1.时间:2020年1月23日、2020年1月25日
2.机构或团队:英国爱丁堡大学、斯克里普斯研究所
3.事件概要:
英国爱丁堡大学的分子进化学教授Andrew Rambaut的团队、斯克里普斯研究所的免疫学和微生物学系副教授Kristian Andersen的团队,分别对通过Genbank、GISAID、中国国家基因库获取的新型冠状病毒2019nCoV全长基因组进行了分子进化分析,在病毒学论坛virological (http://virological.org)发布了结果。从1月23日和1月25日分别发布至今,两个团队一直在进行数据更新,目前的分析结果都提示2019nCoV源自共同的祖先。
Andrew Rambaut目前对25份样本进行了比对分析,更新数据里包括两组来自美国的样本。他维持早前的判断,迄今为止,测序的病毒基因组几乎没有遗传变异,这表明采样和测序的病毒是最近才起源的。仅凭这些基因组序列,尚无证据表明在12月最初的武汉集群之后,非人类动物还有其他人畜共患病的跳跃现象,但目前的序列数量非常有限。
Kristian Andersen目前对30份样本进行了比对分析,同样使用PhyML创建了系统发育树,并与先前的分析一致,仍然显示出采样病毒中的遗传变异有限,这与最近的共同祖先是一致的。遗传数据仍然强烈暗示单点引入人类,然后持续的人与人之间的传播,没有人畜共患病传播的进一步证据。
4.附件:
http://virological.org/t/phylogenetic-analysis-of-23-ncov-2019-genomes-2020-01-23/335
http://virological.org/t/clock-and-tmrca-based-on-27-genomes/347/