《Nature发文称世界各地研究人员寻求新的诊断方法以抗击COVID-19大流行》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-04-05
  • Nature发表通讯文章“Coronavirus tests: researchers chase new diagnostics to fight the pandemic”,调查了病毒诊断测试是如何工作的,为什么世界各地的测试方法各不相同,以及正在开发的基于CRISPR的测试以抗击COVID-19。
    测试内容方面,目前,大多数COVID-19的测试都是使用称为逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的分子生物学主力工具,对来自鼻咽拭子的病毒遗传物质进行的。该测试通过扩增病毒中的特定基因序列来起作用。被称为引物的短互补序列有助于开始复制。但是PCR只能检测人体内存在的病毒。它并没有透露有关已解决的感染的太多信息。如果实验室中的试剂被污染,有时也会产生假阳性结果。全球实验室已针对SARS-CoV-2定制了PCR测试,使用针对该病毒基因序列不同部分的不同引物。
    文章提到对大流行反应迅速的国家/地区,几个国家/地区已经能够测试大量人员。1月下旬韩国出现第一例病例后,韩国迅速而有效地作出了反应,部署了快速检测和监测与检测呈阳性的人有接触的人的组合措施,独立新闻编辑室报道称,2015年爆发中东呼吸综合征后颁布的法规允许迅速批准世卫组织的一项测试,四家公司正在扩大该测试的范围,以每天总共测试10,000人。在中国出现冠状病毒时,新加坡也进行了检测,医院实验室很早就批准了使用其他已批准的PCR测试的绿灯,前提是他们必须与国家实验室一起验证其首批结果,他们还将测试重点放在最基本的病例上,例如肺炎患者或其他方式的高危人群。2003年另一种冠状病毒SARS-CoV-1爆发后,关键的后勤工作就到位了,包括实验室能力,训练有素的人员,试剂和工具。新加坡卫生部传染病科主任介绍道:自从SARS以来,其一直在新加坡准备和加强整个系统,这不是因为COVID-19而创建的。
    文章也提到反应缓慢的国家/地区:卫生专家抨击美国对大流行病反应迟缓,特别是检测的可用性和速度较差,专家说这使该病毒得以不被发现传播,并要求采取严格的社会隔离措施加以遏制。美国卫生官员承认这种差距。在3月12日的国会听证会上,美国国家变态反应与传染病研究所所长Anthony Fauci提到,该国测试人员的能力“失败”,并解释说,美国没有按照目前需要的速度进行测试。由于联邦回应的滞后,西雅图华盛顿大学的病毒学研究实验室成为美国第一个主要的检测行动,研究人员在其中使WHO协议适应了必须使用的试剂和平台。现在,数十个其他实验室和研究联盟也纷纷效仿。
    血清学检查方面,一个很大的目标是开发一种血清学测试,该测试可以通过寻找某人为对抗病毒而产生的抗体来检测过去的病毒感染。这样的测试可以显示病毒在社区中的传播程度,并提供有用的公共卫生信息。
    文章提到其他的测试方法仍有创新的空间,利用基于CRISPR的基因编辑技术来改善测试,在华盛顿大学医学院,病毒学家基思•杰罗姆(Keith Jerome)的团队正在验证和优化由麻省理工学院布罗德研究所(Broad Institute of MIT)和哈佛大学剑桥分校(Harvard)的CRISPR先驱Feng Zhang联合开发的SHERLOCK测试。Feng Zhang提到其已经向世界各地的十几个实验室发送了约1600套试剂盒。位于加利福尼亚州南旧金山的生物技术公司Mammoth Biosciences正在验证一种名为DETECTR的基于CRISPR的冠状病毒检测方法。该技术利用CRISPR机器识别特定基因序列并切割它们的能力。在这个过程中,它还会剪切一个添加到反应中的“报告分子”,从而相对快速地揭示出病毒遗传物质的存在。加州大学旧金山分校的传染病医师查尔斯•邱(Charles Chiu)提到该技术的关键优势在于CRISPR反应具有特异的特异性,可以在5-10分钟内完成。

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00827-6
