《使用基因组的机器学习方法进行基于CRISPR的COVID-19监测》

• 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
• 编译者： hujm
• 发布时间：2020-03-08
• 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.26.967026v1

博德研究所于3月2日在bioRxiv上发表题为“CRISPR-based COVID-19 surveillance using a genomically-comprehensive machine learning approach”的文章。

文章提供了67种病毒和亚种的检测设计，包括：SARS-CoV-2、系统发育相关病毒以及具有类似临床表现的病毒。这些设计是研究人员正在开发可用于快速设计核酸检测测定法的算法的成果。研究人员在设计中使用CRISPR-Cas13检测系统实验筛选了4种SARS-CoV-2检测设计，然后广泛测试了性能最高的SARS-CoV-2检测方法。研究人员证明了使用合成靶标及荧光和侧向层析技术检测，该测定法的灵敏度和速度。研究人员提供的方案可以扩展为测试其他66种病毒和亚种。分析设计可在https://adapt.sabetilab.org/获得。