《学术出版是一项全球性的工作:利用开放源码软件促进科研产出的多样性》

  • 来源专题:科技期刊发展智库
  • 编译者: 华宁
  • 发布时间:2023-04-25
  •   每年,公共知识计划(PKP)都会在Dataverse项目上发布一个非常大的而且相当枯燥的数据集。这一公开数据提供了PKP的开源出版软件在世界各地的安装使用情况(其中,OJS指开放期刊系统,OMP指开放专著系统,OPS指开放预印本系统)。

      世界各地采用PKP开源出版软件的规模可能是惊人的,这些数字说明了全球知识交流的一个明显的改进,反映了对全球学术知识库的参与度和贡献度的增加,包括来源、语言、目的以及研究和数据的产生。人们可以从新的角度和不同的视角为本土问题和全球问题找到解决方案。

      《自然》杂志引用了Ginny Hendricks(CrossRef的社区负责人)的话:“人们可能对S计划和欧洲过于痴迷,以至于对其他国家的进展视而不见。” 在分析去年《重新校准学术出版范围》(Recalibrating the Scope of Scholarly Publishing)中的数据集时,PKP的研究团队得出结论:学术交流是一项全球性的工作。

      2021年,OJS的主要数字表明:146万篇文章发表在来自12,000个出版商和机构的34,071种活跃的期刊上。同年,爱思唯尔在约2700种期刊上发表了约60万篇文章。上述对比数据说明,在过去的几年中,基于开源软件的期刊数量和文章数量都有明显的加速增长趋势。当审视这些数据时,越来越清晰是,通过这个快速增长的全球开源工具生态系统,可以促进科研产出多样性的发展。

      对于OJS的用户来说,这些研究来自146个国家(约80%为发展中国家),使用了60种语言进行出版。为了与2019年《赫尔辛基多语言倡议》(Helsinki Initiative on Multilingualism )保持一致,以创造多元化的交流空间,这些期刊中有相当一部分以一种以上的语言运作。

      这个数据集揭示了另一个学术交流的世界,这个世界更具全球性、多样性和包容性,并且,这个世界正在与商业出版环境同步发展。自首次发布OJS以来的20年里,PKP已经发展成为世界上使用最广泛的期刊管理和出版软件,使成千上万的研究人员能够用自己的语言发表其研究,并能被全球索引。但是,对于发达国家从事学术交流的大多数人来说,这个快速发展的世界仍然是不为人知的。

      之所以欧洲和北美出版中心以外的学术产出的重要性没有得到重视,是因为人们共同依赖商业索引服务,而这些服务只收录了发展中国家产出的一小部分。例如,Web of Science仅对使用OJS的1.2%的期刊进行索引和报告,Scopus为7.2%,EBSCOHost为3.4%(相比之下,Google Scholar对使用OJS的约90%的期刊进行索引)。这种缺乏索引的情况意味着在商业主流中严重缺乏能见度,进而成为质疑研究成果的可信度和有效性的一个理由。

      开源平台在依赖技术的行业领域被广泛使用,然而,迄今为止,学术出版在很大程度上违背了这一趋势。OJS和其他许多学术交流领域的开源工具一样,已经开始吸引越来越多的商业伙伴,例如:Ubiquity。在OJS平台上托管了超过700种期刊。通过开源出版解决方案,从不受商业竞争者控制的共享代码中受益。

      为了用户的共同利益,PKP建立了一个社区发展的目标,支持开源软件的研发和资金投入,在此基础上建立服务和解决方案。OJS作为出版业的一个开源解决方案,其快速发展对成千上万需要低成本、高质量解决方案的研究人员和期刊具有吸引力。对于商业出版机构和平台来说,这是一个将不受竞争性商业出版控制的解决方案,并从规模化的共享和统一的资源开发中获益。

