爱丁堡大学在bioRxiv预印本平台发表论文“Intra-genome variability in the dinucleotide composition of SARS-CoV-2”。
人工改变CpG频率是研制减毒活疫苗的有效方法，如果要将其应用于SARS-CoV-2，我们必须首先了解CpG基序在调控SARS-CoV-2复制中的作用。冠状病毒对CpG的抑制并不会因病毒属的不同而有显著差异，但会因宿主物种和主要复制位点（代表组织趋向性）的不同而有所不同，这支持了病毒CpG含量可能影响跨物种传播的假设。尽管SARS-CoV-2整体表现出强CpG抑制，但这在整个基因组中存在很大差异，包膜（E）开放阅读框（ORF）和ORF10显示不存在CpG抑制，虽然ORF10只存在于冠状病毒的一个子集的基因组中，但E对病毒复制是必不可少的。在整个冠状病毒科中，E基因在CpG组成中表现出非常高的变异，SARS和SARS-CoV-2的CpG含量比从人类分离的其他冠状病毒高得多。系统发育表明，这是一种来自祖先的性状，起源为蝙蝠，而不是人畜共患转移后选择的性状。
*注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
