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《通过系统动力学分析揭示了中国1型牛病毒性腹泻病毒的起源和传播。》

  • 来源专题：实验室生物安全
  • 编译者： 张虎
  • 发布时间：2019-12-08

  • 牛病毒性腹泻病毒1型（BVDV-1）在世界范围内很普遍，在畜牧业中造成重大的经济损失。自1980年代在中国首次报道以来，已经报道了BVDV-1的几种基因型，但缺乏对来自中国的BVDV分离株的深入系统发育分析。为了研究中国传播的BVDV-1基因型的分子进化和系统动力学，进行了全面的系统发生和系统动力学分析，以重建起源和时空分布，并追踪不同区域之间的主要病毒流动。从Genbank收集了中国和蒙古的BVDV-1 5'-UTR序列，并使用最大似然法建立了系统进化树。贝叶斯Skygrid用于估计BVDV-1的进化和种群动态。鉴定出八种BVDV-1基因型，其中1b和1 m是主要基因型。结果表明，BVDV-1可能在1960年代在中国引入，经过长期的人口增长，在2010年后逐渐趋于平稳。系统动力学推论清楚地表明BVDV-1的人口增长更加稳定，并且传播了BVDV-1。 BVDV-1可能局限于特定区域。本研究有助于了解中国BVDV-1的分子流行病学和长期进化动态，从而为预防和控制该病毒提供科学依据。

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相关报告

  • 《对印度尼西亚HIV-1B的分析揭示了该病毒的传播动态》
    • 来源专题：生物安全网络监测与评估
    • 编译者：yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间：2019-10-08
    • 在印度尼西亚，对HIV-1B病毒的分子系统发育（进化史）的研究成功地阐明了三个进化枝（病毒的主要分支）的传播时期和途径。其中包括一个印尼独有的进化枝，以及在1970年代和1980年代从泰国，欧洲和美国传播的进化枝。 在AMED的J-GRID计划的资助下，神户大学与印度尼西亚的Airlangga大学之间的研究合作使这项研究成为可能（请参见致谢）。该小组由神冈正典教授和神木大学大学院医学研究科公共卫生学系助理教授Professor木智宏教授，上田树平研究助理（神户大学医学研究科学院传染病研究中心），纳斯鲁努丁教授组成（Airlangga大学）和大阪公共卫生研究所的元村一志博士。 这些结果已于2019年9月27日发表在国际期刊《科学报告》上。 介绍 HIV（人类免疫缺陷病毒）发展为AIDS（后天免疫缺陷综合症），自1981年发现第一例病例以来，它仍然是主要的健康威胁。 HIV的基因组成很容易适应和变化。例如。 HIV-1 M（主要）是世界上传播最广泛的HIV类型，仅就HIV-1 M而言，其9个亚型中就有100株以上。 人们认为，HIV-1的B型亚型（HIV-1B）起源于中非的刚果民主共和国，并从那里传播到海地和美国。随后，它被传播到欧洲和亚洲，现在遍布全球。 印度尼西亚由17,500多个岛屿组成，拥有世界第四大人口。它还以东南亚地区HIV传播最多的案例，其中以CRF01_AE形式为主要亚型。 HIV-1 B亚型（HIV-1B）也很普遍。尽管印度尼西亚的感染率一直在下降，但仍然是一个重大的公共卫生问题。但是，关于印尼病毒的起源，传播和进化的许多方面，人们还不甚了解。 方法 为了进行这项研究，从印度尼西亚爪哇，苏门答腊，巴布亚，苏拉威西岛和其他各个主要岛屿的医疗机构的艾滋病毒患者那里采集了外周血样本。鉴定了HIV-1B基因的32个序列。然后使用密切相关的HIV-1B序列数据库分析这些基因的进化。这些系统发育分析表明，印度尼西亚HIV-1B的主要类型是印度尼西亚进化枝，其次是中国和美国进化枝。 随后对这三个进化枝的分子系统发育进行了深入分析，揭示了它们可能是如何到达印度尼西亚的。结果表明印尼进化枝起源于美国。在1980年代后半叶到达印度尼西亚后，人们认为它已发展成印度尼西亚的独特菌株。中国的进化枝在80年代末从泰国传??播开来，而美国的进化枝则在80年代中期通过欧洲传播（图1）。总体而言，研究发现，整个1970年代和1980年代，HIV-1B是通过泰国，欧洲和美国多次传入印度尼西亚的（估计最早的病毒引进是在1961年左右）。 ——文章发布于2019年10月4日
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  • 《美国成功培育出抗牛病毒性腹泻病毒的基因编辑小牛》
    • 来源专题：农业生物安全
    • 编译者：李周晶
    • 发布时间：2023-06-07
    • 牛病毒性腹泻病毒（Bovine Viral Diarrhea Virus，BVDV）是影响全球牛群健康最重要的病毒之一。自1940年代首次被发现以来，科学家们一直对其开展研究。这种病毒不会感染人类，但对怀孕的奶牛来说是灾难性的威胁。因为它可以感染发育中的小牛，从而导致自然流产，造成出生率降低。一些受感染的小牛就算能够存活到出生，也将终生携带病毒，同时还会将病毒传播给其他牛。尽管相关疫苗已经研发出来，但是控制BVDV传播，至今依然是一个难题。 2023年5月9日，美国科学家首次培育出对BVDV具有抗性的基因编辑小牛，相关研究成果发表在《PNAS Nexus》上。 在过去的20年里，科学家们陆续发现了导致奶牛感染BVDV的主要受体细胞CD46，和BVDV与CD46结合的区域。在最新研究中，科学家们使用CRISPR/Cas9基因编辑技术，交换了BVDV与牛皮肤细胞CD46结合区域的6个氨基酸，从而在阻止BVDV感染的同时，仍保留CD46的所有正常功能。2021年7月19日，世界第一头CD46基因编辑小牛“金格”健康出生。随后，“金格”被观察了几个月，然后科学家们使用BVDV“攻击”“金格”，以确定其是否会被感染。对比实验证明，“金格”的细胞对BVDV的易感性显著降低，且没有观察到不良副作用。 鉴于BVDV感染也会引发其他细菌性疾病，因此这一研究成果还能够减少抗生素在养殖业中的使用，为人们提供更安全健康的乳制品和肉制品。在未来研究中，科学家们还将继续密切观察小牛“金格”在孕育后代方面的能力。
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