      自OJS于2002年首次发布以来,它已成为目前使用最广泛的学术出版平台,使世界各地的研究人员能够参与、介入和丰富这个出版系统的多样性。而这个系统是由发达国家的科学研究和研究机构构成,英语成为科学研究的通用语言,增加了世界上绝大多数人参与和获取知识的障碍。目前,这种情况已经开始转变。

      背景介绍:公共知识计划(PKP)成立于1998年,是西蒙菲莎大学和斯坦福大学的一项研究和发展倡议。其主打产品是免费且开源的期刊、会议及出版软件,以支持开放获取运动。

相关报告
  • 《超越版面费促进公平的学术出版》

    • 来源专题:科技期刊发展智库
    • 编译者:李善麟
    • 发布时间:2023-09-07
    •   在我早期的博客中,讨论了如何克服机构的惰性和开放科学实践中成为共同改变学术出版行业的驱动力。但依然存在一个问题。对谁更有优势?我们倾向于认为美国和欧盟是科学知识的“宇宙中心”。太多关于向开放科学过渡的讨论将这些问题置于全球北方的背景下。学术出版面临着必须解决的全球性挑战。这就是为什么美国公共科学图书馆还致力于支持全球认可的新模式。获取科学出版物最近发布了一项研究,了解开放获取给低收入和中等收入国家带来的挑战和机遇。   虽然涉众相信他们明显受益于开放获取,但实际情况要复杂得多。一方面希望加强能够更好地满足当地需求的本地平台,另一方面又希望参与由北方国家制定的规则,这两者之间存在明显的冲突。在我的第一篇博客中提到了一位非洲的作物科学家,她正是专注这方面的问题。   随着我们开始深化与美国公共科学图书馆全球研究社区的合作,我们的方法以倾听、学习和共同建设为中心。最关键的是我们知道我们的战略和商业模式不能和所追求公平的努力分开。   严格的开放科学方法不会促进所有社区的公平参与。我们需要具有延展性,所以设计了新的期刊: 1.代表开放科学实践的不同社区。 2.是否有包容性的出版标准和编辑政策。 3.根据国家的支付能力让分摊成本更加公平和合理。   分享几个例子。   首先是我们过去几年的工作,为开放科学开发新的商业模式,使我们远离版面费。这些是文章处理费,是作者为发表文章而支付的费用,而不是订阅阅读的费用。当美国公共科学图书馆成立并专注于生物医学科学时,向作者收取出版费用似乎是公平合理的。这些作者获得了巨额资助,如果象征性的费用意味着任何人都可以阅读和重复使用他们的论文,这是值得付出的代价。   但我们没有预料到版面费会变得多么流行,商业发行商会如何利用这一领域,让其会变得多么不公平。免费是不能解决问题的。继续沿着版面费的道路走下去,将进一步剥夺资助较少的领域以及低收入和中等收入国家的研究人员的权利,并有可能加剧现有的不平等。   所以,我们选择了一条不同的道路。当我们去年发布新政策时引入了新的全球平等模式。这种模式为机构提供了一种途径,可以为其作者支付无限制出版物的成本,并消除版面费。不同之处在于每家机构的收费都由银行贷款来调整,以更好地反映其所在地区的经济状况。全球公平模型系统地承认了经济差异。它提供了一个适当的解决方案,使这些地区的作者不需要请求帮助。我们为负担不起版面费的任何研究人员推出了一个强大的出版费用援助计划,但是我们希望,随着我们与科研机构的伙伴关系的扩大,这将不再是研究人员可用的唯一手段,而仅仅是一种后备选择。   第二个例子是我们提高在其他社区进行的研究报告透明度的政策,并限制一项被称为“降落伞科学的行动”。   “降落伞科学”是描述研究人员有时从富裕的西方世界的象牙塔到外国社区进行实地研究的术语。他们收集数据后返回,没有与当地研究人员接触交流或承认他们的贡献。这种差异早在20年前就有报道。研究表明在普通医学期刊上,只有6.5%的研究文章的共同作者来自研究对象所在的国家。   美国公共科学图书馆的政策要求有关伦理、文化和科学方面的考虑以及当地作者的信息。这些信息与编辑和审稿人共享,以帮助评估研究是否符合美国公共科学图书馆的研究完整性标准。我们的政策是与多个研究领域里的全球研究成员都是密切合作的,希望这项政策能够提高人们对全球研究相关问题的认识,为未来制定这一领域的其他政策奠定基础。其他一些发行商也向我们寻求了建议,并实施了类似的政策,最近的例子就是eLife。   地方解决方案也发挥着重要作用。让我们再回到非洲的农作物科学家。她决定在一本非洲杂志上发表她的研究。研究成果的可见度和可及性的提高影响了肯尼亚政府制定学校营养计划,其他非洲国家的政府也采用了这些计划。但讽刺的是富裕国家现在正在采用这些营养发现来支持均衡饮食。   创造更容易出版的开放科学研究只是其中一部分,下个月将讨论接下来我们如何更好地改变所有研究人员的学术出版。
  • 《《全球生物多样性展望》》

