山东大学联合多家机构在medRxiv预印本平台发表论文“Genome-wide variations of SARS-CoV-2 infer evolution 1 relationship and transmission route”。
严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的突变、起源、分型及突变对分子检测的影响仍有待揭示。为了明确SARS-CoV-2的进化关系及评价目前不同国家使用的引物的检测效率,本文检索了来自多个数据库的373个SARS-CoV-2株基因组序列,并进行全基因组突变分析。基于核苷酸序列C28144T的变异,SARS-CoV-2可以分为A组(117株)和B组(256株)。刺突蛋白基因(S基因)1841位突变A1841G,形成B1亚群(40株,30例来自欧洲和美国病毒株组成,尤其是美国华盛顿)。这些突变很可能受环境或不同人群的免疫选择压力影响。A/B株在流行中的比例呈上升趋势(一月为0.35:1,二月为0.62:1,三月为0.76:1),随着时间的推移,A组病毒株的遗传力似乎更强。根据11个核苷酸位点在流行过程中的变化,推测华盛顿株更像是一个祖先类型,而武汉株则更像A组病毒株的子代。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。