2月28日_用于快速鉴定和表征新型冠状病毒基因组的基因检测冠状病毒分型工具
1.时间：2020年2月28日
2.机构或团队：比利时Emweb bv；南非夸祖鲁纳塔尔大学健康科学学院检验医学与医学科学学院夸祖鲁-纳塔尔研究创新和测序平台；巴西米纳斯吉拉斯州联邦大学生物科学研究所细胞和分子遗传学实验室；南非艾滋病研究计划中心等
3.事件概要：
Bioinformatics于2月28日出版了比利时Emweb bv和南非夸祖鲁纳塔尔大学等发表的论文“Genome Detective Coronavirus Typing Tool for rapid identification and characterization of novel coronavirus genomes”。
文章指出，Genome Detective是一个基于Web的用户友好型软件应用程序，可以基于下一代测序数据集快速准确地组装所有已知的病毒基因组。此应用程序允许以FASTA格式从组装的基因组中鉴定系统发生簇和基因型。自2019年发布以来，已经为导致大规模疫情的新兴病毒产出了许多分型工具，例如巴西的Zika和Yellow Fever Virus。
在该论文中，作者介绍了该基因检测冠状病毒分型工具，指出该工具可以准确地识别在中国和世界各地分离出的冠状病毒（SARS-CoV-2）的基因序列。该工具每次最多可以提交2,000个序列，分析一个新的全基因组序列大约需要一分钟。该工具已经过来自十种冠状病毒物种的数百个全基因组的测试和验证，并正确分类了所有与SARS相关的冠状病毒（SARSr-CoV）和所有可用于SARS-CoV-2的公共数据。随着疫情在全球范围内的蔓延，该工具还可以跟踪新的病毒突变，这可能有助于加速新型诊断剂、药物和疫苗的开发。
4.附件：
原文链接：
https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa145/5766118