    • 来源专题:生物科技领域知识集成服务
    • 编译者:陈方
    • 发布时间:2020-11-17
    • 2020年9月15日,联合国《生物多样性公约》秘书处发布了第五版《全球生物多样性展望》(GBO-5),针对自然的现状提供了最权威评估。GBO-5分为生物多样性促进可持续发展、2020年生物多样性现状以及通往2050年生物多样性愿景之路三部分,其对实现当前爱知生物多样性目标的进展情况进行了最后评估,并借鉴本世纪头二十年的经验教训,指明为实现世界各国政府商定的2050 年“与自然和谐共处”愿景所必需的改变。 1. 生物多样性促进可持续发展 (1)《2011—2020年生物多样性战略计划》 2010年,GBO-3为世界各国政府在商定具有历史意义的《2010-2020年生物多样性战略计划》时所采用的方法提供了背景,使全球社会共同认识到从多个方面入手解决这一问题的必要性;2010年商定的战略包括五项战略目标和20项爱知生物多样性目标,并包括执行、监测和审查方面的支助机制,目标是采取有效的紧急行动,实现2050年生物多样性愿景,即“与自然和谐相处”;2014年,GBO-4成为通往2020年目标的中期检查点,其概述了在每个目标领域中可能采取的行动,加紧实施这些行动有望促进战略计划目标的实现;2015年9月联合国大会通过了一项关于人、地球与繁荣的全面行动计划,题为《变革我们的世界》的《2030年可持续发展议程》包括17项可持续发展目标(SDG),并包括169项为这些目标提供支持的具体目标,各项可持续发展目标被视为“一个整体,不可分割”;2015年还通过了《巴黎气候变化协定》,达成了一项全球共识,将大大降低气候变化的风险和影响并提高适应气候变化的能力,气候变化将成为导致生物多样性丧失越来越重要的驱动因素。 (2)生物多样性平台与实现变革性改变的必要性 生物多样性和生态系统服务政府间科学-政策平台(IPBES)充分描述了生物多样性面临着何等规模的挑战和机遇,特别是2019年发布的《生物多样性和生态系统服务全球评估报告》,其中提请全世界关注生物多样性和大自然对人类的贡献所面临的令人震惊的趋势。IPBES和政府间气候变化专门委员会(IPCC)进行的最新评估都表明,需要实现变革性改变,以解决导致变化的根本性驱动因素,并着重指出现在和今后十年采取行动的紧迫性。国际社会集中关注可持续发展,将其作为本世纪的一个紧迫议程,特别是在政治和公众对话中强调应对气候变化,认为这是一个高度迫切的生存问题,从而为把生物多样性问题纳入主流提供了机会。在就更广泛的可持续发展议程做出选择时,必须把生物多样性充分考虑在内。 2. 2020年生物多样性现状—爱知生物多样性目标的实现进度 鉴于大多数爱知生物多样性目标都规定了2020年的最后期限,因此GBO-5这部分实质上是对20项爱知生物多样性目标中每一项的实现进度进行的最终评估。但总体来看,在全球层面,虽然大多数爱知生物多样性目标取得了重大进展,但20个目标没有一个完全实现,仅有6个目标部分实现。 目标1:人们认识到生物多样性价值及采取哪些措施保护生物多样性(没有实现) 过去十年中听说过生物多样性并了解这一概念的人的比例明显增加。 年轻人对生物多样性的了解似乎增加得更快。最近一项调查显示,在生物多样性最丰富的国家,超过三分之一的人对生物多样性的价值以及保护和可持续利用生物多样性所需的步骤有较全面的认识。 