《4月18日_上海交通大学团队通过亚基因组RNA分析揭示SARS-COV-2与其他冠状病毒的转录差异》

• 来源专题：COVID-19科研动态监测
• 编译者： xuwenwhlib
• 发布时间：2020-04-19
• 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.16.043224v1

信息名称：上海交通大学团队通过亚基因组RNA分析揭示SARS-COV-2与其他冠状病毒的转录差异

1.时间：2020年4月18日

2.机构或团队：上海交通大学

3.事件概要：

4月18日，bioRxiv发表了题为“Transcriptional Difference between SARS-COV-2 and other Human Coronaviruses Revealed by Sub-genomic RNA Profiling”的文章。

SARS-COV-2以及其他冠状病毒进入宿主细胞后，是通过形成“亚基因组RNA”（sgRNA）来表达合成其所需的3个主要基因的（如Spike蛋白等）。由于这些病毒的基因组以RNA的形式存在，只有通过分析这些sgRNA的相对丰度，才能揭示病毒的转录组。

文章中从NCBI SRA数据库中共获得来自8个研究项目、42个患者样本的共计6.98亿个Illumina reads的公开元转录组数据，以此能够推断出体内的病毒转录组，这与细胞培养的体外转录组不同。文章分析结果还观察到样本间的多样性，并鉴定了样本特异性转录本。通过与MERS病毒和SARS病毒数据进行同样的分析，文章比较了三种病毒在转录方面的差异。结果表明，在这些差异中，SARS-COV-2显著提高了Spike基因的表达，这可能是其高遗传性的原因之一。

*注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。

4.附件：

原文链接

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.16.043224v1