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《3月30日_研究人员分析SARS-CoV-2 B.1.1.7在美国的出现和快速传播情况》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2021-04-02

  • 斯克里普斯研究所和加利福尼亚大学等机构的研究人员3月30日在期刊Cell上在线发表了题为“Emergence and rapid transmission of SARS-CoV-2 B.1.1.7 in the United States”的文章。
    文章称，在英国发现的具有高度传染性的SARS-CoV-2变体B.1.1.7，现已在全球范围内传播。研究人员利用S基因靶标失效（SGTF）和SARS-CoV-2基因组测序调查了该变异体在美国的流行情况和动态，追溯其在美国早期出现的情况。研究人员发现，B.1.1.7以对数速率增加，每周约增加一倍，使传播速率增加了40%-50%。研究人员发现早在2020年11月下旬就有几例B.1.1.7病毒进入美国，社区传播使得该变异体在几个月内就被传播到美国大多数州。研究表明，B.1.1.7在美国成为SARS-CoV-2主要毒株的轨迹与在该变异体在其他国家传播的轨迹相似，美国需要立即采取果断行动，以最大程度地降低COVID-19的发病率和死亡率。
    原文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00383-4#

  • 原文来源：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00383-4#
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    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-03-23
    • 伦敦大学的研究人员3月15日在期刊Nature上在线发表了题为“Increased mortality in community-tested cases of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7”的文章。 文章称，SARS-CoV-2系B.1.1.7是2020年9月在英国首次检测到的变异体，已传播到全球多个国家。几项研究已经确定，B.1.1.7比以前检测到的变异体更容易传播，但尚不确定它是否会导致疾病严重程度发生变化。研究人员分析了2020年9月1日至2021年2月14日期间在英国社区检测到的2245263例SARS-CoV-2阳性病例和17452例COVID-19死亡病例的数据集。在1146534例（51%）的检测中，可以确定B.1.1.7与否，因为该谱系的突变阻止了病毒刺突蛋白基因靶点的PCR扩增（S基因靶点失效，SGTF1）。已知4945例死亡病例为SGTF状态，研究人员估计，在调整年龄、性别、种族、贫困程度、养老院居住、当地居住和测试日期后，与SGTF相关的死亡风险为55%（95% CI：39-72%）。这相当于55-69岁男性在社区被检测为COVID-19阳性后，28天内死亡的绝对风险从0.6%增加到0.9%（95%CI：0.8-1.0%）。修正SGTF的错误分类和SGTF状态的缺失后，研究人员估计与B.1.1.7相关的死亡风险增加到61%（42-82%）。分析表明，B.1.1.7不仅比预先存在的SARS-CoV-2变异体更具传播性，而且可能会导致更严重的疾病。 原文链接： https://www.nature.com/articles/s41586-021-03426-1#auth-Karla-Diaz_Ordaz
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  • 《3月3日_关于SARS-CoV-2的起源和进化》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-03-05
    • 1.时间：2020年3月3日 2.机构或团队：北京大学、中国科学院上海巴斯德研究所、中国科学院生物安全大科学中心、中国科学院大学、上海大学生命科学学院、中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所 3.事件概要： 北京大学等于2020年3月3日在National Science Review上发表题为“On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2”的文章,研究了SARS-CoV-2与其他相关冠状病毒之间的分子差异程度。 文章指出，尽管他们发现SARS-CoV-2与蝙蝠SARS相关冠状病毒（SARSr-CoV; RaTG13）之间仅4％的基因组核苷酸有差异，但中性位点有17％的差异，表明这两种病毒之间的差异要比以前估计的大得多。作者指出，SARS-CoV-2和穿山甲SARSr-CoVs病毒中刺突蛋白受体结合域（RBD）功能位点的新变异，除了重组外，还可能是由突变和自然选择引起的。研究人员对103个SARS-CoV-2基因组进行的群体遗传学分析表明，这些病毒进化成两种主要类型（命名为L和S），它们显示了迄今为止测序的病毒株之间都相关。虽然L型（?70％）比S型（?30％）更为普遍，但S型是原始版本。虽然L型在武汉暴发的早期阶段更为普遍，但在2020年1月初之后，L型的出现频率有所下降。人类的干预可能对L型施加了更严重的选择压力，L型可能更具侵略性，传播速度更快。另一方面，S型的进化年龄更大，攻击性更弱，可能由于相对较弱的选择压力而增加了相对的出现频率。作者总结，这些发现有力地支持迫切需要对COVID-19患者的临床症状结合基因组数据、流行病学数据和图表记录进行进一步的、即时的、全面的研究。 4.附件： 原文链接： https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463?searchresult=1
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