目标2:将生物多样性价值酌情纳入战略和规划进程、核算和报告系统(没有实现) 许多国家报告了将生物多样性纳入各种规划和发展进程的例子。将生物多样性价值纳入国家核算和报告系统的国家呈稳步上升趋势。与此同时,没有多少证据表明生物多样性已经按照目标的要求真正纳入发展和减贫规划。 目标3:消除或改革危害生物多样性的奖励措施、制定有利的积极奖励措施并顾及国家社会经济条件(没有实现) 总体而言,过去十年在取消、淘汰或改革补贴和其他可能危害生物多样性的奖励措施,以及在为生物多样性保护和可持续利用制定积极奖励措施方面,进展甚微。甚至采取措施查明危害生物多样性奖励措施的国家也很少,而在渔业和控制去森林化等领域,有害补贴远远超过积极奖励措施。 目标4:可持续的生产和消费、并将使用自然的影响控制在安全生态限度内(没有实现) 虽然越来越多的政府和企业正在制定可持续生产和消费计划,但这些计划的实施规模不足以消除不可持续的人类活动对生物多样性造成的负面影响。虽然自然资源得到更有效的利用,但对资源的总需求量继续增加,因此使用自然资源的影响仍然远远超过安全的生态限度。 目标5:所有自然生境丧失速度至少减少一半、大幅度减少退化和破碎情况(没有实现) 最近的去森林化速率低于前十年,但只低三分之一左右,一些地区的去森林化速率可能会再次加快。在森林和其他生物群落,尤其是热带地区生物多样性最丰富的生态系统,生境丧失、退化和破碎程度仍然很高。荒野和全球湿地持续减少。河流破碎化仍然是淡水生物多样性面临的一个严重威胁。 目标6:所有鱼群和无脊椎动物种群和水生植物都实行可持续管理、所有枯竭物种的恢复计划和措施到位、渔捞不产生重大有害影响、把渔捞影响限制在安全生态限度内(没有实现) 虽然一些国家和地区在实现这一目标方面取得了实质性进展,但三分之一的海洋鱼类种群被过度捕捞,比例高于十年以前。许多捕捞活动仍在造成不可持续的影响,例如非目标物种副渔获物量和破坏海洋生境。 目标7:农业、水产养殖以及林业的可持续管理(没有实现) 近年来采取农民主导的农业生态学等做法,大力推广可持续农业、林业和水产养殖,全球化肥和农药使用率稳定,不过用量很高。虽然取得了这些进展,但是粮食和木材生产景观中的生物多样性继续下降;粮农生产仍然是全球生物多样性丧失的主要驱动因素之一。 目标8:将污染控制在不危害生态系统功能和生物多样性的范围内(没有实现) 污染,包括过分养分、农药、塑料和其他废物造成的污染,仍然是生物多样性丧失的一个主要驱动因素。尽管人们日益努力改进肥料的使用,但养分水平仍然危害生态系统功能和生物多样性。塑料污染在海洋和其他生态系统中积累,已对海洋生态系统造成严重影响,对其他生态系统的影响尚不为人知。许多国家采取措施尽量减少塑料废物,但不足以减少这一污染源。 目标9:外来入侵物种、进入渠道得到鉴定和排定优先次序,优先物种得到控制或根除、进入渠道得到管理以防止入侵外来物种的进入和扎根(部分实现) 过去十年间,根据外来入侵物种构成的风险及其管理可行性,对其进行鉴定和排定优先次序上,取得了良好进展。多项根除外来入侵物种,尤其是岛屿上的入侵哺乳动物的方案取得成功,惠及本地物种。然而,在全部的入侵物种发生面前,这些成功微不足道。并无证据表明入侵物种的引进数量有所减少。 