借助萤火虫荧光蛋白（LUC）筛选系统，发现在DNA去甲基化关键蛋白ROS1的突变体中，报告基因的启动子区域由于表观修饰的改变而导致LUC报告基因沉默。有趣的是即使ROS1基因的突变被恢复到野生型，LUC报告基因的沉默状态依然能够稳定地遗传到后代（后代株系称为WT-LUC')。沉默表达的LUC'能够使稳定表达的LUC发生基因沉默，新生成的LUC'不仅能够稳定遗传沉默状态，而且还能改变稳定表达的LUC使其成为LUC'。遗传学分析表明：等位遗传的发生与维持依赖于多拷贝重复序列上DNA甲基化水平（尤其是CG和CHG甲基化）的升高和组蛋白异染色质化，形成一种稳定的、不可逆转的基因沉默状态；其维持和传递的过程是在DNA甲基化，组蛋白修饰和小分子RNA多重基因沉默途径相关重要蛋白的共同参与下，使该位点的沉默状态稳定地遗传给子代和等位位点。
等位遗传的存在并非是一个偶然事件，而是生物适应环境的一个重要表现，对于植物尤其重要。发生等位遗传的亲本传递了一个环境变化的讯号，从而使后代可以和其亲本一样在类似环境下生存，这样更有利于提高植物对环境的适应性。该研究成果系统地解析了DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等在等位遗传发生、维持与传递过程中的重要贡献。解析等位遗传的分子机制，将为植物响应环境应答，作物分子设计育种提供一套新的理论基础和指导。
