《印太江豚种内高度分化研究获进展》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: 姜丽华
  • 发布时间:2023-03-04
  • 江豚为鼠海豚科下的一个属即“江豚属”,广泛分布于印度洋、西太平洋沿海以及中国长江中下游淡水流域。目前,研究认为江豚包含两个种,即窄脊江豚(包括长江江豚亚种和东亚江豚亚种)和印太江豚(“宽脊江豚”)。长江江豚是唯一生活在淡水流域的鼠海豚种群,凭借小巧的身型和可爱的“微笑”名扬海内外。在江豚可爱的外表之下,掩盖着一个令人难以接受的事实——它们已濒临灭绝,而针对江豚(尤其是生活在沿海的东亚江豚亚种和印太江豚)的保护关注度和保护行动仍然匮乏。由于江豚属各种群的遗传信息不全面,造成该属的空间遗传结构至今尚不清楚、系统地理学认知匮乏,进而造成物种分类不甚清晰。来自中国和泰国的合作研究团队使用线粒体和常染色体DNA标记,研究了从中国东海到泰国湾江豚的空间遗传结构。相关研究成果发表在Water Biology and Security上。

      “为更好地说明研究区域内江豚的遗传类型,我们增加了来自台湾海峡的窄脊和宽脊江豚样本(通常被视为属内种间分化水平)作为参考。”中国科学院深海科学与工程研究所博士林文治分享道,“我们在研究区域内发现了至少四个遗传种群,分别对应于台湾海峡的窄脊江豚种群和宽脊江豚种群,以及来自珠江口的种群和泰国湾种群。”最小间距网状图(minimum spanning network)显示生活在中国水域的江豚多存在共享单倍型。而来自泰国湾的江豚却形成了独特的单系群,其与南海其它宽脊江豚种群之间的遗传分化水平也高于迄今已知的大多数江豚种群间的分化水平。“Mantel检验检测到南海不同区域种群的地理和遗传差异存在强相关性,表明因距离隔离造成的分化在它们的近期演化中一直在逐步累积。”林文治补充道。

      研究进一步提出,相邻区域种群之间分化水平较低,提示地理距离较近的群体之间可能存在低水平的基因流。若如此,明确进化显著单元是明确保护对象并合理统筹分配保育资源的重要前提。

      深海所研究员李松海总结道:“应仔细评估种群间的连通性,为了维持必要的基因流需要采取保护行动。”

  • 原文来源:https://www.cas.cn/syky/202303/t20230302_4876554.shtml
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    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2023-03-14
    • 江豚为鼠海豚科下的一个属(即“江豚属”),广泛分布于印度洋、西太平洋沿海以及中国长江中下游淡水流域,目前认为包含两个种,即窄脊江豚(包括长江江豚亚种和东亚江豚亚种)和印太江豚(即“宽脊江豚”)。长江江豚是唯一生活在淡水流域的鼠海豚种群,凭借小巧的身型和可爱的“微笑”名扬海内外。 在江豚可爱的外表之下,掩盖着一个令人难以接受的事实——它们已经濒临灭绝,而针对江豚(尤其是生活在沿海的东亚江豚亚种和印太江豚)的保护关注度和保护行动却仍然十分匮乏。更为严峻的是,印太海域不同地区间针对江豚的研究投入不成比例的现象十分严重。由于江豚属各种群的遗传信息不全面,造成该属的空间遗传结构至今尚不清楚、系统地理学认知匮乏,进而造成物种分类不甚清晰。 为填补这一关键的认知空白,一个来自中国和泰国的合作研究团队使用线粒体和常染色体DNA标记,共同研究了从中国东海到泰国湾江豚的空间遗传结构。这项合作研究的结果发表在中国科学院水生生物研究所主办期刊Water Biology and Security上。 “为更好地说明研究区域内江豚的遗传类型,我们还增加了来自台湾海峡的窄脊和宽脊江豚样本(这通常被视为属内种间分化水平)作为参考。”该研究论文的第一作者、中国科学院深海所博士林文治分享道,“我们在研究区域内发现了至少四个遗传种群,分别对应于台湾海峡的窄脊江豚种群和宽脊江豚种群,以及来自珠江口的种群和泰国湾种群。” 最小间距网状图(minimum spanning network)显示生活在中国水域的江豚大多存在共享单倍型。但来自泰国湾的江豚却形成了独特的单系群,其与南海其它宽脊江豚种群之间的遗传分化水平也高于迄今已知的大多数江豚种群间的分化水平。 “Mantel检验检测到南海不同区域种群的地理和遗传差异存在强相关性,表明因距离隔离造成的分化在它们的近期演化中一直在逐步累积。”林博士补充道。 研究团队还指出,相邻区域种群之间分化水平较低,提示地理距离较近的群体之间可能存在低水平的基因流。若如此,明确进化显著单元是明确保护对象并合理统筹分配保育资源的首要前提。 该研究的通讯作者、中国科学院深海所研究员李松海总结道:“还应该仔细评估种群间的连通性,为了维持必要的基因流需要采取保护行动。” 相关论文信息: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2772735122001226
  • 《研究认定长江江豚为独立物种:与海江豚出现生殖隔离》