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    • 1.时间:2020年3月23日 2.机构或团队:Nature 3.事件概要: Nature发表通讯文章“Coronavirus tests: researchers chase new diagnostics to fight the pandemic”,调查了病毒诊断测试是如何工作的,为什么世界各地的测试方法各不相同,以及正在开发的基于CRISPR的测试以抗击COVID-19。 测试内容方面,目前,大多数COVID-19的测试都是使用称为逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的分子生物学主力工具,对来自鼻咽拭子的病毒遗传物质进行的。该测试通过扩增病毒中的特定基因序列来起作用。被称为引物的短互补序列有助于开始复制。但是PCR只能检测人体内存在的病毒。它并没有透露有关已解决的感染的太多信息。如果实验室中的试剂被污染,有时也会产生假阳性结果。全球实验室已针对SARS-CoV-2定制了PCR测试,使用针对该病毒基因序列不同部分的不同引物。 文章提到对大流行反应迅速的国家/地区,几个国家/地区已经能够测试大量人员。1月下旬韩国出现第一例病例后,韩国迅速而有效地作出了反应,部署了快速检测和监测与检测呈阳性的人有接触的人的组合措施,独立新闻编辑室报道称,2015年爆发中东呼吸综合征后颁布的法规允许迅速批准世卫组织的一项测试,四家公司正在扩大该测试的范围,以每天总共测试10,000人。在中国出现冠状病毒时,新加坡也进行了检测,医院实验室很早就批准了使用其他已批准的PCR测试的绿灯,前提是他们必须与国家实验室一起验证其首批结果,他们还将测试重点放在最基本的病例上,例如肺炎患者或其他方式的高危人群。2003年另一种冠状病毒SARS-CoV-1爆发后,关键的后勤工作就到位了,包括实验室能力,训练有素的人员,试剂和工具。新加坡卫生部传染病科主任介绍道:自从SARS以来,其一直在新加坡准备和加强整个系统,这不是因为COVID-19而创建的。 文章也提到反应缓慢的国家/地区:卫生专家抨击美国对大流行病反应迟缓,特别是检测的可用性和速度较差,专家说这使该病毒得以不被发现传播,并要求采取严格的社会隔离措施加以遏制。美国卫生官员承认这种差距。在3月12日的国会听证会上,美国国家变态反应与传染病研究所所长Anthony Fauci提到,该国测试人员的能力“失败”,并解释说,美国没有按照目前需要的速度进行测试。由于联邦回应的滞后,西雅图华盛顿大学的病毒学研究实验室成为美国第一个主要的检测行动,研究人员在其中使WHO协议适应了必须使用的试剂和平台。现在,数十个其他实验室和研究联盟也纷纷效仿。 血清学检查方面,一个很大的目标是开发一种血清学测试,该测试可以通过寻找某人为对抗病毒而产生的抗体来检测过去的病毒感染。这样的测试可以显示病毒在社区中的传播程度,并提供有用的公共卫生信息。 文章提到其他的测试方法仍有创新的空间,利用基于CRISPR的基因编辑技术来改善测试,在华盛顿大学医学院,病毒学家基思·杰罗姆(Keith Jerome)的团队正在验证和优化由麻省理工学院布罗德研究所(Broad Institute of MIT)和哈佛大学剑桥分校(Harvard)的CRISPR先驱Feng Zhang联合开发的SHERLOCK测试。Feng Zhang提到其已经向世界各地的十几个实验室发送了约1600套试剂盒。位于加利福尼亚州南旧金山的生物技术公司Mammoth Biosciences正在验证一种名为DETECTR的基于CRISPR的冠状病毒检测方法。该技术利用CRISPR机器识别特定基因序列并切割它们的能力。在这个过程中,它还会剪切一个添加到反应中的“报告分子”,从而相对快速地揭示出病毒遗传物质的存在。加州大学旧金山分校的传染病医师查尔斯·邱(Charles Chiu)提到该技术的关键优势在于CRISPR反应具有特异的特异性,可以在5-10分钟内完成。 4.附件: 原文链接: https://www.nature.com/articles/d41586-020-00827-6
  • 《清华大学研究人员发文称卫生系统的公平性对于抗击COVID-19疫情至关重要》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-04-07
    • 清华大学医学院公共卫生研究中心科研人员在Nature Medicine发表评论文章“Combating COVID-19: health equity matters”。 文章指出,发展公平的卫生系统是《健康中国2030计划》和可持续发展的核心和原则。地方卫生系统的不均衡导致湖北COVID-19的死亡率远高于中国其他省份,目前正处于疫情的区域应当重视卫生系统的平衡,确保所有人享有平等的治疗机会是赢得这场战争的关键。政府为所有COVID-19确诊和疑似患者提供的医疗补贴消除了患者寻求治疗的财务障碍,同时也能达到控制疾病传播的目的。财务保障只是实现卫生公平的一个方面,社会媒体也是一个重要的渠道,许多患者可以通过社交媒体发布消息,以寻求治疗机会,而对于不会使用互联网的患者(尤其是老年人),其住院机会相对较小。疫情不仅影响了疫区人民的健康,也带了巨大的负面经济影响,收入的减少会损害他们未来的健康,如果不打破这一恶性循环,那么疫区的健康不平衡问题将持续加剧。文章最后指出,在应对当前和未来社会健康危机时,卫生公平是中国健康系统和应急响应政策的核心。