目标10:到2015年减少对珊瑚礁和脆弱生态系统的多重人为压力,维护其完整性和功能(未能在2015年规定日期完成,到2020年也没有实现) 受气候变化和海洋酸化影响的珊瑚礁和其他易危生态系统仍面临多重威胁。过度捕捞、营养盐污染和沿海开发加剧了珊瑚白化效应。在所有被评估的种群中,珊瑚的灭绝风险增长最为迅速。一些地区硬珊瑚覆盖率显著下降,珊瑚物种也发生变化,支持多样化珊瑚礁生境的能力下降。其他生态系统,尤其是山区和极地地区的生态系统,受气候变化影响严重,其他压力也加剧了影响。 目标11:至少17%的陆地和内陆水域得到保护、10%的沿海和海洋区域得到保护、具有特殊重要性的区域得到保护、保护区在生态上有代表性、保护区得到有效而公平的管理、各保护区的相连性好且融为一体(部分实现) 地球上陆地和海洋被指定为保护区的比例很可能会实现2020年的目标,如果考虑到其他有效地区保护措施和未来的国家承诺,也可能会被超越。然而在确保保护区保护最重要的生物多样性区域,在生态上有代表性,相互连接并与更广泛的陆地景观和海洋景观相连,并得到公平和有效管理等方面,进展却比较有限。 目标12:已知濒危物种免遭灭绝、且其保护状况得到改善和维持(没有实现) 平均而言物种继续趋近灭绝,然而如果没有过去十年采取的保护行动,鸟类和哺乳动物的灭绝数量至少会高出两到四倍。在经过充分评估的生物分类组别中,除非导致生物多样性丧失的驱动因素大幅减少,否则近四分之一(23.7%)的物种将濒临灭绝,所有组别中估计有100万个濒危物种。自1970年以来脊椎动物种群平均下降了三分之二以上。 目标13:保持栽培植物、养殖和驯养动物、野生亲缘物种以及宝贵物种的遗传多样性,制定并执行减少基因损失和保护其遗传多样性的战略(没有实现) 栽培植物、养殖和驯养动物以及野生亲缘物种的遗传多样性依然受到侵蚀。异地种子库有助于保障保护要粮食作物的野生亲缘品种,对未来的粮食安全很重要,但重要粮食作物的野生亲缘品种样品收集很少。濒临危险或灭绝的牲畜品种的比例正在增加,尽管速度比前几年要慢,这表明在防止传统品种衰减方面取得了一些进展。养殖鸟类和哺乳动物的野生亲缘物种更接近灭绝。 目标14:带来重要服务的生态系统得到恢复和保障,同时顾及妇女、土著和地方社区以及贫穷和脆弱群体的需要(没有实现) 生态系统提供社会所依赖的重要服务的能力继续下降,因此大多数生态系统服务(自然对人类的贡献)都在下降。总体而言,贫困和脆弱社区以及妇女因这一下降而受到特大影响。平均而言,负责授粉的哺乳动物和鸟类物种正在走向灭绝,食用和医用物种也是如此。 目标15:生态系统的复原力和生物多样性对碳储存的贡献得到加强从而对气候变化的减缓与适应以及防治荒漠化做出贡献(没有实现) 到2020年恢复15%退化生态系统这一目标进展有限。尽管如此,许多区域正在实施或提出宏伟的恢复方案,可能在加强生态系统复原力和维持碳储量方面取得重大进展。 目标16:到2015年《名古屋议定书》根据国家立法生效和实施(部分实现) 《关于获取遗传资源以及公正和公平地分享其利用所产生惠益的名古屋议定书》于2014年10月12日生效。截至2020年7月,已有126个公约缔约方批准了《议定书》,其中87个缔约方出台了国家遗传资源获取和惠益分享措施,设立了国家主管部门。可以认为《议定书》已经实施。 