《麦二叉蚜食草对柳枝稷的蛋白质和磷酸化丰度有显著影响》

  • 来源专题:外来生物入侵
  • 编译者: 刘小燕
  • 发布时间:2020-10-06
  • 柳枝稷是一种重要的生物燃料作物,但它也是麦二叉蚜(GB)的寄主。虽然已经进行了转录组研究来推测植物防御GB的分子机制,但对于GB侵染对柳枝稷的蛋白表达和磷酸化调控的影响尚不清楚。采用无标签蛋白质组学的方法,在感染后第10天,对柳枝稷GB感染和未感染的对照植株中的夏季蛋白质组和磷酸蛋白质组的整体响应进行了监测。相对于未感染的对照植株中,在GB感染的植株中鉴定出3594个蛋白质匹配的肽段,其中429中存在差异表达,GB感染分别上调和下调了291和138种蛋白质。磷酸蛋白质组分析从350个磷酸肽中鉴定出310个差异磷酸化蛋白(DP),共有399个磷酸化位点,与苏氨酸磷酸化位点(21%)相比,这些磷酸肽具有更多的丝氨酸磷酸化残基(79%)。总体而言,KEGG通路分析表明,GB感染导致丰富的蛋白质积累,这些蛋白质对于植物防御次级代谢产物的生物合成很重要,并抑制了光合作用中蛋白质的积累。有趣的是,防御调节剂如萜烯合酶、类木瓜半胱氨酸蛋白酶、丝氨酸羧肽酶和脂氧合酶在蛋白质组水平上调,证实了先前发表的转录组数据。 

相关报告
  • 《Science | 解析KRAS磷酸化蛋白质组和肿瘤KRAS治疗耐药性》

    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-06-14
    • 2024年6月7日,北卡罗来纳大学教堂山分校Clint A. Stalnecker、Channing J. Der共同通讯在Science发表题为Determining the ERK-regulated phosphoproteome driving KRAS-mutant cancer的文章,提供了驱动KRAS突变体PDAC生长的异常ERK信号的全面分子图谱,揭示了对KRAS抑制剂产生耐药性的潜在机制。 Clint A. Stalnecker等人的论文证明,高度相关的ERK1和ERK2激酶在支持KRAS依赖性PDAC生长中发挥着冗余的作用,ERK1或ERK2的组成型激活变体的表达足以赋予对KRAS抑制的完全或接近完全的抗性。通过广泛的磷酸蛋白质组学分析,他们在2123种蛋白质上鉴定了惊人的4666个ERK依赖性磷酸位点,极大地扩展了KRAS突变体PDAC中ERK调节的磷酸蛋白质的已知深度和广度。 该研究表明,KRAS调节的磷酸化蛋白质组几乎完全由ERK驱动,已鉴定的磷酸位点富含ERK相互作用基序,这表明ERK具有直接的调节作用。此外,作者证明,ERK调节了一个高度复杂和动态的蛋白激酶网络,细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)和RHO鸟苷三磷酸酶(GTPase)信号成为ERK的主要下游效应物。研究人员发现了ERK信号传导和RHO GTPase调节之间的紧密结合,ERK抑制导致RHO GTPase相关蛋白磷酸化的明显时间变化。最初,ERK抑制导致细胞骨架和RHO GTPase效应蛋白的磷酸化降低,随后一组不同的RHO GTPase调节因子的磷酸化代偿性上调,这可能有助于获得性抗性机制。 此外,该研究强调了ERK在调节PDAC生长所必需的蛋白质中的关键作用,在ERK调节的磷酸蛋白质组中,核定位蛋白质和参与细胞周期调节和RHO GTPase信号传导的蛋白质显著富集。值得注意的是,这些蛋白质中的一些在KRAS突变癌症中表现出选择性遗传依赖性,特别是在PDAC中,突出了它们作为治疗靶点的潜力。 总的来说,这项研究提供了驱动KRAS突变体PDAC生长的ERK调节的磷酸蛋白质组的全面分子图谱,揭示了ERK信号传导、细胞周期调节和RHO GTPase信号传导之间的复杂相互作用。这些发现不仅促进了我们对KRAS依赖性致癌作用的理解,还提示了对KRAS抑制剂耐药性的潜在机制,为开发针对KRAS-ERK信号轴的更有效的联合疗法铺平了道路。
  • 《模拟烹饪过程中蛋白质和多糖对水包油乳剂风味释放的影响》

    • 来源专题:食物与营养
    • 编译者:李晓妍
    • 发布时间:2019-08-28
    • 我们的目的是建立生物聚合物添加剂在模拟烹饪过程中对模型食品乳剂风味释放特性的影响。以大蒜中的一种挥发性疏水性香料烯丙基甲基二硫醚(AMDS)为模型香气。这种风味化合物在食品热加工过程中很容易丢失,因此有必要确定有效的策略来提高其保持性和调节其释放特性。乳剂的热稳定性似乎是决定其风味释放的主要因素,在加热过程中促进聚结的添加剂导致更快的风味释放。此外,高水平的麦芽糊精和黄原胶的加入促进了絮凝的耗尽,这也导致加热过程中风味释放更快。与此相反,乳液粘度与风味释放曲线之间似乎没有相关性。这些结果对于设计以乳化剂为基础的食品,如调味料和汤,在烹饪过程中控制风味释放是很重要的。