    • 来源专题:长江流域资源与环境知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:changjiang
    • 发布时间:2018-04-12
    •  最新研究显示,长江江豚其实是独立于海江豚的物种。   在此之前,长江江豚曾与东亚江豚(海江豚的一种)共同被认为是窄脊江豚的两个亚种,两者形态十分相似、难以区分。而此研究成果,令鲸豚类物种由原来的89种增加为90种,这对于长江中唯一的鲸类动物长江江豚来说意义非凡。   11日晚,该项目负责人、南京师范大学生命科学学院教授杨光向澎湃新闻(www.thepaper.cn)称,通过大样本全基因组测序,来自南师大、美国加州大学伯克利分校、华大基因的科研人员将长江和中国沿海不同水域的49只江豚的基因组数据进行比较分析,发现长江江豚与海洋江豚之间存在着显著而稳定的遗传分化,已形成独立的进化支系。 发表在学术期刊《自然通讯》上的最新研究成果 《自然通讯》论文原文截图发表在学术期刊《自然通讯》上的最新研究成果 《自然通讯》论文原文截图 论文原文截图论文原文截图   该科研成果于4月10日发表于学术期刊”Nature Communication”(《自然通讯》)上,论文题目为“Population genomics of finless porpoises reveal an incipient cetacean species adapted to freshwater”(《针对江豚的群体基因组学揭示了一种适应淡水的鲸类物种》)。   据杨光介绍,研究发现一些与水盐代谢和渗透调节相关的基因在长江江豚中出现了显著的正选择,提示它们为了适应与海洋高盐环境完全不同的淡水低渗环境,已经出现了适应性进化,从而更好地在淡水环境下维持体内的水盐平衡。而这种显著的遗传分化与适应性进化,提示它们之间缺乏基因交流而出现了生殖隔离。 长江江豚曾与东亚江豚都被看作窄脊江豚的亚种 南京长江江豚保护微信公众号 图长江江豚曾与东亚江豚都被看作窄脊江豚的亚种 南京长江江豚保护微信公众号 图   公开资料显示,长江江豚(学名:Neophocaena asiaeorientalis)属于鲸目、鼠海豚科、江豚属之下的窄脊江豚,是长江中唯一的鲸类动物。由于多年来数量下降迅速,被农业部要求按照国家一级野生保护动物加强保护(目前仍为国家二级保护动物),在世界自然保护联盟(IUCN)濒危物种红色名录中被列为极危(CR)。 中国江豚的分布 南京长江江豚保护微信公众号 图中国江豚的分布 南京长江江豚保护微信公众号 图   长江和海洋江豚曾被认为是同一个物种下的三个亚种,后又被认定为两个物种——窄脊江豚(又分为长江江豚、东亚江豚两个亚种)和印太江豚。其中,印太江豚以台湾海峡为界,在海峡以南的南海、东南亚、印度洋海域生存,而窄脊江豚则在海峡以北的东海、黄海、渤海及朝鲜半岛和日本海域、长江流域活动。   印太和窄脊江豚在形态上区分的显著特点是其脊背的宽窄和上面疣粒数量多少,而窄脊江豚中的长江江豚和东亚江豚用肉眼尤其难以辨别。   11日晚,长期关注江豚的中国科学院水生所研究员王克雄告诉澎湃新闻,他认为杨光等人的此次研究很有意义,是很重要的工作,“江、海亚种间长期地理隔离,缺少基因交流,那么形成各自独立的种便是必然的。研究成果凸显了长江江豚保护不可替代的价值和升级的急迫性”。