《PNAS:颗粒沉降促进海洋微生物群落的垂直联系》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: mall
  • 发布时间:2018-08-09
  • 海洋是地球上最大的生态系统之一,并由原核生物主导着海洋生物生物量和生物多样性。颗粒下沉是一种将物质输送到深海的普遍机制,在全球碳循环中起着重要作用。但这一过程是否能够将表层与深海中的原核生物群落多样性连接起来,又是否在全球范围内普遍存在,尚未可知。2018年7月17日,发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上的一项研究《下沉颗粒促进海洋微生物群落的垂直连通性》(Sinking particles promote vertical connectivity in the ocean microbiome)对该过程的作用进行了论述。研究表明表层和深海原核生物群落之间紧密相连,构成了一个巨大的“海洋元群落”(oceanic metacommunity ),其中的相互作用是通过下沉颗粒的运输来实现。这种由下沉颗粒介导的垂直扩散是深海原核生物群落形成的动力来源。

    在海洋光层中形成的有机颗粒的沉降是将表层碳输送到深海中的主要形式。下沉的颗粒物非常适宜海洋微生物定殖,暗示着下沉颗粒可能在沉降过程中将表层微生物群落转移到深海层中。研究人员通过对16S rRNA基因的Illumina测序来探索海洋微生物组的垂直连通性,一方面表征出与颗粒大小尺度相关的海洋微生物群落的组成,另一方面检测微生物群落在位于大西洋、太平洋和印度洋等不同地区站点的从海平面到水下4000米的群落组成变化。研究发现,在深海中最丰富的原核生物也存在于海洋表层中,并且这种垂直的群落连通性似乎主要通过大型沉降颗粒来实现。因为在整个水体里的大沉降颗粒中的微生物群落具有最高的系统发育相似性,而不依附于沉降颗粒的微生物群落则在垂直水平分布上相对孤立。研究进一步发现,在表层水中发生的微生物定殖沉降颗粒的过程在一定程度上决定了海洋微生物群落的组成和垂直分布。

    该研究发现全球海洋微生物组在整个水体中表现出强烈的垂直连通性。并阐明了这种连接是通过颗粒沉降将定殖其上的表层群落引入深海,突出了沉降颗粒作为微生物运输载体的驱动作用。但是沉降颗粒的组成和下沉率的变化又会如何影响深海群落?又或者,沉降后的微生物是否会回到表层海洋,是否可能存在将它们带回表层的分散机制?这些将是科学家们未来关注的重点。

    (刘晓琳 编译)

