《Cell | 解析整合素激活构象机制》

  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-05-26
  • 2024年5月20日,波士顿儿童医院Timothy A. Springer、Taekjip Ha共同通讯在Cell发表题为Ligand binding initiates single-molecule integrin conformational activation的文章,利用尖端的单分子荧光共振能量转移(smFRET)技术,对纤连蛋白的主要受体整合素α5β1的构象动力学和激活途径提供了突破性的见解。

    研究人员利用遗传密码扩展将荧光染料掺入整合素α5β1胞外域和全长构建体的特定位置,从而能够实时监测构象变化。令人惊讶的是,他们发现以前被认为是独立事件的整合素腿部伸展和头饰打开是协同运动。配体结合后,α5β1的弯曲闭合(bent-closed, BC)构象在65毫秒内快速转变为延伸开放(extended-open, EO)高亲和力状态,而不经过延伸闭合(extended-closed, EC)中间体。这一显著发现挑战了整合素领域的主流观点,即talin是一种细胞内衔接蛋白,通过与β-亚基细胞质结构域结合来启动整合素激活。相反,作者证明细胞外配体结合是关键的启动事件,通过外-内信号触发整合素激活。与经典模型相反,Talin结合在适度稳定EO状态的同时,不会诱导整合素延伸或开放。重要的是,研究人员观察到,EC状态虽然在结构上介于BC和EO之间,但不是激活途径中的动力学中间体。相反,它可以从EO状态进入,并可能在失活过程中的配体解离中发挥作用。这一发现突出了研究构象动力学以及静态结构的重要性。

    此外,研究表明,只要头部保持闭合,弯曲闭合和伸展闭合状态就不能相互转换,这表明腿部伸展和弯曲需要部分开口。这一观察结果得到了结构分析的支持,这些分析表明,在头部打开时,BC状态下的α和β支腿之间的联锁解除,允许支腿协同延伸。虽然单独的talin结合不足以激活整合素,但研究人员提出,通过配体整合素talin-肌动蛋白细胞骨架复合物传递的张力对于在扩展开放构象中稳定地填充整合素是必要的。这一发现与之前的热力学计算一致,并强调了力在整合素激活中的重要性,特别是在细胞粘附和迁移的背景下。

    总之,这项开创性的研究挑战了关于整合素激活的长期假设,并为整合素α5β1的构象动力学和激活途径提供了前所未有的见解。通过揭示细胞外配体结合的关键作用以及整合素支腿延伸和头部开口的协同性质,作者重新定义了我们对这一重要细胞机制的理解。这些发现对开发针对自身免疫性疾病和癌症中整合素的治疗方法具有重要意义。

相关报告
  • 《Cell | α7烟碱受体变构调节和激活的结构机制》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-02-27
    • 2024年2月20日,加州大学圣地亚哥分校等机构的研究人员在Cell上发表题为Structural mechanisms of α7 nicotinic receptor allosteric modulation and activation的文章。 α7烟碱乙酰胆碱受体是一种五聚体配体门控离子通道,在整个神经系统的胆碱能信号传导中起着重要作用。其独特的生理特征和对神经系统疾病和炎症的影响使其成为一个有前途但具有挑战性的治疗靶点。正变构调节剂克服了传统α7激动剂的局限性,但其增强机制尚不清楚。 该研究展示了α7-调节剂复合物的高分辨率结构,揭示了部分重叠的结合位点,但构象状态不同。结构引导的功能和计算测试表明,调节剂活性的差异源于通道门控残基从孔隙中稳定旋转。研究人员使用时间分辨冷冻电子显微镜 (cryo-EM) 方法扩展了研究,以揭示该同聚体通道的不对称状态转变,并且还发现具有变构激动剂活性的调节剂利用了独特的通道门控机制。这些结果定义了α7变构调节和激活的机制,并在整个五聚体受体超家族中产生影响。
  • 《Nature | 吞噬细胞NADPH氧化酶激活机制》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-02-20
    • 2024年2月14日,北京大学未来技术学院分子医学研究所陈雷课题组在Nature杂志发表题目为Structure of human phagocyte NADPH oxidase in the activated state的文章。该研究报道了人源吞噬细胞NADPH氧化酶处于激活状态和静息状态的高分辨率冷冻电镜结构。 在NOX2早期的研究中常将胞浆组分p47、p67和Rac1的有效片段设计成融合蛋白用于NOX2的体外激活,但由于该融合蛋白亲和力较低,在电镜样品中难以和NOX2膜组分有效结合,从而导致胞浆组分的电子密度难以被捕获。为了解决这一问题,作者们一方面将GFP及其纳米抗体(GFPnb)分别融合在p22和胞浆组分上以提高它们之间的亲和力,另一方面对p47、p67和Rac1之间连接序列的长度及其排列方式进行了优化,最终选择将p22-GFP-p67融合蛋白与NOX2共表达,所形成的复合体能够被脂修饰的GFPnb-p47-Rac1(稳定结合GTP的Q61L突变体)有效激活,具有较高的NADPH氧化酶活力。作者们最终在同一套冷冻电镜数据中通过三维分类同时获得了处于激活状态并包含有胞浆组分的NOX2的电子密度(2.79 )以及处于静息状态下不含有胞浆组分的NOX2电子密度(2.99 )。 电子密度显示:激活状态的NOX2胞内侧与胞浆组分p67、Rac1和p47结合,其中跨膜结构域为NOX家族经典的六跨膜螺旋结构,p67和Rac1组成一个近似“嘴巴”的形状,p67代表“下颌”,Rac1代表“上颌”,两者通过氨基酸相互作用夹住NOX2的脱氢酶结构域(DH)。此外,p47上的一段小肽结合在Rac1 α1和β2之间的裂缝中。p67与DH的结合主要依靠p67 C端向外伸出的激活结构域,第202-208位氨基酸形成的β折叠与NOX2的β1形成反平行式排列,与NOX2结合的Rac1处于GTP结合的状态。DH与p67和Rac1相互作用界面上的部分氨基酸突变会降低NOX2的活力。同时,数个在CGD患者中发现的突变位点也位于该相互作用界面附近,这进一步说明了该相互作用界面对NOX2的激活至关重要。 通过比较静息态结构和激活态结构,作者们发现:在胞浆组分结合后,NOX2的DH结构域会对接到TMD的底部并与TMD的N端形成相互作用。NADPH结合在DH暴露在外侧的裂缝中,其腺嘌呤基团和磷酸基团和裂缝周围的氨基酸发生了相互作用。NOX2的TMD在激活前后没有明显的构象变化,而DH结构域相较于TMD转动了15.7°,形成一种更为紧凑的构象,也缩短了FAD与近胞质侧血红素之间的距离。FAD结合结构域(FBD)相对于NADPH结合结构域(NBD)产生了17.4°的旋转,并缩短了FBD和NBD的距离,使位于FBD上的R356靠近NADPH,与其形成相互作用,稳定了NADPH的结合。 通过比较静息和激活两种状态下的NOX2的构象,作者们发现在胞浆组分组装后,p67-Rac1的结合会导致DH结构域的收缩并对接到TMD上,从而稳定NADPH的结合并将其电子经由FAD、近胞内侧血红素、F215和近胞外侧血红素传递到胞外的氧气,最终产生超氧阴离子。 综上所述,作者们利用冷冻电镜对激活和静息状态下NOX2的结构进行了解析,从原子水平上观察到了胞浆组分p67、Rac1和p47是如何与NOX2结合并引起构象变化的,为深入理解NOX2的激活机制提供了结构基础。