《Nature丨炎性caspase-4裂解细胞因子的结构研究》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-11-27
  • 本文内容转载自“BioArt”微信公众号。原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/uupB8gI5TIPjv0f4CKekmg

    2023年11月22日,美国哈佛医学院波士顿儿童医院Jonathan C. Kagan和Hao Wu研究组合作在Nature 杂志发表了题为Structural Insights Into Cytokine Cleavage By Inflammatory Caspase-4的文章。该研究有以下发现:

    1). 通过设计体外活性切割实验,广泛对比了来自人类和其他哺乳动物的非典型炎症小体Caspase-4的活性,发现Caspase-4(啮齿动物的Caspase-11除外)可以高效切割 Pro-IL-18,而非Pro-IL-1β。其切割效率与Caspase-1切割 Pro-IL-1β 的能力相当。

    2). 在细胞层面,LPS 激活的Caspase-4可以直接切割 Pro-IL-18和GSDMD,从而绕过经典炎症小体介导 IL-18 释放。

    3). 利用冷冻电镜(cryo-EM)解析了Caspase-4/Pro-IL-18 的复合物结构,分辨率为3.2 ?。该结构揭示Caspase-4与 Pro-IL-18结合的两个主要作用界面:外部结合位点(Exosite)以及与活性位点(Active Site)。利用化学交联质谱技术(Crosslinking Mass Spectrometry)可以进一步验证相互作用界面。

    4).验证复合物作用界面上关键氨基酸的功能,表明两个作用界面对于Caspase 识别Pro-IL-18同样重要。

    5). 通过序列以及结构比对,发现突变Caspase-11上的几个关键位点可以让其获得切割Pro-IL-18的能力,从而证明了这些关键位点对于Caspase-4识别Pro-IL-18的重要性。


相关报告
  • 《Nature丨caspase-4非典型炎性体对IL-18的识别和成熟》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-11-27
    • 本文内容转载自“大屯路15号”微信公众号。原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6CsbQWwoS7H6-S8-Zo9j7g 2023年11月22日,丁璟珒研究组和北京生命科学研究所邵峰团队在Nature在线发表题为Recognition and maturation of IL-18 by caspase-4 noncanonical inflammasome的合作研究论文。该研究发现炎症因子IL-18是非经典炎症小体通路caspase-4/5的生理底物,并进一步揭示了天然免疫通路中caspases识别和活化IL-18的精确分子机制。 这项工作发现并证明炎症因子IL-18是非经典炎症小体通路活化的caspase-4/5的生理底物,并完整地揭示了天然免疫通路中caspases识别和切割Pro-IL-18,以及Pro-IL-18被加工后成熟为有生理功能的炎症因子的精确分子机制。成熟的IL-18重要的生理功能是诱导INFγ的产生,促进Th1型细胞免疫,非经典炎症小体通路识别和活化炎症因子IL-18的发现,也为天然免疫和适应性免疫的对话提供了全新的理解。在临床上,血液中高水平的IL-18与多种自身免疫疾病相关,如特异性皮炎、炎症性肠病和幼年特发性关节炎,这项工作为理解这些自身免疫疾病的发生机制以及开发新的干预策略提供了全新的思路。
  • 《Nature | 肝炎的免疫抑制性巨噬细胞亚群及其肠菌响应》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-04-29
    • 2024年4月24日,大阪大学Masaru Ishii通讯在Nature发表题为Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation的文章,揭示了肝脏免疫系统适应其空间组织和不断暴露于肠道来源病原体的机制。 肝脏是一个重要的器官,是从肠道到身体其他部位的主要通道。肝脏的特征结构肝小叶以重复六边形单元为特征,在器官内创造了独特的微环境。作者识别了一个称为MP2的肝驻留巨噬细胞亚群,该亚群优先定位于肝小叶的门静脉周围(periportal vein, PV)区。这些巨噬细胞表达高水平的清道夫受体(scavenger)Marco和抗炎细胞因子IL-10,即存在免疫抑制特性。通过活体内成像和单细胞转录组学,作者证明MP2细胞在PV区产生免疫抑制小生境,限制了这些区域的过度炎症反应。Marco–IL-10轴在建立这种免疫抑制环境中起着关键作用。MP2细胞分泌的IL-10分别抑制肝窦内皮细胞(LSEC)和其他常驻巨噬细胞(Kupffer细胞)上粘附分子和趋化因子的表达。这抑制了中性粒细胞的粘附和活化,从而抑制了PV区的炎症。值得注意的是,Marco本身通过隔离病原体相关分子模式(PAMP)和损伤相关分子模式(DAMP),阻止其被其他免疫细胞识别,从而有助于抗炎作用。 然后作者发现,MP2亚群的诱导和维持取决于肠道共生微生物。通过抗生素治疗或在无菌小鼠中清除肠道共生菌导致MP2细胞数量显著减少和IL-10表达减少。进一步的研究表明,一个特定的细菌家族Odoribacteraceae,通过提供一种生后(postbiotic)代谢产物异别石胆酸(isoallolithocholic acid, isoallo-LCA),在诱导MP2细胞中发挥着至关重要的作用。这种胆汁酸代谢产物可能通过核激素受体NR4A1促进MP2细胞的分化和IL-10的产生。这种免疫抑制机制的生理相关性在疾病模型中变得明显。在肠道屏障功能受损的小鼠中,如结肠炎或非酒精性脂肪肝(NAFLD)小鼠,Marco缺失会导致肝脏炎症和纤维化加剧。引人注目的是,来自原发性硬化性胆管炎(PSC)和NAFLD/非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者的人类肝脏样本显示出表达Marco的巨噬细胞数量减少,这进一步强调了这一发现的潜在临床意义。 总的来说,这项研究揭示了肝脏使其免疫系统适应其独特的结构和不断暴露于肠道来源的病原体的机制。PV区存在专门的免疫抑制巨噬细胞亚群,这突出了肝脏在保持体内平衡的同时防止过度炎症的显著能力。Marco–IL-10轴代表了与肠屏障功能障碍和微生物移位相关的慢性肝病(如PSC和NASH)的潜在治疗靶点。这项研究不仅揭示了肝脏免疫反应的空间异质性,而且为肠道微生物组和肝脏免疫之间复杂的相互作用提供了有价值的见解