《Nature | 对 700 万接触者的 SARS-CoV-2 传播风险进行数字测量》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-12-24
  • 2023年12月20日,马丁路德·哈勒维腾贝格大学等机构的研究人员在Nature发表题为Digital measurement of SARS-CoV-2 transmission risk from 7 million contacts的文章。

    接触后被SARS-CoV-2感染的可能性有多大?在COVID-19大流行期间,几乎每个人都想知道这个问题。接触追踪应用程序记录了附近智能手机之间的距离和持续时间。尽管支持这一阈值的证据有限,但根据公共卫生政策(如2米15分钟指南)通知了接触者——与确诊病例接触的个人。

    该研究分析了英格兰和威尔士NHS COVID-19应用程序通知的700万联系人,以推断应用程序的测量值如何转化为实际传输。实证指标和统计模型表明,应用程序计算的风险评分与实际传播概率之间存在很强的相关性。远距离长时间曝光与近距离短时间曝光的风险相似。经报告的阳性检测证实的传播概率最初随接触时间呈线性增加(每小时1.1%),并在几天内继续增加。虽然大多数暴露时间较短(中位数为0.7小时,IQR为0.4-1.6),但传播通常是持续一小时至数天(中位数为6小时,IQR为1.4-28)。家庭接触病例占6%,但传播病例占40%。在充分准备的情况下,可以在新病原体出现后数周内,根据数字接触者追踪对风险进行既保护隐私又为公共卫生措施提供信息的精确分析。

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    • 编译者:刘小燕
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    • 病毒通过突变不断变化,因此新变种的出现是预期的事件,而本身并不是引起关注的原因。SARS-CoV-2也不例外。在全球范围内,由于进化和适应过程,SARS-CoV-2多样化。虽然大多数新出现的突变不会对病毒的传播产生重大影响,但某些突变或突变组合可能会为病毒提供选择性优势,例如增加的可传播性或逃避宿主免疫反应的能力。在这种情况下,这些变异可能会增加人类健康的风险,因此被认为是令人关注的变异。 英国在东南、东部和伦敦地区的COVID-19病例率迅速上升,这与新的SARS-CoV-2变种VOC 202012/01的出现有关。截至2020年12月26日,英国已报告了3000多例经基因组测序确认的新变异。除了VOC 202012/01,南非还报告了另一个SARS-CoV-2变种,命名为501.V2,这也是潜在的问题。从10月开始在样本中首次观察到此变种,此后在南非通过全基因组测序(WGS)确认了300多例501.V2变种,现在它已成为病毒的主要形式。 ECDC估计,目前SARS-CoV-2 VOC 202012/01和501.V2在EU / EEA中引入并进一步传播的可能性很高。尽管没有信息表明这些菌株的感染更为严重,但由于传播性增加,COVID-19疾病在住院和死亡方面的影响被认为是很高的,特别是对于年龄较大或有并发症的患者。 建议会员国根据其当地的流行病学情况和国家政策,继续向其公民通报非药物干预的必要性,尤其是考虑避免不必要的旅行和社交活动的指导。 会员国应继续监测传播率或疾病严重性的突然变化,作为确定和评估变异影响的过程的一部分。应该对地方,区域和国家情况进行数据分析和评估,以查明流行病学快速变化的地区。 国家公共卫生当局应通过基于案例的预警和响应系统和欧洲监视系统,将新变体以及任何其他可能引起关注的SARS-CoV-2新变体告知。 为了能够检测到已知变体的引入以及令人关注的新变体的出现,会员国需要对重要的代表性分离株进行及时的基因组测序。英国已证明其测序程序能够检测新兴变异。
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    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-10-20
    • 2023年10月18日,牛津大学等机构的研究人员在Nature上发表题为The burden and dynamics of hospital-acquired SARS-CoV-2 in England的文章。 医院传播在中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)和严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)流行中起主导作用,但缺乏关于其在SARS-CoV-2大流行中的作用的大规模研究。这种传播有可能将病毒传播给最脆弱的个人,并可通过医院与社区的互动产生更广泛的影响。利用来自英国急症医院的数据,研究人员量化了院内传播,评估了可能的传播途径和与高传播风险相关的因素,并探索了更广泛的动态后果。 研究人员估计,在2020年6月至2021年3月期间,有9.5万至16.7万名住院患者在医院感染了SARS-CoV-2(占此期间所有住院人数的1%至2%)。对时间序列数据的分析表明,那些自己在医院感染SARS-CoV-2感染的患者是向其他患者传播的主要来源。向住院患者的传播增加与医院单人间较少和每张病床的加热量较低有关。此外,研究还表明,减少医院传播可以大大提高间断封锁措施在抑制社区传播方面的有效性。这些信息揭示了以前未被认识到的医院传播规模,对医院控制措施的目标有直接影响,并强调了设计装备更好的医院以限制未来高后果病原体传播的必要性。