《南非夸祖鲁-纳塔尔地区广泛耐药结核病传播的空间格局》

  • 来源专题:结核病防治
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2018-07-24
  • 背景

    传播正在推动全球耐药性结核病(TB)流行;近四分之三的耐药结核病病例可归因于传播。疾病发生率的地理模式与可能的传输链路信息相结合,可以定义传输的空间尺度,并产生关于驱动传输模式的因素假设。

    方法

    我们将全基因组测序数据与全球定位系统的坐标相结合,共有来自南非夸祖鲁-纳塔尔的从2011年到2014年被诊断出来的344名广泛抗药性(XDR)结核病参与者。我们的目的是确定是否存在基因组相关(差异≤5个单核苷酸多态性)病例,从而表明当地社区环境在传播中起作用。

    结果

    182位研究基因组相关参与者,包括1084个病例对。病例对家庭的中位数距离为108公里(四分位距离,64-162公里)。与区内相比,区域间的链接占基因组链接的大多数(912/1084 [84%])。一半(526 [49%])基因组链接涉及来自夸祖鲁-纳塔尔省城市中心德班的案例。

    结论

    与德班之间的高比例区域间联系对全省广泛耐药结核病传播提供了可能的驱动因素,包括城乡迁移。进一步的研究应侧重于确定这些驱动因素对夸祖鲁-纳塔尔省广泛耐药结核病传播的贡献,为制定有针对性的策略以遏制抗药性结核病流行提供信息。

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    •        将Xpert MTB/RIF(Xpert)检测技术引入南非用于辅助治疗那些需要等待表型或基因型药敏试验来确诊的耐利福平结核病患者被认为是有必要的。基于此,来自夸祖鲁-纳塔尔大学、南非国家卫生实验室服务部及南非艾滋病项目研究中心的研究人员合作研究了Xpert对夸祖鲁-纳塔尔省耐药结核病负担最重地区的人群结核病诊断和管理的影响,其相关成果于2014年8月16日发表在BMC Infectious Diseases上。         回溯性搜集2011年3月至2012年4月间接受Xpert检测的所有利福平耐药患者。比较Xpert检测结果和表型或基因型药敏试验结果。基于患者的病历记录来确定其初始治疗时间。        在637名接受Xpert检测的患者当中,50%得到确诊,其中三分之一的患者于当天再次接受Xpert检测。研究发现利福平的不一致率和单耐药率分别为8.8%和13.4%,且表型或基因型药敏试验诊断结果间没有差异。在那些已经开始接受治疗的患者中,有28%、40%、21% 和8%的患者分别于2周、1个月、2个月和3个月内接受了Xpert检测。此外,剩余3%的患者没有接受任何治疗,仍处于观察阶段。        需要说明的是,Xpert检测技术的使用需要遵从一些检测算法,这样才能使所有的利福平耐药患者得到确诊,以确保对其进行适当的管理。然而,尽管Xpert检测时间短,但本研究中仍有约70%的患者在一个月内才开始接受治疗,提示还需要进一步完善卫生系统以缩短疾病的治疗时滞。
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    • 编译者:李阳
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    • 为了深入了解高发人群中耐药结核病的出现和进化,来自伦敦大学玛丽女王学院、韦尔科姆基金会桑格研究所等机构的研究人员通过对从1000名来自俄罗斯某一抗药性结核病高发地区的结核病患者体内分离出的结核杆菌进行全基因组测序,来分析能够决定耐药结核病传播能力和发病率的分子机制,其相关成果于2014年1月26日发表在Nat Genet上。 研究人员分析了俄罗斯抗药性菌株的结构,发现其属于两种主要的谱系:其中642个属于北京谱系(由2个同质分化枝主导),355个属于欧美谱系。此外,在48%的分离样本及87%的主要分化枝中发现了多重耐药基因型。 研究发现最常见的rpoB基因突变常伴随互补性的rpoA或rpoC基因突变,且明确了一种新的基因补偿性置换模式。此外,还发现有16%的菌株为多重耐药合并广泛耐药,65%的多重耐药菌株存在eis基因突变现象,如果采用卡那霉素治疗,则会使菌株毒力得到进一步的增强。 研究发现耐药性和补偿突变模式相结合能够增强菌株的临床耐药性、健康程度和传播性。此外,在俄罗斯及其它地区,还存在一些能够维持耐多药和广泛耐药结核病稳定性和蔓延状况的生物因素有待进一步研究。