在轨道rap质量分析仪的灵敏度和采集速度方面取得了巨大的进展,使得蛋白质组的覆盖面越来越广。然而,这些进展主要局限于MS2水平,而对MS1扫描的离子束取样仍然非常低效。在这里我们报告一种数据采集方法,称为BoxCar,在这种方法中,填充多个窄的质量-电荷段使平均离子注入时间增加了十倍以上,与标准的全扫描相比。在1-h的分析中,该方法为人类癌细胞系中90%以上的蛋白质组提供了MS1-level的证据,该细胞系以前在24个部分中被识别,在10个复制体中,它量化了超过6200个蛋白质。在小鼠脑组织中,我们仅在100分钟内就检测到超过10000个蛋白质,并将灵敏度扩展到低调频范围。
——文章发布于2018年5月07日