《致力于药物发现的新型超级计算机》

• 来源专题：重大科技基础设施领域知识集成服务平台
• 编译者： 魏韧
• 发布时间：2020-04-06
• 原文来源：https://www.riken.jp/en/news_pubs/news/2019/20191129_1/index.html

日本大阪现在拥有一台新的双MDGRAPE-4A超级计算机，模拟导电分子动力学，可用于药物研发，11月23日在大阪校区开放日向公众展出。

MDGRAPE-4A超级计算机，可以测定蛋白质在水溶液中的结构状态，计算组成蛋白质和周围水分子原子力，并在计算机中模拟“移动”蛋白质。为此目的设计的MDGRAPE-4A总功率达到1.3petaflops，特殊的体系结构使其能够超越速度更快的通用超级计算机，通过对组成蛋白质和水分子的大约100000个原子进行建模，在一天内进行大约1.1微秒（百万分之一秒）的模拟，在现实的时间尺度上模拟药物和体内蛋白质之间的相互作用。对这些相互作用的理解将有助于开发更有效的分子靶向治疗。MDGRAPE-4A计算机向全球学术界和研究人员开放。未来该小组计划将人工智能、通用电路和专用电路的混合体等新的技术要素其中，进一步改进该系统。