背景
传播正在推动全球耐药性结核病(TB)流行;近四分之三的耐药结核病病例可归因于传播。疾病发生率的地理模式与可能的传输链路信息相结合,可以定义传输的空间尺度,并产生关于驱动传输模式的因素假设。
方法
我们将全基因组测序数据与全球定位系统的坐标相结合,共有来自南非夸祖鲁-纳塔尔的从2011年到2014年被诊断出来的344名广泛抗药性(XDR)结核病参与者。我们的目的是确定是否存在基因组相关(差异≤5个单核苷酸多态性)病例,从而表明当地社区环境在传播中起作用。
结果
182位研究基因组相关参与者,包括1084个病例对。病例对家庭的中位数距离为108公里(四分位距离,64-162公里)。与区内相比,区域间的链接占基因组链接的大多数(912/1084 [84%])。一半(526 [49%])基因组链接涉及来自夸祖鲁-纳塔尔省城市中心德班的案例。
结论
与德班之间的高比例区域间联系对全省广泛耐药结核病传播提供了可能的驱动因素,包括城乡迁移。进一步的研究应侧重于确定这些驱动因素对夸祖鲁-纳塔尔省广泛耐药结核病传播的贡献,为制定有针对性的策略以遏制抗药性结核病流行提供信息。