2型糖尿病（T2D）是一种慢性疾病，由于胰岛素抵抗和胰岛素分泌不足从而造成血糖水平升高，并且其发病率在世界范围内增加以惊人的速度。遗传和环境因素，以及一些危险因素，包括年龄，家族史，饮食习惯，久坐的生活方式，与肥胖之间的相互作用对此复杂疾病的影响结果已确定。最近的研究肠道宏基因组分析也指出，人类肠道菌群的生态失调与T2D相关联。考虑到含有人体十倍人类细胞更多的细菌，它必须确定人体肠道微生物到T2D发病的具体贡献，以便有效的治疗策略的发展。然而，大多数早期的肠道宏基因组研究联肠道菌群的组成和慢性疾病的未占治疗方案对肠道微生物的组合物的影响。2型糖尿病（T2D）与肠道菌群的生态失调相关联，糖尿病的治疗方案，包括二甲双胍，可能混淆2型糖尿病对肠道菌群的影响结果。
