许多转录因子受多个残基磷酸化的调节。Mylona等研究人员分析了转录因子Elk-1的多位点磷酸化,并发现它可以防止过度激活。激酶ERK2的磷酸化发生在8个位点,但这些位点的磷酸化速度不同。磷酸化更快的位点能促进转录激活。磷酸化缓慢的位点会抑制ERK2的过度激活,且无需磷酸酶或任何其他负调节成分。