目标17:到2015年各缔约方已制定、作为政策工具通过和开始执行一项有效、参与性的最新国家生物多样性战略和行动计划(部分实现) 截至本目标规定的2015年12月最后期限,有69个缔约方提交了在通过《战略计划》之后编制、修订或更新的国家生物多样性战略和行动计划(National Biodiversity Strategies and Actions Plans,NBSAP)。后来又有101个缔约方提交了NBSAP,因此到2020年7月,已有170个缔约方按照《战略计划》制定NBSAP,占《公约》缔约方的85%。然而这些NBSAP在多大程度上已被采纳为政策工具,并以有效和参与性的方式在实施,情况各不相同。 目标18:传统知识、创新和做法得到尊重并纳入《公约》中,并在土著和地方社区在各国相关层次上的有效参与下,充分地纳入和反映在《公约》的执行工作中(没有实现) 无论是在全球政策论坛还是在科学界,人们越来越认识到传统知识和可持续习惯使用的价值。然而尽管有些国家取得了进展,但显示传统知识和可持续习惯使用得到广泛尊重和/或反映在与执行《公约》有关的国家立法中或土著人民和地方社区在多大程度上有效参与相关进程的信息有限。 目标19:生物多样性知识、科学和技术已经提高、广泛分享和转让及适用(部分实现) 2010年以来,在生物多样性知识和数据的生成、共享和评估方面取得了重大进展,大数据汇总、建模和人工智能方面的进步为增进对生物圈的了解提供了新机遇。然而在研究和监测的位置以及分类重点方面仍存在严重不平衡。在生物多样性丧失对人类造成的后果方面仍存在信息空白,生物多样性知识在决策中的应用有限。 目标20:依照“资源动员战略”的综合和商定进程较大程度的增加从所有来源动员的财政资源。这一目标将视各缔约方制定和报告的资源需要评估发生变化(部分实现) 过去十年一些国家用于生物多样性的国内资源有所增加,而其他国家基本保持不变。依靠国际资金和官方发展援助,可用于生物多样性的财政资源大约翻了一番。但若考虑到生物多样性资金的所有来源,生物多样性资金的增加似乎不足以满足需求。此外这些资源因补贴对生物多样性有害活动而左支右绌。较少国家在确定资金需求、缺口和优先事项以及制定国家财政计划和评估生物多样性价值上取得进展。 3. 通往2050年生物多样性愿景之路 《2011-2020年生物多样性战略计划》以“与大自然和谐相处”为题,描述了商定的2050年生物多样性长期愿景,为短期和中期行动确定了框架。虽然上一个十年设定的战略目标和具体目标进展有限,但2050年生物多样性愿景仍然是今后指导全球生物多样性行动的基准。 对爱知生物多样性目标的评估清楚显示,继续走“一切照旧”老路将使生物多样性愿景遥不可及。要实现人与自然和谐相处,需要实现土地和森林转型、可持续淡水转型、可持续渔业和海洋转型、可持续农业转型、可持续粮食系统转型、可持续城市和基础设施转型、可持续气候行动转型以及涵盖生物多样性的一体健康转型八个方面的转变。每个领域的转型都有一个共同点,即确认人类的所有活动和福祉都依赖生物多样性,确认当前的经济和其他行为模式对生物多样性的负面影响。多重证据表明,实现2050年生物多样性愿景取决于在多个领域共同采取一系列行动,否则即使一个领域最密集的努力也不能成功“扭转生物多样性丧失的曲线”。 宋琪 摘编自https://www.cbd.int/gbo/gbo5/publication/gbo-5-zh.pdf 原文标题:第五版《全球生物多样性展望》