《2月24日_上海瑞金医院开展不同人群中新型冠状病毒受体ACE2的比较遗传分析》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-02-26
  • 1.时间:2020年2月24日

    2.机构或团队:上海交通大学医学院附属瑞金医院

    3.事件概要:

    2月24日,《Cell Discovery》上发表了上海交通大学医学院附属瑞金医院的题为“Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations”的一篇通讯文章。最近的研究和分析表明ACE2可能是新型冠状病毒SARS-CoV-2的宿主受体,但文章作者ACE2在不同群体中的表达和功能遗传基础仍不清楚。

    为了系统地研究ACE2的潜在功能编码变异和群体间等位基因频率(AF)差异,文章分析了中国代谢分析项目(ChinaMAP)和1KGP(1000 Genomes Project)数据库中的ACE2基因区的1700个变异,得到了ChinaMAP、1KGP等大型基因组数据库中ACE2编码区的62个变异的等位基因频率,以及可能影响数据库中ACE2氨基酸序列的32个变异。分析数据表明,缺乏人群中冠状病毒S蛋白结合性的自然抗性突变的有力证据,低频率错义突变对S蛋白结合性的影响有待进一步研究。

    为了分析ACE2的eQTLs分布,作者使用了基因型组织表达数据库(GTEx)(https://www.gtexportal.org/home/datasets),在20个组织中发现了15个q值≤ 0.05的ACE2独特eQTL变异。通过比较发现,与欧洲人群相比,ChinaMAP和东亚人群中的15个eQTL变异具有更高的等位基因频率。最近关于亚洲和高加索人群肺组织中ACE2表达分析的报道仍有争议。文中的分析结果显示不同群体中ACE2的eQTL分布和Afs存在差异,表明了ACE2在不同群体中表达模式的多样性。此外,文中数据显示南亚和东亚eQTL的Afs存在中度差异,这表明亚洲不同群体和人种中ACE2表达可能有差异。

    综上所述,文章结果显示,没有直接证据表明在不同的群体中存在冠状病毒S蛋白结合抗性的ACE2突变。东亚群体在与组织中ACE2表达较高相关的eQTL变异中具有更高的AFs,这可能表明不同群体在相似条件下对SARS-CoV-2的敏感性或反应不同。

    4.附件:

    原文链接

    https://www.nature.com/articles/s41421-020-0147-1

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41421-020-0147-1
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  • 《2月11日_腹泻症状可能在2019年新型冠状病毒诊断中被低估》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-02-13
    • 1.时间:2020年2月11日 2.机构或团队:中山大学,广东省肝病研究重点实验室,香港中文大学,中山大学附属第三医院,河北医科大学第二医院等 3.事件概要: 科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Diarrhea may be underestimated: a missing link in 2019 novel coronavirus”,讨论了腹泻也可能是2019-nCoV感染的指标之一。 文章提到,中国武汉市报道了由2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的肺炎暴发,但是,不同的报道中临床症状有所不同。根据组间差异测试的结果,科研人员发现最近三份报告中的腹泻发生率有所不同,由于2019-nCoV利用与严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)相同的细胞进入受体ACE2,而ACE2紧密控制肠道炎症,以追踪2019-nCoV介导的感染途径,因此科研人员使用了单细胞RNA测序数据进行分析,发现ACE2 mRNA在健康的人小肠而非肺中高表达。此外,单细胞RNA测序数据显示ACE2在小肠上皮暴露于外源病原体的近端和远端肠上皮细胞中明显升高。因此,科研人员怀疑当人们食用受感染的野生动物时,表达ACE2的小肠上皮细胞可能易受2019-nCoV感染,而腹泻可能是感染的指标,这表明临床医生应在肺炎爆发期间更加重视腹泻患者。 4.附件: 原文链接: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.03.20020289v1.full.pdf