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《对 16 种 SARS-CoV-2 疫苗组合的高维分析揭示了与免疫原性相关的淋巴细胞特征》

  • 来源专题：新发突发传染病
  • 编译者： 张玢
  • 发布时间：2023-04-27
  • 针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)开发的疫苗范围为研究跨不同平台的免疫提供了独特的机会。在单中心队列中，我们分析了五种冠状病毒病2019(新冠肺炎)疫苗在16种组合接种三种技术(腺病毒、信使核糖核酸和灭活病毒)后的体液和细胞免疫隔间。对腺病毒和灭活病毒疫苗，异种组合通常比同源方案更具免疫原性。作为第二次免疫的mR NA疫苗产生了最强的抗体应答，并诱导了最高频率的棘波结合记忆B细胞，而与免疫疫苗无关。用灭活病毒疫苗接种会增加SARS-CoV-2特异性T细胞反应，而加强接种不会。不同的疫苗组合产生了不同的免疫特征，表明免疫反应是由所应用的疫苗类型和接种顺序决定的。这些数据为改进未来针对病原体和癌症的疫苗策略提供了一个框架。
  • 原文来源：https://www.nature.com/articles/s41590-023-01499-w?error=cookies_not_supported&code=9f58adbc-911e-406d-bce9-e293604f0c6e
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相关报告

  • 《Nat Microbiol：研究揭示SARS-CoV-2感染灵长类动物的特征》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2021-01-06
    • 得克萨斯生物医学研究所（Texas Biomed）和西南国家灵长类动物研究中心（SNPRC）的科学家在《Nature Microbiology》杂志上发表了有关SARS-CoV-2全面动物模型研究的发现。这些发现最初于2020年6月在线发布在BioRxiv上。该研究评估了三种非人类灵长类（NHP）物种（印度恒河猴，非洲狒狒和新世界起源的普通marmosets），以确定对SARS-CoV-2的易感性与COVID-19疾病的发展。在研究过程中，猕猴和狒狒作为COVID-19疾病研究的动物模型显示了巨大的希望。基于结果，研究人员建议使用猕猴作为模型来开发疫苗，而狒狒则表现出更大的疾病发展趋势，使其成为评估抗病毒疗法和合并症的潜在选择，例如了解COVID之间的联系-19和糖尿病或COVID-19和心脏病。 “ Texas Biomed独特的研究模型的优势在于，其专业知识可以在一个校园内以动物，生物安全和法规方面的能力支持个人科学研究和合同研究，从而帮助从基础发现到临床前开发再到人类临床试验的广泛研究。” Texas Biomed研究副总裁Joanne Turner博士解释说。 用于传染病的动物模型（例如COVID-19）使全世界的科学家能够确定当前正在开发的候选疫苗和抗病毒治疗剂是否可以作为人类干预手段可行。此外，动物模型使科学家能够了解免疫系统受损的人的疾病进展，以协助开发针对这些人的治疗方法。 西南国家灵长类动物研究中心主任Deepak Kaushal博士说：“找到适合COVID-19的动物模型可以立即进行这些关键发现，这是抵抗这种疾病的重要一步。如果没有详尽的动物数据，FDA就不太可能许可将疫苗或抗病毒疗法用于人类使用，即使是目前正在进行人体试验的动物，因为动物模型数据可以确保我们对这种疾病以及人类的反应有完整的了解。进行潜在的治疗。” 由43名研究人员组成的小组报告了这三种NHP中SARS-CoV-2感染/ COVID-19疾病期间的临床，病毒，影像学，免疫学和组织病理学（组织检查）发现。该研究最终发现，非人类灵长类动物显示出与人类相似的SARS-CoV-2感染进展，有些感染者比其他感染者病得更重，上下呼吸道中都有病毒征象和肺炎征象。 Kaushal博士解释说：“我们的结果告诉我们，随着我们更深入地了解疾病，用于人类试验的疗法和疫苗的靶标，这些动物模型将提供相关的，可量化的信息。” 虽然先前的动物研究表明猕猴是SARS-CoV-2的可行模型，但这是研究人员首次对三种不同的灵长类模型进行了纵向研究。此外，研究人员使用了最全面的评估方法，从支气管肺泡灌洗（肺液收集）和鼻拭子确定病毒的存在，再到胸部X射线和CT扫描来评估感染后的肺部健康。 结果显示，猕猴和狒狒模型会形成强烈的急性病毒感染迹象，导致肺炎。而本研究发现非人类灵长类动物的免疫系统会产生强烈反应并清除感染。特殊的骨髓细胞从血液流向肺部，并分泌高水平的I型干扰素，细胞因子等。这些特殊的吞噬细胞的出现与病毒和疾病指标的下降相对应。 这项研究也是SARS-CoV-2感染特异性改变肺部淋巴样细胞（T细胞）的首次报告，猕猴中产生了强烈且非常特异的免疫反应，使动物能够清除病毒。这一发现表明，灵长类模型将有助于理解对SARS-CoV-2的免疫反应，并有助于制定可以产生类似反应的干预措施，并有助于评估需要特殊治疗的疫苗的安全性和有效性。才能产生免疫反应。
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  • 《12月23日_人工智能可预测SARS-CoV-2的免疫原性》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-02-01
    • Scientific Reports期刊于12月23日发表了NEC欧洲研究所和NEC OncoImmunity AS公司的一篇文章“Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS-CoV-2 leading to universal blueprints for vaccine designs”，文章描述了人工智能可以预测SARS-CoV-2的免疫原性，从而为疫苗设计提供通用蓝图。 文章称，该研究使用NEC Immune Profiler技术以及宿主感染细胞表面抗原呈递和免疫原性预测指标，绘制了人类人群中最常见的100个HLA-A、HLA-B和HLA-DR等位基因的SARS-CoV-2蛋白质组，并生成了全面的表位图。然后使用这些表位图作为输入，进行蒙特卡罗模拟，识别病毒中具有统计学意义的表位热点区域，这些区域在广泛的HLA类型中最有可能具有免疫原性。然后删除了与人类蛋白质组蛋白具有显著同源性的表位热点，以减少诱导脱靶自身免疫反应的机会。该研究还分析了病毒3400种不同序列的所有非同义突变的抗原呈递和免疫原性特征，以确定SARS-COV-2突变被宿主感染细胞呈递并被宿主免疫系统检测到的可能性降低的趋势。最后使用了大约22,000个人的HLA单倍型数据库，开发了“数字孪生”型模拟不同热点组合在不同人群中的有效性模型；该方法确定了一个最佳的表位热点群，可以在全球人口中提供最大的覆盖范围。通过结合以上技术对整个SARS-CoV-2蛋白质组进行了概况分析，并确定了抗原表位热点的子集，这些热点可用于疫苗制剂中，以覆盖全球人群。 来源：https://www.nature.com/articles/s41598-020-78758-5
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