爱丁堡大学的研究人员12月18日在期刊Scientific Reports上在线发表了题为“Dynamic data-driven meta-analysis for prioritisation of host genes implicated in COVID-19”的科学报告。
文章称,越来越多的文献描述了宿主因子在COVID-19发病机制中的作用,表明需要结合多种多样的全基因组数据以发现更为有效和安全的治疗方法。研究人员对与人类β冠状病毒感染(SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、季节性冠状病毒)有关的宿主基因的进行了排名,对确定潜在宿主因素的实验进行了系统性综述,使用荟萃分析(MAIC)对来自不同来源的基因列表进行整合,使用数据驱动的基因列表加权来生成宿主基因的综合排名列表。在32个数据集中,排名最高的基因是PPIA(编码环孢素A),这是一种使用环孢菌素可治疗的靶标。其他排名较高的基因包括预测的预后因子(CXCL10、 CD4,、CD3E)和COVID-19的研究性治疗靶点(IL1A)。研究人员可以在https://baillielab.net/maic/covid19搜索和查看基因排名以及不同实验方法对基因排名的贡献。随着新数据的发布,基因列表将被定期更新。