2024年1月8日,马克斯-普朗克研究所的研究人员在Cell上发表了题为Direct observation of a condensate effect on super-enhancer controlled gene bursting的研究论文。
增强子是远端 DNA 元件,被认为可以环状和接触启动子以控制基因表达。最近,研究人员在由增强子簇(超级增强子)控制的基因上发现了衍射大小的转录凝聚物。然而,内源性凝聚物在控制基因表达方面的直接功能仍然难以捉摸。
该研究开发了活细胞超分辨率和多色 3D 成像方法来研究内源性凝聚物在超增强子控制基因 Sox2 调控中的假定作用。与增强子距离相比,研究人员发现凝聚物的位置动力学是基因表达的更好预测因子。当凝结物距离较远(>1 μm)时,会发生基础基因爆发,但当凝聚物靠近(<1 μm)移动时,爆发的大小和频率会增强。粘连蛋白和局部 DNA 元件的扰动并不能阻止基底爆裂,但会影响冷凝水及其爆破增强。研究人员提出了一种三向接吻模型,其中凝聚物与基因位点和调节 DNA 元件瞬时相互作用以控制基因爆发。