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《Nature丨三聚体schlafen结构域核酸酶对piRNA的加工》

  • 来源专题：战略生物资源
  • 编译者： 李康音
  • 发布时间：2023-10-01

  • 2023年9月27日，德国IMB的研究人员在Nature上发表了题为piRNA processing by a trimeric Schlafen-domain nuclease的论文。该研究鉴定了一种核糖核酸内切酶，21U RNA 5'端切割全酶(PUCH)的前体，在秀丽隐杆线虫中启动piRNA加工。遗传和生化研究表明，Schlafen-like-domain蛋白(SLFL蛋白)的三聚体PUCH执行5'端piRNA前体切割。puch介导的加工严格要求7-甲基- g帽(m(7) g帽)和3号位置的尿嘧啶。

    该研究还展示了PUCH如何与PETISCO(一种结合piRNA前体的复合物)相互作用，并且这种相互作用增强了体内piRNA的产生。PUCH的鉴定结束了对线虫5'端piRNA生物发生因子的寻找，揭示了一种由三种SLFL蛋白形成的RNA内切酶。哺乳动物Schlafen (SLFN)基因与免疫有关，揭示了哺乳动物免疫反应与控制转座因子的基于rna的深度保守机制之间的分子联系。



    本文内容转载自“ CNS推送BioMed”微信公众号。

    原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/Azyi_dMBH9ubQYLDrZ3QEA


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  • 《Nature丨CD4结合HIV-1 Env异源三聚体的中间构象》
    • 来源专题：战略生物资源
    • 编译者：李康音
    • 发布时间：2023-11-27
    • 本文内容转载自“”微信公众号。原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/PXOP6p4TwV3ha2p036XMOg 2023年11月22日，加州理工学院的研究人员在Nature发表了题为Intermediate conformations of CD4-bound HIV-1 Env heterotrimers的文章。该研究为HIV-1包膜（Env）蛋白在结合不同数量的CD4受体时所采取的中间构象提供了宝贵的见解。 研究人员工程化了只能结合一个或两个CD4分子的Env异源三聚体，并确定了这些异源三聚体与CD4结合的冷冻电镜结构。研究人员发现，一个CD4受体的结合主要导致Env维持闭合的融合前构象。相比之下，两个CD4分子的结合导致了部分打开的、非对称的构象，其中两个gp120亚基采用CD4结合打开的构象，第三个gp120处于外翻但V1V2没有移位的隐蔽打开状态。值得注意的是，gp41构象与相应的gp120只有部分一致，这表明gp120和gp41的构象变化并非严格耦合的。 总之，这项研究拓宽了我们对Env在与CD4初期接触过程中构象动力学的视角，指出一个受体的结合一般不足以触发大规模Env重排。两个CD4分子结合的非对称中间态增进了对于gp120和gp41水平上的进入机制理解。稳定不同的构象中间体的能力为结构引导的干预和功能含义的审视提供了新的机会，增进了我们在结构水平上对HIV感染和病毒膜融合早期事件的理解。
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  • 《Nature | 外切核酸酶介导的mRNA转录终止的结构基础》
    • 来源专题：战略生物资源
    • 编译者：李康音
    • 发布时间：2024-04-01
    • 2024年3月27日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室张余研究组在Nature上发表题为Structural basis of exoribonuclease-mediated mRNA transcription termination 的研究论文。 转录是基因表达的第一步，是调控基因表达的重要环节。基因转录按照RNA的合成过程分为转录起始，转录延伸和转录终止三个阶段。近年来转录起始和转录延伸的机制逐渐被揭开，然而转录终止的机制尚未阐明。 该研究揭示了酵母mRNA转录终止的分子机制。研究团队利用含有磷硫键修饰的不同长度RNA组装了包含Rat1-Rai1、Pol II、DNA和RNA的转录终止前复合物，重构了Rat1-Rai1缩短RNA的中间态过程，并解析了上述中间状态的复合物结构。研究团队发现外切酶Rat1-Rai1稳定结合在Pol II的RNA通道外侧，能够直接将Pol II合成的mRNA引导到其Rat1催化中心进行切割。并且，外切酶的结合位置和Pol II的转录延伸因子互相重叠，外切酶结合促使延伸因子Spt4/5/6解离。
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