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《美国常规抗病毒耐药性检测的临床标本中HIV-1亚型的多样性》

  • 来源专题：艾滋病防治
  • 编译者： 门佩璇
  • 发布时间：2015-11-09

  • 人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）的多样性对HIV-1感染人群的诊断、治疗和管理有着重要的影响。本研究对美国1年间收集和提交进行常规HIV-1基因型耐药检测的3895例临床血浆标本的HIV-1 pol基因序列进行了回归性的分析，分析其HIV-1的基因亚型。在3895例HIV-1序列中，有207例为非B亚型（包括重组形式）。在个别州，非B亚型的比例从0变化到28.57%，其中有7个州这一比例大于10%。非B亚型感染比例最高的4个州都位于美国西部和中北部地区：明尼苏达州，11.82%；爱荷华州 15.38%；北达科塔州，25.00%；南达克达州， 28.57%。而导致目前在美国西部和北中部地区多个州间存在的HIV-1亚型的广泛多样性的原因仍有待进一步研究。

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相关报告

  • 《结核分枝杆菌北京基因型亚型的流行及与耐药性的关系研究》
    • 来源专题：结核病防治
    • 编译者：李阳
    • 发布时间：2015-11-11
    • 分子流行病学研究证实，受环境和宿主双重因素的影响，全球不同区域流行的主要结核杆菌（Mycobacterium tuberculosis，Mtb）)菌株基因型并不相同。在已发现的各种基因型中，北京基因型在全球传播的速度最快，分布也最为广泛。在我国不同地区北京基因型菌株占临床分离菌株的50%-90%。北京基因型Mtb菌株最显著的特点为基因组中差异区域RD207片段及RD105片段的缺失，且在进化过程中还会出现RDl81、RDl42和RDl50等片段的缺失。此外，IS6110插入序列的转位是北京基因型菌株的另一种进化机制。基于此，来自天津市疾病预防控制中心的研究人员通过分析Mtb北京基因型基因组NTF（noise transfer function）区插入序列IS6110，旨在揭示北京基因型在进化过程中所形成的古代株和现代株Mtb2个亚型在天津市人群中的流行情况及其与耐药表型之间的关系，其相关成果发表于《中国防痨杂志》2015年第37卷第9期。 研究人员以天津市结核病参比实验室于2012年1月至2014年2月收集的从天津市结核病患者痰标本中分离培养的816例Mtb临床分离株为分析样本，采用PCR试验分析菌株基因组中差异区域（Region of difference,RD）RD207和RD105片段是否有缺失，以鉴定是否为北京基因型；通过检测北京基因型菌株基因组NTF区中IS6110插入序列的数目，了解北京基因型菌株中古代株和现代株所占的比例，并进一步分析这两种亚型与菌株耐药表型之间的关系。其中计数资料采用卡方检验进行分析，并以P＜0.05为差异有统计学意义。 研究发现，在所分析的816例临床分离株中，764株（93.63％）为北京基因型菌株，其中110株（14.40％）为古代株，654株（85.60％）为现代株，现代株中仅有1株为北京基因型W株；药敏试验显示在古代株和现代株中，异烟肼耐药菌株分别占26.36％（29/110）和10.70％（70/654）（x2=20.47，P＜0.01），利福平耐药菌株分别占14.55％（16/110）和6.57％（43/654）（x2=8.40，P＜0.01），乙胺丁醇耐药菌株分别占8.18％（9/110）和3.21％（21/654）（x2=6.17，P＜0.05）。此外，MDR-TB患者中古代株和现代株分别占13.64％（15/110）和4.74％（31/654）（x2=13.17，P＜0.01）。 综上所述，作为北京基因型Mtb的高流行地区，天津以现代株的流行为主，但现代株的一个重要分支—W型菌株并不是主要的流行株；北京基因型Mtb古代菌株与耐利福平、异烟肼等多种抗结核药物具有显著的相关性，且在耐多药菌株中古代菌株比例要显著高于现代菌株，表明古代株与耐药结核病的关系更为密切，进而提示在天津市对抗结核药物产生耐药并不是导致北京基因型在人群中广泛传播的主要原因。
