1.时间:2020年3月3日
2.机构或团队:立命馆大学
3.事件概要:
日本立命馆大学的科研人员在《Infection, Genetics and Evolution》发表论文“Nonstructural proteins NS7b and NS8 are likely to be phylogenetically associated with evolution of 2019-nCoV”,探讨了非结构蛋白NS7b和NS8与2019-nCoV的进化及系统发育的关系。
文章提到,第七例新型人类感染引起肺炎的Beta冠状病毒(2019新型冠状病毒,2019-nCoV)起源于中国武汉。 2019-nCoV与其他引起人类呼吸系统疾病的冠状病毒之间的进化关系并不密切相关。科研人员试图从基因组序列构建系统发育树来表征2019-nCoV的翻译蛋白与其他正冠状病毒亚科(Orthocoronavirinae)的关系,从10个2019-nCoV蛋白同源物的存在和不存在中检索到的图谱,绘制出一个聚类树,这些组合的数据被用来描述2019-nCoV的翻译蛋白与其他正冠状病毒亚科(Orthocoronavirinae)物种之间的关系。文章指出其分析可以表明,2019-nCoV与BatCoV RaTG13关系最密切,属于Betacoronavirus的Sarbecovirus亚类,SARS冠状病毒和Bat-SARS样冠状病毒。一个注释2019-nCoV蛋白与其他基因组序列的同源蛋白的系统发育谱簇揭示了10个2019-nCoV蛋白的两个进化分支。进化枝1由Orcocoronavirinae中的一组保守蛋白组成,包括Orf1ab多蛋白、Nucleocapsid蛋白、Spike糖蛋白和膜蛋白。进化枝2包含六种Sarbecovirus和Hibecovirus的蛋白质。6个Clade 2非结构蛋白中的2个—NS7b和NS8,在2019-nCoV、BetaCoV RaTG和batars样Cov中完全保守。先前已证明NS7b和NS8在SARS-CoV实验模型中会影响免疫应答信号传导。因此,科研人员推测对NS7b和NS8蛋白在进化过程中功能变化的了解可能为探索2019-nCoV的人类感染性提供重要信息。
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原文链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134820301039