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《6月12日_RT-PCR多次检测SARS-CoV-2可减少由基因组变异引起的检测敏感性丢失》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： xuwenwhlib
  • 发布时间：2020-06-14

  • 信息名称：RT-PCR多次检测SARS-CoV-2可减少由基因组变异引起的检测敏感性丢失
    1.时间：2020年6月12日
    2.机构或团队：西班牙STAT-Dx公司、美国QIAGEN公司
    3.事件概要：
    西班牙STAT-Dx公司等机构在International Journal of Infectious Diseases发表论文“Multiple assays in a real-time RT-PCR SARS-CoV-2 panel can mitigate the risk of loss of sensitivity by new genomic variants during the COVID-19 outbreak”。
    文章针对病毒累积的遗传变异对5个SARS-CoV-2 PCR检测面板进行了评估，以评估对单个检测的敏感性。在2020年第21周，文章使用了来自GISAID和GenBank数据库的完整的SARS-CoV-2基因组，使用了来自公开的平台（WHO、CDC、NMDC和HKU）和QIAstat-Dx的SARS-CoV-2引物序列进行比对，注释了影响寡核苷酸退火的累积遗传变异。分析结果显示，共有11,627个基因组（34.38%）包含单个突变，影响PCR试验的退火，8,773（25.94%）基因组的变异被认为是高风险，而另外2,854（8.43%）基因组表现为低频率的单突变，预计不会对敏感性产生影响。在QIAstat-Dx面板中，99.11%的基因组匹配了100%的寡核苷酸覆盖率，并且在体外测试了关键变异，证实敏感性没有损失。
    4.附件：
    原文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S120197122030463X

  • 原文来源：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S120197122030463X
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