《纳污河流抗性基因和微生物群落相关性》

  • 来源专题:农业立体污染防治
  • 编译者: 季雪婧
  • 发布时间:2019-07-08
  • 通过Miseq高通量测序分析和荧光定量PCR技术,研究某纳污河流中四环素类与磺胺类抗性基因(ARGs)的分布特征、传播情况及微生物群落结构相关性.结果表明:在河流地表水与沉积物中均检测到四环素类抗性基因tetA和tetB与磺胺类抗性基因sul1和sul2,四环素类抗性基因和磺胺类抗性基因的绝对丰度分别为5.09×103~1.26×107,3.94×105~1.32×109copics/L,磺胺sul1抗生素抗性基因丰度显著高于其它基因;河流主要优势菌门为Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Actinobacteria和Cyanobacteria,其平均总相对丰度占总比例的95.62%,且总体差异较小.抗性基因与微生物群落冗余分析显示,Methylotenera菌属是影响tetA抗性基因分布丰度的主要因素,Dechloromonas和Clostridium sensu stricto 1菌属是影响tetB抗性基因分布丰度的主要因素,Dechloromonas、Clostridium sensu stricto 1和Methylotenera菌属是影响sul1、sul2抗性基因分布丰度的主要因素.

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    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2023-04-03
    • 波特兰州立大学(Portland State University)和威斯康星大学(University of Wisconsin)的研究人员进行的一项新研究发现,在深海高温地热环境中丰富多样的微生物生活在相互依存的群落中。研究成果已发表在《Microbiome》杂志上,由PSU生物学教授Anna-Louise Reysenbach领导,受到美国国家科学基金会NSF的资助。 当通过深海热液喷口离开地壳的350-400°C流体与海水混合时,会产生大型多孔岩石,通常被称为“烟囱”或热液沉积物。这些烟囱被在高温环境中茁壮成长的微生物占据。几十年来,Reysenbach一直从世界各地深海热液喷口收集烟囱,在实验室里使用基因指纹和栽培技术来研究与这些岩石相关的微生物群落多样性。Reysenbach和团队能够利用分子生物学技术对这些群落中微生物的整个基因组进行测序,以了解更多关于其多样性和相互关联的生态系统信息。研究结果表明,深海热液喷口极端环境中的微生物群落多样性令人难以置信。 研究团队构建了来自40个不同岩石群落的3635种细菌和古菌的基因组。多样性的数量令人震惊的,极大地扩展了人们对不同类型的细菌和古菌的认知。研究人员发现了至少500个新属,并有证据表明有两个新门。该团队还发现了微生物多样性热点的证据,例如,新西兰附近深海火山的样本富含不同种类的微生物,其中许多是该火山特有的。这一发现表明,与深海热液喷口相比,火山地下岩石的复杂性增加,使其更有可能容纳多种微生物。(张灿影 编译)
  • 《温东辉教授团队:陆源排水对近海纳污区微生物群落组成及碳代谢功能的影响》

    • 来源专题:水环境治理与保护
    • 编译者:王阳1
    • 发布时间:2023-08-08
    • 随着现代城市和工商业的快速发展,污水处理厂成为保护水环境的重要设施,然而污水处理厂的尾水排放仍然对受纳水体产生不利影响。沿海地区的污水处理厂长期将尾水排入近海,引起海水水质变差,但是近海环境微生物对污染的响应尚不清晰。本研究选择我国污染形势严峻的杭州湾北岸、南岸各一片纳污区(简称JX和SY)为研究对象,进行环境质量调查,并对沉积物微生物群落进行宏基因组测序,分析不同类型的废水排放对纳污区微生物群落结构和功能的潜在影响。研究结果表明,陆源废水排放对纳污区沉积物的微生物群落产生影响。JX和SY群落的物种组成和多样性存在差异,造成这种差异的关键环境因子为水中COD以及水深;JX和SY群落的碳代谢功能也存在差异,JX群落中与甲烷代谢相关的功能基因丰度更高,而SY群落中与糖异生途径相关的功能基因丰度更高,主要影响因子为水中COD和沉积物中TOC及石油类。上述结果对纳污海域的环境管理具有重要意义,并为完善污水处理厂排放标准提供了科学依据。