《非结构蛋白NS7b和NS8可能与2019-nCoV的进化发生系统发育相关》

• 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
• 编译者： 蒋君
• 发布时间：2020-03-20
• 原文来源：;https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134820301039

引起肺炎的第七种新型人感染betacornavirus（2019新型冠状病毒，2019-nCoV）起源于中国武汉。2019-nCoV与其他人类呼吸道疾病引起的冠状病毒之间的进化关系并不密切。我们试图描述2019-nCoV翻译蛋白与其他正冠状病毒亚科物种的关系。从基因组序列构建了系统发育树。从10个2019-nCoV蛋白的存在和不存在同源性中检索到的图谱中，发展出一个聚类树。结合数据分析了2019-nCoV翻译蛋白与其他正冠状病毒属的关系。我们的分析可靠地表明，2019-nCoV与BatCoV RaTG13关系最为密切，与SARS冠状病毒和蝙蝠SARS样冠状病毒一起属于Betacoronavirus的Sarbecovirus亚属。一个注释的2019-nCoV蛋白与其他基因组序列的同源蛋白的系统发育图谱簇显示了10个2019-nCoV蛋白的两个分支。Clade 1由一组原冠状病毒属的保守蛋白组成，包括Orf1ab多蛋白、核衣壳蛋白、Spike糖蛋白和膜蛋白。Clade 2由6种Sarbecovirus和Hibecovirus独有的蛋白质组成。NS7b和NS8是2019-nCoV、BetaCoV_RaTG和BatSARS样冠状病毒中唯一保守的6个2级非结构蛋白。在SARS-CoV实验模型中，NS7b和NS8已经被证明影响免疫应答信号。因此，我们推测，了解NS7b和NS8蛋白在进化过程中的功能变化可能为探索2019-nCoV的人类感染特性提供重要信息。