2020年3月3日，巴塞尔大学的研究人员在ChemRxiv上在线发表了一篇题目为“Inhibitors for Novel Coronavirus Protease Identified by Virtual Screening of 687 Million Compounds”的文章。
文章指出，为了克服病毒感染，抑制蛋白酶是一种常规的治疗策略，而蛋白酶是蛋白质水解过程中所必需的。迄今为止，尚无可用于治疗SARS-CoV-2的特异性药物或疫苗，尽管它与2003年引起类似流行病的SARS-CoV-1病毒密切相关。因此，迫切需要开发特定的抗病毒疗法来攻克SARS-CoV-2。为了找到新的抑制剂，研究人员通过计算筛选了超过6.87亿个化合物的化合物库，用于结合在最近解析的SARS-CoV-2主要蛋白酶的晶体结构上。以前没有报道过如此巨大的化学空间筛选SARS-CoV-2蛋白酶抑制剂。在形状筛选之后，应用了两种对接方案，然后确定药代动力学相关的分子描述符以缩小初始命中范围。接下来，进行了分子动力学模拟，以验证对接结合模式的稳定性并全面量化配体结合能。在对脱靶结合进行评估后，研究人员报告了11种药物样化合物，与共结晶的拟肽药物具有不良的药代动力学特性相比，它们具有与靶蛋白酶结合自由能提高的特性。此外，研究人员从天然化合物库中鉴定出一种具有可比特性的有效结合剂。
*注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