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  • 《HIV耐药检测有助于艾滋病长期有效管理》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-12-01
    • 2020年12月1日是第33个“世界艾滋病日”， 今年我国艾滋病日的宣传主题是“携手防疫抗艾、共担健康责任”。艾滋病与今年肆虐全球的新冠病毒同属病毒传染性疾病，也是人类面向未来的重要疾病挑战。 目前，随着高效联合抗反转录病毒治疗（HAART）的普及大大延长了艾滋病患者的平均寿命，使艾滋病成为可治疗、可管理的慢性疾病。与此同时，随着HIV抗病毒治疗人群的不断累积及治疗时间的延长，HIV病毒耐药性危机等重大挑战也渐露端倪。首都医科大学附属北京佑安医院感染科主任、国家卫健委艾滋病临床专家组专家张彤就艾滋病的防治给出如下建议： 四分之一感染者未检测，发现者多为中晚期 据了解，中国在1985年出现第一例艾滋病例以来，30多年间艾滋病感染病例快速增长，传播途径从最初的以吸毒共用注射器及不安全采供血为主，变为性传播、尤其是异性传播为主。目前，中国艾滋病的流行呈现总体低流行，局部高流行的特点，感染人群已从高危人群向普通人群扩散。从年龄分布来看，主要集中在20-45岁，但值得注意的是，14-20岁的年轻人和60岁以上老年人的感染人数呈现上升趋势。 “仍有很多病人没有被发现。”张彤主任说。来自国家卫健委疾病预防控制局的数据显示，截至2019年10月，全国尚有约四分之一的感染者没有检测或不知晓自身感染状况，已发现感染者中疾病晚期比例较高。 及时发现并坚持治疗，寿命可接近非感染者水平 感染HIV是否影响患者的预期寿命2017年《柳叶刀》杂志曾发表一篇研究报告，称欧洲和美国感染艾滋病毒的年轻人预期寿命增加了1０年，及时并坚持接受药物治疗的感染者预期寿命可接近非感染者。 中国自2003年启动艾滋病抗病毒治疗至今，也取得了瞩目的成绩。张彤主任提到，“越来越多的感染者开始接受治疗，真正地改善了患者的寿命和生活质量。在药品种类上采用国产与进口结合的方式，加快了国际上新药物的引进，让更多的医生和感染者对治疗有了选择。” 变异将导致药物无效，耐药检测有助于长期管理 HIV感染抗病毒治疗需要长期坚持，治疗效果有赖于患者服药的依从性。期间一旦HIV病毒发生基因突变，病毒对药物的敏感性将下降，将可能导致药物无效。 “从1987年第一个艾滋病抗病毒药物问世以来，到目前一共有30多个单体药，形成有限的联合抗病毒治疗方案。HIV病毒变异是从刚开始感染病毒就存在的，当然大多数变异病毒对药物仍然敏感，但是随着耐药病毒的不断出现，尤其是如果出现广泛耐药的病毒，将是对整个治疗体系的严重挑战。” 张彤主任表示，“耐药检测是一个很好的帮助选择抗病毒治疗方案的手段，可以更早发现潜在的耐药患者，提高治疗效果，减少耐药病毒传播。对于艾滋病长期管理非常重要。” 二代测序技术更精准，商品化试剂已进入市场 HIV病毒耐药检测通常采用基因型或者表型检测，前者因相对便捷、成本较低被世界各国广泛采纳。目前部分经济发达国家已把HIV病毒耐药检测环节调整到治疗方案制定之前。遗憾的是，国内具备相应检测能力的实验室数量颇为有限，其中具备CD4检测能力实验室896个，具备病载检测能力实验室260个，而具备基因型耐药检测能力实验室仅38个。 目前，二代基因测序技术已经在艾滋病的耐药检测中得到应用，从国外的经验看，二代测序技术能有效提升检测的敏感度，减少了人工操作（总计小于2小时）和检测周期（48小时）。“二代测序对实验室人员的要求也更高，需要对结果有很好的解读能力。北京佑安医院已经建立了这种技术。”张彤说。
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