些方法原则上通常可以识别所有结构,但不能保证找到最低的能量结构。

    【成果掠影】

    在此,英国利物浦大学Matthew J. Rosseinsky教授和Paul Spirakis教授(共同通讯作者)通过结合组合和连续优化来查找晶胞内所有未知原子位置的算法,从而在能量保证下预测晶体材料的结构。作者将找到晶格上所有原子的最低能量周期分配的组合任务编码为整数规划的数学优化问题,从而能够使用完善的算法保证识别全局最优值。随后对产生的原子分配进行一次局部最小化,然后直接达到关键无机材料的正确结构,在明确的假设下证明它们的能量最优性。这种晶体结构预测的公式建立了与算法理论的联系,并提供了观测或预测材料的绝对能量状态。它为启发式或数据驱动的结构预测方法提供了基本事实,并且唯一适用于量子退火器,为克服原子混淆的组合爆炸开辟了一条道路。

    相关研究成果以“Optimality guarantees for crystal structure prediction”为题发表在Nature上。


    【核心创新点】

    1.作者开发了组合和连续优化来查找晶胞内所有未知原子位置的算法,从而在能量保证下预测晶体材料的结构;

    2.这种晶体结构预测的公式建立了与算法理论的联系,并提供了观测或预测材料的绝对能量状态。

    【成果启示】

    综上所述,本文找到最低能量周期性晶格原子分配的搜索例程可用于预测晶体结构,并进行随后的局部最小化。这种搜索的整数规划公式提供了一种算法,可以保证识别CSP中的全局最优值,并使量子计算机能够解决出现的组合挑战。因此,所得到的结构被证明在给定的成分下提供尽可能低的能量,证明了在明确假设下观察到的原型材料结构的最佳性。这既为启发式和数据驱动的结构预测方法提供了基本事实,又通过保证实验室中实验分离材料的能量状态提供了基本理解。开发充分利用新兴软件和硬件的编码和实现将在最佳性、确定性和量子优势的基础上定义独特的CSP,从而为合成优先级和属性预测提供新的工作流程。

    文献链接:“Optimality guarantees for crystal structure prediction”(Nature,2023,10.1038/s41586-023-06071-y)


  • 原文来源:http://www.cailiaoniu.com/252636.html
相关报告
  • 《制造轻质晶体结构的新方法——3D打印》

    • 来源专题:中国科学院文献情报制造与材料知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:冯瑞华
    • 发布时间:2018-03-19
    • 仿生学是一门跨学科的研究领域,它模仿生物过程,为复杂的人类问题设计解决方案——结合了金属和聚合物增材制造技术(即3D打印)的发展,已经在生产更耐用的轻质材料和结构方面取得了突破。新加坡ASTAR的科学家们调查研究发现,医学植入材料、汽车和航天部件都将从中受益。 晶格结构如图所示,从上到下的直径分级和空间分级都是统一的标准。图片来源: ASTAR 和 Elsevier 据全球研究机构ASTAR称,铸造和机加工等传统制造工艺并不适合于建造坚固的轻质结构,并且限制了设计的可能性。ASTAR的研究人员发明了一种新方法,使用增材制造技术制造轻质晶体结构,并且提高了其结构的强度和刚度,为制造新型吸水材料和夹层结构开辟了新道路。 此项目由新加坡制造技术研究所(ASTAR)的科学家Stephen Daynes和新加坡国立大学的研究人员合作完成,Stephen Daynes解释说:“此种方法制造的晶格结构优于传统固体材料的结构性能,可用于制造轻质夹层芯、医用植入物材料和具有特殊机械和热性能的特定晶格材料。利用一种新的仿生学方法,我们能够创造出类似于竹子和人类骨骼的细胞和晶格结构。” 研究人员通过结合拓扑和尺寸优化的方法,确定了晶格中被称为等静线的主应力线。由ASTAR发布的新闻指出,这种方法可以调整结构中的每个晶胞的大小、形状和方向,从而显著减少相邻晶胞之间的应力。研究人员称,这种设计方法使晶体刚度提高了172%,强度提高了100%。 Daynes说:“我们的技术可以创造出轻量级的功能梯度晶格,大大提高了增材制造夹层结构的刚度和强度,并且不会增加它们的质量。这些结构特别适合于增材制造过程,因为它们基本不受制造复杂性的约束。” Daynes说:“我们计划将这种方法应用到三维的应力场中,通过采用空间梯度的晶格产生更新颖、更有效的材料。”
  • 《人类的 GABAA 受体的晶体结构》

    • 来源专题:重大新药创制—研发动态
    • 编译者:杜慧
    • 发布时间:2014-10-17
    • GABAARs是人类大脑中快速抑制性突触传递的主要递质。GABAAR 信号衰弱会引起异常活跃的神经系统疾病,如失眠、 焦虑和癫痫。在这里,我们首次给出了GABAAR的三维结构。这种结构揭示了真核生物半胱氨酸循环受体所特有的建筑元素、 解释了多种人类疾病变异的机械后果并给出了其对于N-聚糖意想不到的结构作用。受体与一个未知的激动剂结合,苯甲脒,为GABAAR 调制器的合理设计开放了新的途径。在孔的底部通道形成了一个封闭口,代表静止的状态。这些结果不仅对五聚体门控离子通道的机制提出了新见解,而且还加强了目前对 GABA神经递质传递的认识。