《1月28日_一种新型生物传感器可以快速检测冠状病毒蛋白和抗体》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2021-02-23
  • 据EurekAlert!网站1月28日消息,华盛顿大学医学院的研究人员创造了一种新的方法来检测构成大流行冠状病毒的蛋白质以及针对大流行冠状病毒的抗体。他们设计了基于蛋白质的生物传感器,能识别病毒表面的特定分子,与它们结合,然后通过生化反应发光。这一突破可以在不久的将来实现更快、更广泛的测试。该研究发表在《自然》上。
    如今,在诊断冠状病毒感染时,大多数医学实验室都依赖一种被称为RT-PCR的技术,这项技术需要专门的人员和设备,也消耗实验室用品,现在在世界各地都有很高的需求。供应链短缺使美国及其他地区的COVID-19测试结果放慢了速度,而该团队的新方法可以解决这些问题。
    该团队还发明了与COVID-19抗体混合时会发光的生物传感器。这些传感器不会对血液中可能存在的其他抗体产生反应,包括针对其他病毒的抗体。这种灵敏度对于避免假阳性的测试结果很重要。
    在实验室中已经证明,这些新型传感器可以很容易地检测到模拟鼻液或捐赠血清中的病毒蛋白或抗体。该团队的下一个目标是确保它们可以可靠地用于诊断环境。
    原文链接:https://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-01/uowh-nbq012821.php

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    • 1.时间:2020年3月19日 2.机构或团队:Science 3.事件概要: Science发表通讯文章“New blood tests for antibodies could show true scale of coronavirus pandemic”,文章提到,世界各地的实验室和公司都在竞相开发抗体测试,其中一些已经用于小型研究并获得了商业批准,其中包括来自中国的一些实验室和公司,但是到目前为止,此类测试的大规模数据仍然缺乏,或者至少是不公开的。一种新的方法可以为实验室提供一种等待或购买商业测试的替代方法。西奈山伊坎医学院的病毒学家弗洛里安·克拉默(Florian Krammer)和他的同事发表了预印本论文,描述了他们已经开发出的SARS-CoV-2抗体检测方法以及复制方法。其认为这是最早广泛分发的此类详细协议之一,而且过程非常简单,其他实验室可以轻松地将其扩展为“每天筛查数千人”,并迅速收集更多有关准确性的数据和测试的特异性。Florian Krammer认为加上商业化检测的可用性不断提高,这意味着有关COVID-19免疫力的一些重要答案可能很快就会出现。 为了进行这项测试,研究人员首先在SARS-CoV-2的衣壳上设计了一个稍有变化的“刺突”蛋白版本。他们还分离了称为受体结合域(RBD)的刺突蛋白的短片段,该病毒用于附着到它试图入侵的细胞上。然后,他们使用细胞来产生大量改变的刺突蛋白和RBD。 这些实验室制造的分子为ELISA测试提供了基础,在该测试中,血液或血浆样品中的抗体在识别目标蛋白(此处为RBD或刺突蛋白)时会触发颜色变化。对三名确诊的COVID-19患者的四份血液样本以及在疫情爆发前存入的59份血清样本进行的初步测试表明,该测试有效,因为SARS-CoV-2抗体与测试蛋白质结合。它仅对COVID-19患者显示阳性结果,而对所有这些对照均未显示。 广泛的抗体测试还可为流行病流行过程的建模提供关键数据。当前的预测差异如此之大,引起一些科学家质疑是否需要严格的遏制措施,例如封城和社会隔离。通过指出由于轻度感染而已经免疫了多少人口,抗体数据可以提供病毒继续传播速度的关键。这样的数据可以为实际问题提供信息,例如是否以及如何重新开放已关闭的学校,在儿童中诊断出的病例相对较少,但是目前尚不清楚这是否是因为他们没有被感染,或者是因为他们的感染程度很轻,以至于没有引起人们的注意,测试儿童的SARS-CoV-2抗体应该可以解决该问题。 长期抗体测试还将帮助研究人员了解对病毒的免疫力能持续多长时间,这是未来任何疫苗的关键问题。对于其他冠状病毒,Krammer指出,感染后几个月的免疫力很强,但随后开始减弱。一月份,德国的医生正在从巴伐利亚的一小部分病例中检测COVID-19患者发现感染后一个月,抗体水平仍然很高。 4.附件: 原文链接: https://www.sciencemag.org/news/2020/03/new-blood-tests-antibodies-could-show-true-scale-coronavirus-pandemic
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    • 2月28日_用于快速鉴定和表征新型冠状病毒基因组的基因检测冠状病毒分型工具 1.时间:2020年2月28日 2.机构或团队:比利时Emweb bv;南非夸祖鲁纳塔尔大学健康科学学院检验医学与医学科学学院夸祖鲁-纳塔尔研究创新和测序平台;巴西米纳斯吉拉斯州联邦大学生物科学研究所细胞和分子遗传学实验室;南非艾滋病研究计划中心等 3.事件概要: Bioinformatics于2月28日出版了比利时Emweb bv和南非夸祖鲁纳塔尔大学等发表的论文“Genome Detective Coronavirus Typing Tool for rapid identification and characterization of novel coronavirus genomes”。 文章指出,Genome Detective是一个基于Web的用户友好型软件应用程序,可以基于下一代测序数据集快速准确地组装所有已知的病毒基因组。此应用程序允许以FASTA格式从组装的基因组中鉴定系统发生簇和基因型。自2019年发布以来,已经为导致大规模疫情的新兴病毒产出了许多分型工具,例如巴西的Zika和Yellow Fever Virus。 在该论文中,作者介绍了该基因检测冠状病毒分型工具,指出该工具可以准确地识别在中国和世界各地分离出的冠状病毒(SARS-CoV-2)的基因序列。该工具每次最多可以提交2,000个序列,分析一个新的全基因组序列大约需要一分钟。该工具已经过来自十种冠状病毒物种的数百个全基因组的测试和验证,并正确分类了所有与SARS相关的冠状病毒(SARSr-CoV)和所有可用于SARS-CoV-2的公共数据。随着疫情在全球范围内的蔓延,该工具还可以跟踪新的病毒突变,这可能有助于加速新型诊断剂、药物和疫苗的开发。 4.附件: 原文链接: https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa145/5766118