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《挖掘冠状病毒基因组以寻找爆发起源的线索》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2020-02-05

  • 2019-nCoV具有将近29,000个核苷酸的碱基，这些碱基具有遗传指导以生产该病毒。尽管它是许多以RNA形式存在基因的病毒之一，但科学家们将病毒基因组转换为DNA，并以A，T，C和G的缩写来简化研究。2019-nCoV的序列中的许多分析已经出现在virological.org，nextstrain.org，预印本服务器bioRxiv，甚至在同行评审期刊。中国研究人员对这些序列的共享使世界各地的公共卫生实验室都可以开发自己的病毒诊断方法，目前已经在其他18个国家中发现了这种病毒。

    当第一个2019-nCoV序列可用时，研究人员将其放置在已知冠状病毒的家谱上，该冠状病毒丰富且感染许多物种，并发现它与蝙蝠中的亲戚关系最密切。武汉病毒研究所冠状病毒专家石正丽领导的研究小组于1月23日报道了2019-nCoV的序列与蝙蝠病毒有96.2％的相似性，与导致严重急性呼吸系统综合症（SARS）的冠状病毒有79.5％的相似性，这种疾病的首次爆发也是在15年前的中国。但是SARS冠状病毒与蝙蝠病毒有着相似的密切关系，序列数据有力地证明了它在与人类SARS病毒相差仅10个核苷酸的地方从冠状病毒跳入人们的视线。这就是为什么许多科学家怀疑蝙蝠与2019-nCoV之间存在“中间”宿主物种的原因之一。

    根据Bedford的分析，石正丽研究团队强调的蝙蝠冠状病毒序列称为RaTG13，与2019-nCoV的差异接近1100个核苷酸。在她共同创建的网站nextstrain.org上，贝德福德（Bedford）创建了冠状病毒家族树，其中包括蝙蝠，麝猫，SARS和2019-nCoV序列。

  • 原文来源：;https://www.sciencemag.org/news/2020/01/mining-coronavirus-genomes-clues-outbreak-s-origins
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