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《SNX11被CRISPR敲除筛选鉴定为SFTS病毒感染的必需宿主因子。》

  • 来源专题：实验室生物安全
  • 编译者： 苑晓梅
  • 发布时间：2019-06-30

  • 伴有血小板减少症综合征病毒（SFTSV）的严重发烧是一种高致病性蜱传导布尼亚病毒，可导致人类致死性传染病和严重发热伴血小板减少症（SFTS）。 SFTSV感染所需的分子机制和宿主细胞因子仍未得到表征。 使用全基因组的基于CRISPR的筛选策略，我们鉴定了宿主细胞蛋白，分选参与细胞内内体运输途径的nexin 11（SNX11），作为SFTSV感染的必需细胞因子。 建立SNX11-KO HeLa细胞系，并显着降低SFTSV复制。

  • 原文来源：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31215001
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相关报告

  • 《Cell：全基因组CRISPR筛选鉴定出对新冠病毒感染至关重要的宿主因子》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-11-02
    • 在一项新的研究中，来自美国耶鲁大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员对暴露于SARS-CoV-2和MERS-CoV冠状病毒的数亿个细胞进行了筛选，鉴定出几十个能使这两种病毒在细胞中复制的基因，也鉴定出一些似乎抑制这些病毒的基因。他们表示，这些基因的促病毒作用和抗病毒作用将有助于指导科学家们开发新的疗法来对抗COVID-19。相关研究结果近期发表在Cell期刊上，论文标题为“Genome-wide CRISPR screens reveal host factors critical for SARS-CoV-2 infection”。 科学家们此前已经确定了导致COVID-19疾病的SARS-CoV-2冠状病毒是如何附着和入侵细胞的，但是对于为什么有些细胞更容易被感染却知之甚少。了解宿主细胞对感染的易感性背后的遗传学，可能有助于解释为什么一些暴露于这种病毒的人很少或没有症状，而另一些人则变得病情危重或死亡。 在这项新的研究中，这些研究人员对绿猴细胞进行了全基因组CRISPR筛选，其中与常用的人类细胞系相比，绿猴细胞在暴露于SARS-CoV-2后更容易死亡。这种筛选首次允许他们同时跟踪病毒和细胞之间的相互作用。这种筛选证实了早先的发现，即编码细胞表面受体的ACE-2基因能促进SARS-CoV-2感染宿主细胞。 然而，这种筛选还发现了两种新的促病毒蛋白复合物和第三种似乎有助于阻止感染的蛋白复合物。他们发现，能开启和关闭基因的SWI/SNF复合物和具有包括调节炎症在内的许多功能的HMGB1与感染后细胞死亡增加有关。 这些研究人员随后加入了抑制已发现的这两种基因产物功能的小分子药物，并发现它们可以增加培养皿中的细胞在感染后的存活率。相比之下，有助于调节细胞核内基因表达的组蛋白H3复合物似乎提供了一种保护作用，这会抑制SARS-CoV-2感染和杀死细胞的能力。 论文共同通讯作者、耶鲁大学医学院免疫生物学助理教授Craig Wilen说，“了解对COVID-19的反应的广泛差异是非常重要的，比如为什么年龄大更有可能使人死亡。我们鉴定出促病毒基因和抗病毒基因，这些基因可能会帮助我们预测谁有可能得重病，以及哪些药物对治疗患者有帮助或有害。” Wilen指出，这些信息不仅可能在当前的COVID-19大流行中有所帮助，而且还有助于为未来新出现的冠状病毒疫情爆发做准备。
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  • 《3月16日_CRISPR筛选识别出冠状病毒进入细胞所必需的宿主因子》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-03-23
    • Biospace网站3月16日消息称，目前已知的人类冠状病毒有7种，还有许多其他未知的冠状病毒仍然存在于动物种群中，种间传播的风险和影响人类的新毒株的出现是一直存在的潜在危险。但是，COVID-19大流行已经一年多了，预防和治疗的选择是有限的。广谱抗冠状病毒药物可以满足现有的医疗需求，并有助于遏制由于种间传播而在未来引起再次暴发。因此，鉴定对冠状病毒复制必不可少的常见宿主因素，是开发广谱抗病毒治疗剂的重要因素。 发表在《自然遗传学》（Nature Genetics）上的全基因组CRISPR研究筛选出了病毒特异性宿主因子和共享宿主因子，这些因子可用于开发抗SARS-CoV-2和人类冠状病毒HCoV-229E（引起普通感冒的病毒之一）的药物。研究人员发现SARS-CoV-2需要溶酶体蛋白TMEM106B才能感染人细胞系和原代肺细胞。MEM106B过表达促进SARS-CoV-2或伪病毒感染细胞，表明其在病毒进入细胞中起作用。研究人员在检查了COVID-19患者气道细胞的单细胞RNA测序结果后得出结论，该蛋白的表达与COVID-19感染相关。TMEM106B是一种由274个氨基酸组成的跨膜蛋白，存在于核内体和溶酶体中，可控制溶酶体的大小、数量、迁移率和运输。研究人员使用CRISPR遗传筛选发现，3型磷酸肌醇3激酶（PI3K）是SARS-CoV-2、HCoV-229E和HCoV-OC43的常见宿主因子。因此，靶向PI3K可能会抑制冠状病毒的感染细胞。 此次研究还发现了大量其他“富集”基因，如PIK3C3基因，它参与了内吞运输和自噬，TMEM41B参与了自噬，EXT1和ITGB6是细胞表面受体表达所需要的，OSBPL9、PTDSS1和TMEM30A参与了脂质稳，CCZ1B、PTPN23和RSG1，参与了膜或囊泡的运输。研究人员指出，移除TMEM106B能引起对SARS-CoV最强的抗性，针对PIK3C3、TMEM41B、EXT1、OSBPL9和TMEM30A的sgRNA也表现出显著的抗性。研究人员还提出，硫酸肝素可能有助于控制COVID-19。研究发现ANPEP、PIK3C3和TMEM41B基因是病毒复制的关键。 研究人员推测，SARS-CoV-2感染通路中TMEM106B表达的重要性，可能使其成为COVID-19严重程度的预后生物标志物。另外，TMEM106B的高表达水平可能是由SARS-CoV-2感染本身引起的。TMEM106B可能促进内膜酸化，缓解SARS-CoV-2基因组进入细胞的细胞质。因此，多重筛查和综合数据对于全面了解SARS-CoV-2和其他冠状病毒感染细胞所需的宿主因子至关重要。 原文链接：https://www.biospace.com/article/-crispr-screening-ids-host-factors-essential-for-coronavirus-entry-into-cells/?keywords=COVID-19
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