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《门诊有症状患者唾液检测SARS-CoV-2病毒RNA面临的挑战》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2020-08-10

  • 背景：SARS-CoV-2检测亟待扩大。唾液作为鼻咽拭子（NPS）的替代品是一个很有吸引力的选择，因为唾液可以自我收集，是非侵入性的，并且样本质量不依赖于采集者的专业知识。

    目的：比较唾液和中性粒细胞配对标本中SARS-CoV-2的阳性率。

    研究设计：前瞻性收集疑似COVID-19的门诊症状患者的NPS和配对唾液样本，并用实时RT-PCR进行检测。

    结果：共有35/124例（26.6%）标本RT-PCR阳性，其中NPS阳性33/35（95%CI 81.4%-99.0%），纯唾液阳性30/35例（敏感性85.7%（95%CI 70.6%-93.7%），总符合率117/124（94.4%）。NPS的中位周期阈值显著低于唾液（p=0.0331）。三分之一或更多的来自症状患者的纯唾液样本是厚的，有丝状的，很难用吸管吸出。

    结论：实时RT-PCR检测SARS-CoV-2rna的敏感性为85.7%，与同时采集的NPS相比，敏感性为85.7%。我们的研究强调了在唾液可以用于高容量检测之前，需要优化收集和处理。

  • 原文来源：;https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1386653220303097
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    • 鼻腔和咽喉拭子样本的收集检测新型冠状病毒的存在与否SARS-CoV-2已被证明在几个方面的问题,特别是在美国拭子本身往往成为稀缺,很难获得,而卫生保健工作者经常冒着自己的健康通常在缺乏适当的防护设备。此外，抽样的困难很大程度上被归咎于高达25%的高假阴性率。 一种新的唾液检测方法已经获得美国食品和药物管理局的紧急使用许可，它将不再依赖于棉签样本，而是允许在护理点进行自我收集。这是FDA首次批准的以唾液为基础的收集方法。一项研究发现，这种方法相当于拭子样本。该方法是由罗格斯大学细胞和DNA储存库(RUCDR)的研究人员与位于盐湖城的biosampling collection specialist Spectrum Solutions LLC和位于新泽西州南普莱恩菲尔德的临床实验室精确诊断实验室(ADL)合作开发的 这种新方法有望使新型冠状病毒的检测更安全、更广泛。发起者已经与白宫covid19检测工作组进行了沟通，讨论如何通过让分销商将收集设备提供给医疗服务提供商，并让更多的实验室有资格根据这类样本进行RNA分析，从而扩大检测范围。 更安全的抽样 Spectrum公司的首席执行官斯蒂芬·范宁在接受《生物世界》采访时解释说:“这并不需要医护人员。”所以，任何人都可以直接拿到它。现在，用目前的棉签，医护人员需要在那里，他或她有可能被感染。” 他接着说:“我们保存其中液体的方法有几个作用。”“它基本上清除了病毒，但留下了RNA标记。当这些标记到达那里，它是在一个非常健壮的解决方案中，所以他们可以知道，事实上，你是否有病毒。如果医护人员打开了被送往实验室的试管，医护人员就不可能被感染，因为病毒已经在试管中死亡了。但我们能够保留的是悬浮的RNA标记，它们可以再次确定你是否有它。” Spectrum公司目前每月可以生产大约100万个唾液收集设备;该公司正在收购更多的注塑机，并计划在未来两到三周内将初始产能提高两倍甚至四倍。 大规模检测是正在制定的更安全地恢复美国经济和监测疾病流行的计划中的一个重要组成部分;一些方法需要进行大规模的常规检测，而另一些方法则侧重于接触者追踪和/或针对特定群体，如卫生保健工作者或最脆弱群体，如老年人或慢性病患者。 FDA前局长、保守派智库美国企业研究所(American Enterprise Institute)常驻研究员戈特利布(Scott Gottlieb)提出的一项计划要求美国每周至少进行75万次检测。 测试验证 唾液检测方法在一项研究中得到验证，确认唾液可以用来代替鼻咽或口咽拭子检测有症状和无症状患者的COVID-19。该测试发现，在检测一名患者的方法之间有100%的一致性。目前还不清楚这种新的唾液方法是否可以改善基于唾液样本采集过程中的不一致性，而这一过程已经受到了广泛的关注。 被称为SDNA-1000唾液收集装置的这项研究使用的是Thermo Fisher Taqpath SARS-CoV-2检测法，该检测法已经获得了FDA的紧急使用许可，可用于3月中旬的拭子样本。这是一个多重实时，PCR定性检测。罗格斯大学的实验室还使用了Perkin Elmer核酸提取技术。 “保护解决方案是一个研究的重点,以确保病毒灭活,我们能够维持和稳定敏感和特定的RNA转录QPCR分析是为了确定一个人是否有病毒,”安德鲁·布鲁克斯说,首席运营官RUCDR无限生物制剂和罗格斯大学的遗传学教授。“该设备直观易用，便于最低限度的监督，或在大多数情况下，完全的自我收集是一个巨大的进步，目前的COVID-19样品收集策略。总之，这些好处将大大增加对关键测试需求的访问。” 以家庭为基础的测试? 唾液测试除了可以在几天内快速得出结果，而且大大减少了医护人员接触唾液的机会，还为在家测试打开了大门。Spectrum公司提供了Ancestry.com使用的唾液收集管，该公司在家中进行管理。 一个主要的家庭收集筛选工作并不是没有先例的。来自威斯康星州麦迪逊的考嘉德。总部位于美国的确切科学公司(Exact Sciences Corp.)是一种基于粪便的大肠癌DNA检测方法，其基础是在家中收集的样本;它得到了广泛的采用和支付方的报销。 但covid19的任何家庭测试预计都需要FDA的额外批准才能直接面向消费者，而且至少目前，发起者关注的是在护理点广泛收集唾液的巨大挑战。 “想象一下——你把车拉上来，摇下车窗，他们给你一个收集装置，几秒钟就把唾沫吐进里面。你盖上盖子，它就会把保存液释放到瓶子里，”准确诊断实验室的首席执行官鲁本·帕特尔说。“你用一次性的酒精垫擦拭，然后把它交还给窗口的人，然后你就可以上路了。24到48小时后，你得到了你的测试结果。所有这些都可以在减少接触的同时发生，并尽最大努力减少宝贵的个人防护装备的使用。”
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