  • 原文来源:http://www.pnas.org/content/115/29/E6799
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    • 近日,《科学》(Science)杂志发表了美国加州大学圣塔芭芭拉分校M. R. Raven研究组的最新研究成果。该研究揭示了海洋沉降颗粒物中微生物硫酸盐还原作用和有机硫化物的形成。据介绍,气候变化推动海洋缺氧地带扩大,同时也可能会改变全球碳、硫、氮和金属微量元素循环。但当前人们对缺氧如何影响有机碳循环和沉积机理尚缺乏全面的了解。 本此研究不仅报道了发生在热带太平洋东部缺氧区(ODZs)沉降颗粒物中微生物硫酸盐还原作用,还介绍了微生物硫酸盐还原作用形成的硫化物迅速反应生成耐酸水解有机硫的过程。发生在颗粒物中的硫化作用可以增强缺氧地带水柱下沉物中碳的保留,并在不断扩大的缺氧带和大气CO2之间形成稳定的相互作用。类似的机制可能有助于解释地球历史中与海洋缺氧事件有关的更极端的有机碳保存事件。 占全球海洋0.35%的热带太平洋东部地区和阿拉伯海的缺氧区(ODZs)目前正在迅速扩大,这是对人为气候变暖的明显反应。ODZs海水中溶解的O2浓度通常低于?1 μM,甚至为零。在没有充足O2的情况下,动物很难在ODZs存活,而微生物则只能依靠硝酸盐、铁铁和硫酸盐等化能合成作用生存。正常情况下,只有在局部消耗了硝酸盐等能量更强的电子受体时,才有望发生微生物硫酸盐还原(MSR)反应。然而新的分子和地球化学证据表明,在ODZs中即使存在大量溶解硝酸盐,MSR仍可能发生。活跃的MSR在ODZs可以从根本上改变其他元素的生物地球化学循环,因为其产生的任何硫化物都可以与金属和有机物迅速发生反应,这一过程被称为硫化作用。地质历史时期发生了多次海洋脱氧事件,如白垩纪海洋缺氧事件,而硫化反应可能是海洋可溶痕量金属和全球大气CO2潜在的重要汇积方式。尽管如此,我们仍不清楚MSR是否是ODZs生物地球化学的主要贡献者,以及它影响沉积物有机碳通量的机理。 在现代ODZs中,海洋沉降颗粒物承载的微生物硫酸盐还原作用和硫化作用在时间和空间上都具有明显的差异性,这使得人们无法估算其对全球范围内有机碳过早埋藏产生的影响。但是,人们希望通过扩大的ODZs来增大海洋颗粒承载的硫化作用规模,从而起到更好的碳固定作用,降低大气中CO2含量,较少全球温室效应。未来使用这种采样方法进行的研究将使我们能够量化全球范围内颗粒承载的MSR和OM硫化的规模和环境敏感性。 (傅圆圆 编译)
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    • 美国夏威夷大学(University of Hawaii at Mānoa,UH Mānoa)、伍兹霍尔海洋研究所(Woods Hole Oceanographic Institution,WHOI)以及蒙特里杰克海湾水族馆研究学会(Monterey Bay Aquarium Research Institute,MBARI)的研究人员经过多年的开发测试,成功证实自主式水下机器人(Autonomous Underwater Vehicle,AUV)可以跟踪和研究某个远洋涡流移动的微生物群落。这项研究成果于2021年1月13日发表在《科学机器人》(Science Robotics)期刊上。 海洋微生物是全球气候系统中必不可少的角色,它们生产了全世界约一半的氧气,同时清除了二氧化碳,形成了海洋食物网的基础。远洋涡流直径可达100公里,持续数月。当这些旋涡在北半球逆时针旋转,将营养丰富的水从深处带到海面时,促进浮游植物生长。许多海洋微生物生活在开放的海域,称为深度叶绿素最大值(Deep Chlorophyll Maximum,DCM)。在这一海洋层中,来自上方的光线和来自下方的营养物质汇聚在一起,为浮游植物创造了理想的生存环境。 MBARI的高级机械工程师Brett Hobson认为,目前面临的最大挑战是找到一种可以让人类和机器人彼此通信的方法,跟踪DCM并对其进行取样。DCM的位置可以在短短几小时内垂直移动30米,这种时间和空间上的变化则需要一种可以嵌入DCM及其周围、并在其漂流时跟踪微生物群落的设备。 2018年3-4月,研究人员利用卫星成像定位夏威夷群岛以北的一个涡旋。他们部署了一个由三个水下机器人组成的高科技团队——两个远程自主水下航行器(LRAUVs)和一个波浪滑翔机水面航行器。第一架LRAUV(Aku号)充当了主要采样机器人,用于定位、跟踪和取样DCM,机载的第三代环境样品处理器(3G ESP)过滤并保存海水样品,使研究人员能够捕捉到一系列生物体遗传物质和蛋白质。第二架LRAUV(Opah号)通过声学跟踪Aku号,并在其周围垂直盘旋,以收集有关DCM周围环境的关键信息。Aku和Opah号携带了一套传感器来测量温度、盐度、深度、溶解氧浓度、叶绿素浓度、光学后向散射和光合有效辐射。Aku号每次作业时长可达几天,而Opah号每隔几小时就浮出水面,通过卫星将信息传回给船上的科学家。波浪滑翔机水面航行器(Mola号)也通过声纳跟踪Aku号,并与船上的科学家保持通讯。 这些机器人船队现在也被用于监测其他对海洋健康的关键干扰因素,如有害的海藻繁殖和石油泄漏。由于气候变化、污染和过度捕捞等人类活动,海洋正在经历快速变化,这项技术有潜力改变我们理解和预测海洋健康的能力。 (刘思青 编译)