《11月10日_研究人员分析宿主基因对COVID-19严重程度和易感性的影响》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-11-18
  • 11月10日,深圳市第三人民医院等在Cell Discovery期刊发表题为“Initial whole-genome sequencing and analysis of the host genetic contribution to COVID-19 severity and susceptibility”的文章。研究人员初步分析了宿主基因对COVID-19严重程度和易感性的影响。
    文章称,该研究通过对深圳第三人民医院不同严重程度分类的332例COVID-19患者进行深入测序和分析,首次在中国人群中进行宿主基因研究。该团队在校正了潜在的混杂因素之后,在总共2220万个遗传变异中,对五个严重程度组(包括无症状、轻度、中度、重度和重症患者)进行了单变量和基于基因的关联测试。谱系分析表明,对于危重病和无症状疾病,GOLGA3和DPP7中功能变异的丧失可能具有单基因效应。全基因组关联研究表明,与严重性相关的最重要基因位点位于参与IL-1信号通路的TMEM189–UBE2V1中。与轻度和普通人群相比,重症患者中影响TMPRSS2蛋白稳定性的p.Val197Met错义变体显示等位基因频率降低。该研究确定,HLA-A* 11:01,B* 51:01和C* 14:02等位基因明显诱发了患者的最坏结果。这项对中国患者的初步基因组研究为COVID-19患者群体的表型差异提供了遗传学方面的见解,并着重指出了可能有助于指导有针对性控制疫情的基因和变异。该文章还回顾了该研究的局限性和优点,以指导今后国际上阐明COVID-19和其他传染性和复杂疾病宿主-病原体相互作用的遗传结构的工作。
    原文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-020-00231-4

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41421-020-00231-4
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    • Medicalxpress网站11月10日消息称,研究人员探索了引起感染所需的SARS-CoV-2病毒量以及病毒量与疾病严重程度之间的关系。该研究发表在《临床传染病》上。了解SARS-CoV-2如何从一个人身上传播到另一个人身上是阻止其传播的关键。该研究发现,病毒主要通过人体吸入含有病毒的颗粒(而不是通过接触表面)来传播,这些颗粒的感染能力取决于环境和吸入人的生理机能。病毒颗粒的浓度加上与这些颗粒接触的时间长度最终决定了一个人吸入的病毒浓度。 研究人员发现,病毒从一个人身上传播到另一个人身上的数量似乎不会影响疾病的严重程度。实际上,这意味着吸入更多传染性颗粒的人不一定会比吸入少量传染性颗粒的人患上更严重的疾病。然而,被感染的可能性可能会随着病毒数量的增加而增加。研究表明,一些干预措施,例如戴口罩,可以通过减少接触来降低感染病毒的风险。但是,一旦已经被感染,病毒数量并不会影响患者的疾病的严重程度。 研究人员表示,决定疾病严重程度的更重要因素是被感染的宿主以及被感染者的生理机能,被感染个体与病毒之间的关系比病毒量更能决定疾病的严重程度。 在COVID-19大流行期间,有些COVID-19患者病得十分严重,有些人在感染病毒后却没有症状。年龄较大、男性、某些合并症和吸烟与COVID-19疾病的严重程度有关。研究人员指出,没有合并症或年龄较小并不能保证其在感染病毒后的疾病症状比较轻微,而且对于某些个体患COVID-19严重疾病或死亡风险更高的原因尚待了解。另外,研究人员表示,仍需继续调查COVID-19康复患者在疾病急性期后存在长期症状的原因。
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    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2021-03-01
    • Nature Medicine于2月25日发表了加拿大麦吉尔大学和日本京都大学等的文章“A Neanderthal OAS1 isoform protects individuals of European ancestry against COVID-19 susceptibility and severity”,文章描述了尼安德特人2'-5'-寡腺苷酸合成酶1(OAS1)异构体可保护欧洲血统的个体免受COVID-19的易感性和严重性的影响。 为了确定影响COVID-19易感性和严重程度的循环蛋白,研究人员进行了一项双样本孟德尔随机化(MR)研究,快速扫描数百种循环蛋白,同时减少因反向因果关系和混淆造成的偏差。在14134例病例和120万例对照中,研究人员发现 OAS1水平升高与COVID-19死亡或通气(比值比(OR)= 0.54,P = 7×10-8)、住院(OR = 0.61,P = 8×10-8)以及易感性(OR = 0.78,P = 8×10-6)降低有关。研究人员在504名个体中测量OAS1水平,发现在非传染性状态下较高的血浆OAS1水平与COVID-19易感性和严重程度降低相关。进一步的分析表明,欧洲血统中的尼安德特人OAS1异构型提供了这种保护。因此,MR分析和病例对照研究的证据支持OAS1在COVID-19不良预后中的保护作用,可以优先考虑用能够增加OAS1水平的现有药理学药物来开发新疗法。 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41591-021-01281-1